Summary
Samenvatting Biomedische Beeldvorming - Mircoscopie
- Course
- Institution
Les notities microscopie, bijhorend bij de Powerpoints 14/20 behaald op examen
[Show more]
Seller
Follow
emmamentens
Reviews received
Content preview
Biomedische beeldvormingLes 1: difractie en reflectie belangrijk, toegepast op convexe lens en berekeningen. Verwacht dat we
dit gaan kunnen toepassen (de berekeningen)
Les 2: eigenschappen van fluorochromen, en toegepast op fluorescentie microscoop, de anatomie
van deze microscoop kennen en de lenzen en waar deze zich bevinden. Weten welke moleculen je
kunt labelen en op welke manier
Les 3: functionele energie, dynamiek en interactie van moleculen gevisualiseerd. Frab, frib om
dynamiek te gaan kwantificeren. Nooit de acroniemen kennen, wel weten wat de technieken
omhelst. Technieken die we niet gezien hebben niet kennen. Fret interactie
Les 4: interessantste. Hoe kunnen we meer doorvoer verwerven met microscopie. Veel verschillende
stalen tegelijk bekijken door multi well plaat. Multi plexen van fluorochromen verschillende
kleuren tegelijk kunnen gaan waarnemen. Beeldanalyse speelt hier allemaal belangrijke rol in
Les 5: weten hoe kleuringen werken, wat de stappen zijn. Protocol kunnen lezen en begrijpen en de
fouten kunnen spotten meer toegepaste les
Les 6: confocale microscopie, hoe we 3D kunnen gaan doen. Difractie limiet. Point spread function &
patroon goed kennen examenvraag! superresolutie technieken. Weten hoe de technieken werken en
de bijhorende formules
Les 7: de barrières voor grote stalen. Als de stalen volledig transparant zijn dan moeilijk om confocale
microscoop te gebruiken light chain microscopie komt dan in de picture. Je geraakt er niet dieper
mee maar minder fotobreking…. Alleen maar voordelen heeft het
Les 8: wat kunnen we doen om nog fijnere resolutie te bekomen. Eigenschappen van elektronen en
hoe benutten in microscopie, hoe die afgebogen worden, hoe microscoop eruit ziet en hoe die
elementen gaan samenwerken weten. Welke elektronen we gaan uitlezen (bv secundaire, back-
scatter…) force curve analyseren
Les 9: basis principes van beeld analyse eigenschappen van beeld op camera. Weten wat een punt
en buurt operatie is en wat belangrijk is (concept convolutie bij buurt en kernel! Weten wat die
kernel met het beeld zal doen verscherping, verzachting, verschuiving?
weten wat een segmentatie is,…
Practica zijn zeer belangrijk want toepassing op de theorie
Zowel vragen uit theorie en practica welke microscoop te kiezen voor welk doel en weten hoe dan
aan de slag te gaan met het preparaat. Hoe gaan we aan de slag met het preparaat.
Bv als ik dit wil visualiseren, wat moet ik dan doen en welke microscoop zou ik dan moeten kiezen?
Voorbeeldvragen examen
Hoofdstuk 1
o Lens theorie
o Tekening met brandpuntsafstand (geen examenvraag want te makkelijk)
o de optische resolutie van een objectief kan hij vragen
, gewoon dan weten waar de numerieke appertuur staat
hoofdstuk 2
o alle eigenschappen van fluorescentie kunnen korte termen zijn
bv wat is de stoke shift (verschil tussen max emissie en max excitatie
golflengte van een fluorochroom)
wat is een dichroische spiegel
o hoe een confocale microscoop werkt
waar staat de pinhole
wat voordeel en nadeel is van spinning disc microscoop!!! Vraag
bv we hebben een bepaald staal: zou je spinning disc of ligth chain
microscoop gebruiken?
Belangrijkste argument om spinning disc boven light chain te
gebruiken is : helpt om snellere biologische processen in beeld te
brengen
Dynamics hoofdstuk
o Wat zijn bv de problemen om levende cellen te visualiseren, wat belemmert je?
Vierhoek van compromise
Viability belemmerd ons
Welke technieke gebruiken om te kunnen verminderen
o Bv een opname van een frab experiment en dit is de output
Wat kunnen we zeggen over het proteïne
Of een curve en daaruit wat kunnen we zeggen uit proteine
o Meerkeuze vraag met eigenschappen die nodig zijn om efficiente fret te hebben
Förster resonance transfer dia (zijn er 3)
high thrgouput
o wat is bleed through?
o Hoe kan spectrale detector werken
o Wat is spectrale deconvolutie?
Is niet zelfde als deconvolutie
o Waar kan rgb voordeel in zijn
Alle kleuren maar heeft geen moleculaire resolutie
o Life-time kunnen gebruiken
Les 5
o Verschil tussen new field en far field
o Technieken kennen
o PSF sculping techniek
Kan leiden tot oneindige verfijning van de point spread function
Formule begrijpen
Hoe meer fotonen, hoe accurater als je de 2 formules kunt begrijpen dan
snap je hele techniek
Tissue imaging
o Weten wat de limieten zijn
o Concept van multi foton microscopie
Ruimtelijke door de trechter
, Volledige belichting maar alleen maar in confocaal vlak komen alle fotonen
samen?
De hele kegel die je normaal belicht wordt niet meer belicht en je hebt alleen
maar excitatie in het confocaal vlak
Je hebt geen pinhole meer nodig
Je kan veel dieper
veel voordelen van multifoton
Maar geraken maar tot bepaalde diepte en dan klaring
o Gewoon principe van klaring weten
o Light sheed
Minpunten verlies kwaliteit en artefacten
Les 7
o Verschillende manieren 3D
o Eerste dia’s niet gezien wat die zei
o Over CLEM niet teveel weten
o Atomic force enkel weten voor en nadelen en interactie (kijk uitleg hieronder)
weten goe een CCD camera werkt, en EM
belangrijk over beeld eigenschappen
o als we een digitaal beeld willen moeten we gaan samplen
o als je een bepaalde resolutie wilt gaan weergeven moet je het minstens 2 keer gaan
samples = ? criterium
o bv wat moet de beeld resolutie zijn? niet de optische resolutie (optic vs imaging
properties
lookup tabel
o punt operatie
o ook histogram operaties (point operations)
o buurt operaties werken met kernels
Voorbeeld meerkeuzevraag
Welke stelling over multifoton is fout?
o Er is geen pinhole nodig om confocaal beeld te bekomen = juist
o Rood-verschoven licht (tov groen) is minder vatbaar voor breking en absorptie = juist
o Licht van een hogere golflengte kan mits de juiste condities dezelfde excitatie
bewerkstelligen als licht van een kleinere golflengte = juist
Als je 2 fotonen van licht achter elkaar instuurt, snel genoeg, dan kan je
dezelfde excitatie bekomen
2 fotonen van 800nm kunnen zelfde excitatie veroorzaken als 1 van 400nm
als je ze snel genoeg achter elkaar instuurt
o Er is weinig tot geen absorptie buiten het focusvlak = juist
Enkel in het focaal vlak liggen de fotonen dicht genoeg bij elkaar om een
excitatie te bewerkstelligen
Er is geen absorptie want het fluorochroom is er niet gevoelig voor
o Er is minder scattering van het emissielicht = fout
, De emissie is hetzelfde
Groen licht is uitgezonden en is even vatbaar voor breking als we dieper
zitten
Het is hetzelfde licht
er is gewoon evenveel scattering
Atomic force microscopie
Is een minuscuul fijne naald die aan een veertje vasthangt
En dat veertje zoekt toenadering naar het staal
Als de force groter is dan 0, dan is het een afstotende kracht
o Kleiner dan 0 een aantrekkende kracht
Als we veertje dichter tegen staal brengen
o Net voor staal aangeraakt wordt zal er een adhesie kracht ontstaan die aanzuiging
veroorzaakt
o Vanaf dat het raakt afstoting van het staal
De repulsie gaat gradueel terug afnemen
o Als he tipje meer terug naar boven gaat komen krijgen we opnieuw adhesie
27/09
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller emmamentens. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.93. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
79373 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now