In dit document is de leerstof van Moleculaire Biologie te zien per thema. Aan het eind van het document zijn overzichtstabellen te zien van alle eiwitten, mutaties en herstel mechanismen die in de cursus behandeld zijn.
Summary Molecular Biology of the Cell (5234MOBC6Y) partial exam 1+2
Notes for all lectures of cell metabolism and metabolic control
summary epigenetics and gene editing
All for this textbook (4)
Written for
Hogeschool Utrecht (HU)
Life Science & Technology
Moleculaire biologie (TLSCMOLBIO3V20)
All documents for this subject (4)
Seller
Follow
emmavandervelden79
Content preview
Samenvatting molbio
Inhoud
THEMA 1.............................................................................................................................................................2
De structuren van DNA en RNA kan onderscheiden en beschrijven...............................................................2
Primers kan ontwerpen en de zaken waar rekening mee gehouden moet worden kan uitleggen.................4
De processen en de regulatie van DNA replicatie initiatie, elongatie en terminatie kan uitleggen en de
verschillen tussen pro -en eukaryoten kan benoemen...................................................................................5
THEMA 2...........................................................................................................................................................12
Regulatie van het lac operon kan uitleggen en de toepassing hiervan in blauw-wit screening....................15
DNA bindende domeinen kan herkennen en rol in DNA binding kan uitleggen...........................................19
Epigenetische begrippen zoals histon- en DNA modificaties kan uitleggen en de rol hiervan in genexpressie
......................................................................................................................................................................19
De functie, structuur en synthese van verschillende typen (small) RNAs kent.............................................22
THEMA 3...........................................................................................................................................................27
THEMA 4...........................................................................................................................................................32
Eiwitten.............................................................................................................................................................42
Mutaties...........................................................................................................................................................44
Pre-replicatief herstel.......................................................................................................................................44
Post replicatief herstel......................................................................................................................................44
Oefentoets........................................................................................................................................................45
,THEMA 1
De structuren van DNA en RNA kan onderscheiden en beschrijven
DNA is een rechtsdraaiende complementaire
helix. DNA is opgebouwd uit nucleotides: bestaan
uit een fosfaatgroep + suikergroep + base. De ene
streng loopt van ‘3 naar ‘5, de andere streng ‘5
naar ‘3. Op het 2e koolstof atoom van DNA ligt
een H (deoxyribose). Op het 2e koolstof atoom
van RNA ligt een OH (ribose). DNA en RNA
opgebouwd van suiker pentose.
Bindingen:
Waterstofbruggen -> tussen beide strengen.
Van der Waalskracht -> tussen gestapelde base.
Hydrofobe interactie -> in de miner groove.
,Elektrostatisch -> tussen DNA en eiwitten.
Tussen C en G zitten 3 waterstofbruggen, tussen A en T zitten 2 waterstofbrug.
Purine = adenine en guanine hebben dubbele ring.
Pyrimidine = thymine cytosine en uracil hebben een enkele ring.
DNA (Deoxyribonucleïnezuur) RNA (Ribonucleïnezuur)
Dubbelstrengs Enkelstrengs
Deoxyribose (H) Ribose (OH)
Thymine (methylgroep) Uracil (geen methylgroep)
Miljoenen baseparen Duizenden baseparen
Stabiel Minder stabiel (kortlevend)
In de kern aanwezig In kern en cytoplasma aanwezig
Informatie opslag Informatieoverdracht
Zowel intronen als exonen Alleen exonen
(Belangrijk om te weten: als er bij een DNA streng niks staat, is het altijd geschreven van ‘5 naar ‘3)
Endosymbiose theorie = eukaryote cellen zijn geevolueerd door symboise met de mitochondrien en
chloroplasten want; deze hebben een eigen circulaire genoom, even groot als bacteriën, eigen ribosomen en
eigen transfer RNA.
De PCR techniek kan uitleggen en gevolgen van wijzigingen in het protocol kan uitleggen
PCR polymerase chain reaction = Het amplificeren van een specifiek stuk DNA. De benodigdheden van de
PCR zijn; DNA sample, DNA primers, vrije nucleotides (dNTP’s), DNA polymerase en een buffer.
Stap 1: Denaturatie = het verhogen van de tempratuur om dubbelstrengs DNA uit elkaar te halen. Dit wordt
gedaan op een tempratuur tussen de 90 en 100 graden. Deze stap duurt ongeveer 30 seconden.
Stap 2: Annealing = de primers binden aan het DNA. De tempratuur hangt af van de primer, tijd = ongeveer 1
min. Als de tempratuur lager is dan het optimum zullen de primers minder specifiek binden (binding kan dan
ook ergens anders plaatsvinden ipv op gewenste sequentie).
Stap 3: Elongatie = DNA polymerase bouwt de nucleotides in. De tempratuur tijdens deze stap is 72 graden.
De tijd hangt af van de hoeveelheid DNA wat gekopieerd moet worden. Bij een te korte elongatie zal er een
te klein stuk geamplificeerd zijn. In de volgende ronde kan de primer niet goed binden en wordt DNA niet
gekopieerd.
, Primers kan ontwerpen en de zaken waar rekening mee gehouden moet worden kan uitleggen
De primers die in de PCR zitten zijn gemaakt van DNA (dit is stabieler dan RNA). De combinatie van
nucleotiden van de primer bepaald bij welke tempratuur de primer bindt. De smelttempratuur Tm is de
tempratuur waarbij de primer loslaat van zijn template. De annealingstempratuur is wanneer de primers
hechten aan de template. Deze tempratuur ligt vaak ongeveer 5 graden onder de smelttempratuur.
De richtlijnen voor primers zijn:
- De lengte van de primers ligt tussen de 17-28 nucleotiden. Langer?= annealing lastiger. Korter?= minder
specifiek.
- De C-G gehalte moet 50-60% zijn. Is dit hoger dan is er een te hoge smelttempratuur, is dit lager dan is de
primer minder specifiek.
- De forward en reverse primer moeten ongeveer dezelfde smelttempratuur hebben.
- Primers moeten aan de ‘3 zijde eindigen op G of C. C/G binding heeft 3 waterstofbruggen en blijven beter
vastzitten. Aan de ‘3 zijde omdat polymerase hier begint met inbouwen.
- Er mogen niet meer dan drie C/G bindingen aan ‘3 uiteinde zitten. Als er meer zitten kan de primer
makkelijk binden aan verkeerde C/G rijke gebieden.
- Er mag geen self annealing (binden aan eigen stukje primer) of primer-dimer (primers binden aan elkaar)
vormen
De primers laten niet los van de template, ook al is tempratuur hoger dan smelttempratuur, doordat
polymerase ze op hun plek houdt.
Namen DNA strengen:
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller emmavandervelden79. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.89. You're not tied to anything after your purchase.
