Bachelor In De Biomedische Laboratoriumtechnologie
Moleculaire diagnostiek
All documents for this subject (5)
Seller
Follow
stientuytschaever
Content preview
Soorten PCR (polymerase chain
reaction)
1. Specificiteit opdrijven via
Nested PCR
o Geconserveerde sequentie amplificeren ; reactieproducten van eerste PCR als
template gebruiken voor een tweede primerkoppel
Hot start PCR
o DNA-polymerase is pas actief na hittebehandeling (94°C)
Touch down PCR
o De annealingstemperatuur neemt telkens af doorheen de verschillende cycli
2. Andere soorten PCR
RT-PCR = reverse transcriptase PCR
o (m)RNA cDNA
o 3 primer systeem / 2 primer systeem
o Huishoudgenen / referentiegenen
Multiplex PCR
o Tegelijkertijd amplificeren van meerdere genen met meerdere primersets in 1 reactie
RFLP-PCR = restriction fragment length polymorphism
o Detecteren van SNP’s genotypering via SNP’s
AS-PCR = allel specifieke PCR
o Steeds interne controle nodig die amplicon vormt bij correct verloop van PCR
SNP array
o Onderzoek van verschillende SNP’s tegelijkertijd
3. 2 verschillende manieren om genotypering (identiteit bacterie) uit te voeren
AFLP-PCR = amplified fragment length polymorphism PCR
o Genotypering van een bacteriestam
o Restrictiedigest, adapter en PCR
o Voordeel : sequentie van PCR target moet niet gekend zijn
o Gelelektroforese (agarose of labchip)
o Genotypering van onbekende soorten en het vergelijken van soorten
RAPD = random amplified polymorphic DNA
o Willekeurige (korte) primers
o Voordeel : sequentie van PCR target moet niet gekend zijn
o Genotypering naar bacteriestam en infectiehaard
o Genotypering van onbekende soorten en het vergelijken van soorten
Methylspecifieke PCR
o Peilt naar de methylering of methyleringsgraad in een specifieke DNA-sequentie (vb:
promotor van bepaald gen)
o Epigenetische merker : komen bovenop gen, overerfbaar (vb : DNA methylering op
CpG eilanden)
o Geassocieerd met zeer dens opgewonden chromatine -> promotor inactief
o De complementaire base voor U wordt een A ipv G in de niet-gemethyleerde vorm
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller stientuytschaever. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.83. You're not tied to anything after your purchase.