Summary
Samenvatting Onderzoeksmethoden Thema 1 Chemicaliën lijst
- Course
- Institution
Alle chemicaliën die je moet weten voor het tentamen staan in deze lijst/tabel overzichtelijk weergegeven.
[Show more]
Seller
Follow
fleurheling
Reviews received
Content preview
Chemicaliën lijstVIRULENTIE
KAPSELDETECTIE
Oost-Indische inkt Kleurt de omgeving van de cellen.
Methanol Methanol vangt watermoleculen weg, waardoor
eiwitten denatureren. Hierdoor wordt het
preparaat gefixeerd, want er vinden geen
biologische processen meer plaats.
Kristalviolet Kleurt de cellen.
KATALASE ASSAY
(3%) Waterstofperoxide (H2O2) Doodt bacteriën en andere pathogenen. Het is
een schadelijke stof die kan worden omgezet naar
water en zuurstof door het enzym katalase. Deze
stof is nodig bij de katalase-assay om te kijken of
de bacteriën katalase kunnen uitscheiden.
IDENTIFICATIE VAN MO
GRAM-KLEURING
Kristalviolet Kleurstof die wordt opgenomen door bacteriën.
Kleurt de peptidoglycaanlaag in de bacteriële ce
lwand.
Jodiumoplossing Vormt een complex met kristalviolet door middel
van elektrostatische interactie, hierdoor wordt
het kristalviolet gefixeerd in de celwand.
Ontkleuringsvloeistof (70% ethanol) Spoelt de kristalvioletkleuring weg bij de
gramnegatieve bacteriën. De dikkere
peptidoglycaanlaag bij grampositieve bacteriën is
moeilijker te doordringen voor ethanol. En
verhindert daarmee de ontkleuring. Daardoor
hebben deze bacteriën een blauw/paarse kleur
onder de microscoop.
Oplossing van fuchsine in water Kleurstof die de ontkleurde gramnegatieve
bacteriën een roze/rode kleur geeft, waardoor ze
zichtbaar zijn onder de microscoop.
DNA-PLASMIDE ISOLATIE
Oplossing I 0.9% glucose Glucose buffert bij pH net boven de 12. Verder
zorgt glucose voor een isotone oplossing,
waardoor de cellen niet te vroeg lyseren.
23 mM Tris/HCl pH 8.0 Tris/HCl buffert bij een pH van 8, optimale
zuurgraad omgeving bacteriën.
10 mM EDTA Is een gelator: vangt covalente kationen weg. In
dit geval wordt Mg2+ (cofactor DNAase)
weggevangen. EDTA maakt DNAse onschadelijk.
Oplossing II 0.12 M NaOH Accepteert protonen uit de celwand waardoor de
celwand toegankelijker wordt. Hierdoor kan SDS
makkelijker bij het celmembraan. Hierdoor vindt
lysatie beter plaats.
1% SDS Een zeep die de eiwitten denatureert door het
verbreken van niet-covalente verbindingen.
, Oplossing III 3 M KAc Kaliumacetaat bindt aan de DS- die zich op de
eiwitbackbone bevinden. Hierdoor worden de
eiwitten onoplosbaar en slaan ze neer. Acetaat
buffert rond pH 4.75 waardoor het DNA niet
beschadigd en de pH niet te laag wordt.
11.5% azijnzuur Verzuurt de oplossing waardoor het DNA
hybridiseert (enkele strengen binden).
Oplossing IV Fenol Denatureert eiwitten doordat het zeer apolair is.
De binnenzijde van de meeste eiwitten is apolair
en apolair lost op in apolair. Wanneer fenol wordt
toegevoegd keren de eiwitten binnenste buiten
zodat de apolaire binnenkant kan oplossen in de
apolaire fenol. Fenol lost ook eventuele
hydrofobe lipiden op.
Chlorofoom Fenol met de gedenatureerde eiwitten lost hierin
op. Chlorofoom heeft een hogere dichtheid dan
water, waardoor na vortexen een organische fase
(beneden) en waterige fase (boven) ontstaat.
Oplossing V 10 mM Tris/HCl pH 8.0 Tris/HCl buffert bij een pH van 8, optimale
zuurgraad omgeving bacteriën. Voorkomt het
kapotgaan van DNA door te veel protonen/OH.
0.1 mM EDTA EDTA voorkomt weer de afbraak van DNA door
het wegvangen van de co-factor.
20 µg/ml RNAase Breekt verontreinigd RNA af.
96% ethanol Hiermee wordt fenol/chloroform uit de oplossing
gewassen. Door de toevoeging van ethanol slaat
het DNA neer waarbij de strengen intact blijven.
Fenol/chloroform lost op in ethanol samen met
eventuele andere apolaire stoffen.
70% ethanol Hierin lost de pellet niet in, maar eventuele
zouten wel. Zo worden zouten dus uit het
monster gehaald.
Agarose Polysacharide waarvan gel wordt gemaakt voor
het runnen van een gelelektroforese.
TBE Tris/Boraat/EDTA functioneert als buffer in de
agarose gelelektroforese. Tris is een base en
boraat is een zuur. Samen zorgen ze voor het
behouden van de pH tussen 8.0 en 8.5. EDTA
vangt magnesium weg, de cofactor van DNAase,
zodat DNA niet wordt afgebroken.
Ethidiumbromide Een fenantridide kleurstof die wordt gebruikt om
DNA/RNA aan te tonen. Ethidiumbromide heeft
een vlakker structuur en kan daardoor tussen de
basen van het DNA/RNA gaan liggen. Bij
gelelektroforese wordt het onder een UV-lamp
zichtbaar.
Orange-G loading dye Bevat orange G, glycerol, TRIS-HCl en EDTA. Deze
stof loopt net zoals DNA door de gel heen
waardoor dit een indicator is van of het proces al
afgelopen is. Daarnaast verhoogd glycerol de
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller fleurheling. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.03. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
85443 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now