Een schema met de belangrijkste begrippen van het vak biochemie aan de KUL voor de opleiding BMW. Het vak is gegeven door Prof Van Lint. In dit schema staat informatie over zowel de cursus als de colleges. Met dit schema heb ik dit vak in de eerste zit gehaald.
Glycine het enige niet geen zijketen, wat zorgt draagt weinig bij aan
asymmetrrische AZ voor grote hydrofobe interacties
conformationele
flexibiliteit
Alanine, Valine, Leucine, inerte en alifatische non polair en hydrofoob hebben geen functionele
Isoleucine en Mehtionine zijketen. Zijketens groepen
hebben de neiging te
gaan clusteren wat zorgt
voor stabilisatie
AZ met aromatische R Ze absorberen UV licht Kan worden gebruikt bij
groepen spectroscopie
Fenylanine zijring die lijkt op een zeer hydrofoob en apolair
benzeenring weinig reactief
Tyrosine Een R keten met een OH het is intermediair polair De OH brug kan
groep. Heeft een pKa deelnemen in
van 10.07 waterstofbruggen, in
enzymen en kan worden
gefosforyleerd
Tryptofaan intermediair polair door grootste zijketen komt niet veel voor in
een N in de idolring een eiwit
AZ met polaire
ongeladen R groepen
Cysteïne polair door zijn sulfhydrul kan door oxidatie Ionisatie leidt tot een
R groep, SH. pKa van disulfide bruggen sterk nucleofiele
ongeveer 8 vormen, wat bijdrage zwavelgroep die zeer
aan de 3D structuur reactief is en daarom
een rol speelt in het
katalytisch centrum van
enzymen
Serine en Theorine polair door een OH kunnen fungeren als H kunnen gefosforyleerd
groep donoren of accepteren worden wat een rol
van H-bruggen speelt in
signaaltransductie
Asparagine en de amide van relatief poliar Kunnen H doneren of
Glutamine asparaginezuur en accepteren
glutaminezuur
Proline cyclisch en matig polair de amino groep wordt in Verhoogd de kans op
een rigide conformatie een knik in de
gehouden. Hierdoor kan peptideketen door een
er geen amide groep cisconfiguratie, dit kan
deelnemen in de omdat bij Pro de
vorming van H bruggen alifatische zijring niet zo
dicht bij de andere R
groepen komt
AZ met positieve R
groepen
,Arginine en Lysine hebben beide een pKA zijn sterk positief
van ongeveer 10
Histidine heeft een imidazol R heeft als enige een pKA wanneer ongeladen
groep van rond de 7. Als Hij heeft het een N atoom
geladen is wordt het dat elektrofile is en een
geproponeerd op de andere nucleofiel, het is
tweede N en is het een dan een protonacceptor.
protondonor nucleofiliteit speelt een
rol in het katalytisch
centrum
AZ met negatieve R
groepen
Asparginezuur en hebben een geïoniseerd bij pH 7 en kunnen metalen en
glutaminezuur carboxylgroep in de zeer polair kationen cheleren
zijketens. pKa rond de 4
Suikerderivaten
Suikerzuren suikers kunnen door Bv: van glucose naar
oxidatie worden gluconzuur naar
omgezet naar glucoronzuur
overeenkomende zuren
Suikeralcohols door de reductie van er ontstaan alditos
carbonylgroepen van
aldosen en ketosen
Hoog sorbitol in het oog ontstaan van cataract bij diabetes door hoge glucose
wordt dit omgezet in
sorbitol, dit breekt traag
af en stapelt zich op en
trek water aan
Deoxysuikers suikers waarbij een of 2-deoxy-D-ribose hoort Ook in glycoproteinen en
meer hydroxygroepen bij DNA polysachariden
worden vervangen door
H
Suikeresters ribose van ATP en GTP belangrijk bij metabole
wordt op de 5’ intermediairen
gefosforyleerd
Aminosuikers bevatten een gevonden in veel oligo vormt een N-
aminogroep op de c2 en polysachrariden acetylglucosamine of N-
positie acetylgalactosamine als
de amingroepen
geacetyleerd zijn
Muramine en componenten van de glucosamine is
neuraminezuur polysachrariden in de gebonden
celmembraan
Polysachariden suikerpolymeren met verschillen onderling van ook verschillen ze in
medium tot hoog elkaar wat betreft de lengte van keten, type
moleculair gewicht. Het identiteit van bindingen en de graad
moleculair gewicht is momoscaharide units van vertakking
niet vast er is namelijk
geen matrijs
Homopolysachariden een soort monomeer
,heteropolysachariden meerdere soorten
monomeren
Opslag sachariden
Zetmeel in planten, in granules en bevat amylose, bevat amylopectine,
sterk gehydrateerd onvertakte keten zelfde keten maar
verbonden door een alfa vertolkt door een alfa 1
1 met C4 met C6 binding
Glycoggen in diercellen, zelfde structuur als Glycogeen is de
voornamelijk in de lever amylopectine, maar polymere vorm van
of in spieren. Ook in meer vertakt. Voor het glucose. Dit is in deze
granules en sterk binden is het manier opgeslagen om
gehydrateerd glucogenine eiwit nodig. osmotische barsten te
De stabielste structuur is voorkomen ook zou er
helicoidaal geen transport mogelijk
zijn
Cellulose vezelachtig, sterkte, lineair, onvertakt kan gezien worden als
wateronoplosbare molecule, zijn verbonden een keten van rigide
substantie die wordt via een beta1 met C4 pyranoseringen, vrije
gevonden in de celwand. glycosidische rotatie is mogelijk. Ook
Meeste dieren kunnen verbinding. Het is het kunnen veel ketens
dit niet afbreken, stabielst als de units 180 waterstofbruggen
termieten en herkauwers graden gedraaid zijn tov vormen wat zorgt voor
wel door middel van hun buur stabiliteit
symbiotische bacteriën
Chitine hoofdcomponent van onverteerbaar
het exoskelet
Peptidoglycans rigide component van de vormt peptide crosslinks Lysozyme dood
bacteriële celwand. Zijn wat de wand zeer sterkt bacteriën door de N
een heteropolysmeer maakt bindingen te breken en
alternerend gebonden is aanwezig in tranen. Dit
door N- is dus een belangrijke
acetylglucosamine en N- verdediging. Penicilline
acetylmuraminezuur is een antibiotica die de
synthese van crosslinks
remt, waardoor de
bacterie osmotische
lysis ondergaat
Glycosaminoglycans familie van polymeren uit altijd uit een N- Hebben een negatieve
GAG herhaalde disacharide acetylglucosamine of lading door verstering
subunits. Kunnen binden acetylgalactosamine van hydroxylgroepen op
met extracellulaire monosachraide met een het aminosuiker met een
porteinen en zo uronzuur sulfaat, zo vormt het een
proteoglycans vormen elektrostatische barrière
Chondroitinesulfaat spansterkte van onder korter dan hyaluronzuur
andere pezen
Hyaluronzuur heldere viskeuze glijmiddel in gewrichten draagt bij aan
oplossing en glasachtige spankracht in kraakbeen
substantie in oog in pezen door interactie
met andere
matrixcomponenten.
Hyaluronidase breekt glycosidische voor doordringen van de bij het binnendringen
binden bacterie in weefsel van zaadcel in buitenste
eicellaag
, Dermatansulfaat plooibaarheid van de in bloedvaten en
huid hartkleppen
Keratansulfaten geen uronzuur en vormen corner, komen voor in
variabele sulfaatinhoud kraakbeen en been hoornachtige structuren
gevormd door dode
"
cellen
=
. Heparine natuurlijk anticoagulans remt de bloedstolling heeft de hoogste
;
geproduceerd in door binding aan negatieve
mastcellen antitrombine III ladingsdensiteit van alle
biomoleculen
Glycoconjugaten verbindingen uit
suikerpolymeren
enerzijds en eiwitten of
lipiden anderzijds
Proteoglycans macromoleculen in de bestaan uit een core GAG is het dominerende
plasmamembraan of proteïne met daaraan deel van het molecule en
ECM. Een GAG wordt vastgehechte GAG’s, zorgt voor de grootste
gekoppeld aan een vaak via een serine fractie van de massa en
membraaneiwiit of bepaald zo de activiteit.
gesecreteerd eiwit Meestal door het creëren
van bindingen voor oa
water
Aggrecans proteoglycanaggregaat meerder core proteïnen Het core eiwit heeft
allemaal gebonden aan meerder ketens van
een molecule chondroitinesulfaat en
hyaluronzuur keratansulfaat wat
bijdragen aan
spankracht in weefsel
Syndecan een proteoglycan heeft drie zorgt voor interactie met
intergraal herparinesulfaat ketens andere
membraaneiwit en twee membraaneiwitten
chrondroitinesulfaatkete
ns
Glycoproteinen koolhydraatrijk eiwitten in alle mogelijke Het koolhydraatgedeelte
waarbij het functionele klassen van is ofwel O linked (ser en
koolhydraatgedeelte eiwitten thr) of N linked (asn). De
kleiner en structuur ingeplante suiker zijn
diverse zijn dan de GAG vertakt en complex qua
van proteolglycanen samenstelling en
bevatten hexosen,
acetylhexosamines, N-
acetylgalactosamine,
methylpentosen en
siaalzuren.
Suikertakken in voor modulatie van beïnvloeden van beïnvloeden
glycoproteinen fysicochemische pretolytische processen intracellulaire
eigenschappen, van precursoreiwitten, reisaspecten,
bescherming tegen beïnvloeden biologische embryonale ontwikkelen
proteolyse activiteit en metastasering
Glycolipiden lipiden met covalente
oligosacharidegroepen
Gangliosiden membraanlipiden in voorbeeld is zijn de
eukaryote cellen bloedgroepantigenen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller isabellekok1. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.98. You're not tied to anything after your purchase.
