Summary
Samenvatting hoofdstuk 3 - deel biochemie - chemie en inleiding tot biochemische processen
- Course
- Institution
Samenvatting van hoofdstuk 3 deel inleiding tot biochemische processen
[Show more]
Seller
Follow
anneleenverhaeghe
Reviews received
Content preview
H3: EIWITTEN VN STRUCTUUR NR FUNCTIE VIAOPVOUWING EN COMPLEXVORMING
3.1. INLEIDEND OVERZICHT: VN BOUWSTENEN NR FUNCTIONELE
BIOMOLECULE
Functioneel eiwit: functie ~ structuur
eiwit
- unieke primaire structuur
o ppk met spec lengte en volgorde vn AZ
- macromoleculen & biopolymeren
- bouwstenen (20 ᾳ-AZ) via peptidenbindingen cov op mekaar gekoppeld =>
peptide
opgevouwen eiwit
- sec en tert structuur (≠ niveaus en complexiteit onderscheiden)
correcte opvouwen eiwit associëren/in interactie gaan/stabiele complex vormen met
andere/identieke eiwitten
- quaternaire structuur
3.2. PRIMAIRE STUCTUUR VN EIWIT
UNIEKE AMINOZUURSEQUENTIE VN EIWIT
Proteïne/eiwit
= unieke genetisch bpld AZseq
- Synthese dr ribosomen: peptidebindingen (= cov) tss AZ
- Spec volgorde bpld dr genetische code (eiwit = vertaling vn info in gen)
o Prim structuur bevat alle info vr functioneel eiwitten DUS bplt finale
tertiaire/3D-structuur
- Verschillen vn elke eiwit in samenstelling (= # vn elk AZ) en in lengte (= # AZ)
(Insuline = 1ste eiwitseq die men heeft kunnen achterhalen)
Opvouwing wordt grotendeels gebaseerd op:
Zwakke krachten tss -NH en -CO vn peptide binding = sec structuur
Zwakke kracht tss functionele groepen op zijketens = tert structuur
GROOTTE & SAMENSTELLING VN NATUURLIJK VOORKOMENDE EIWITTEN
Grootte:
gem tss 100-1000 AZ in eiwit
- Min 40-100 AZ nodig vr opvouwen tot stabiele 3D-structuur
- meer dan 1000 AZ = meer kans op fouten & kost meer tijd (natuur: zo efficiënt
mogelijk werken)
, - Titine = ‘giant protein’ = >27 000 AZ
o in spieren en doet spier uittrekken en daarna terug relaxeren
Samenstelling:
Meest voorkomende = Leu, Ala, Gly, Val, Ser, Glu
Zeldzaam = Met (vaak 1ste AZ),
Trp (aromatische keten => groot en niet overal in eiwit past)
Cys (2 knn samen S-brug vormen)
=> hebben spec eig
AZ in pkk hebben een … :
meer een functionele rol:
o wnr AZ die met hun chem vinger op contactopp zijn, niet meer aanw zijn
Meer een structurele rol:
o apolaire zijketens wijzen nr binnen/nr centrum vn ppk
o polaire zijketens zullen aan opp voorkomen
3.3. SECUNDAIRE STRUCTUUR
= lokale opvouwing / lokale ruimtelijke organisatie in ppk
- dr zwakke/niet-cov krachten !!
BEPERKTE ROTATIES ROND COV BINDINGEN VN POLYPEPTIDERUGGENGRAAT
niet willekeurig, niet alles is mogelijk:
1.BEPERKING VN ROTATIES ROND 3 COV BINDINGEN IN PPKRUGGENGRAAT
- rond cov bind tss N en Cᾳ = ϕ phi
o => 2 draaiingen mogelijk:
Transconfiguratie vn R-groepen
ω = 180° (= rotatiehoek)
R-groepen ver vn mekaar => niet in mekaars weg
hoe volumineuzer R, hoe groter beperking in rotatie
Cisconfiguratie vn R-groepen
ω = 0°
R-groepen staan in mekaars weg
sterische hinder!! hoger dus minder E gunstig (alleen
proline min verschil)
! behalve vr proline kan dit niet
<= die staat al in hoek (dr aromatische keten)
in cis of trans => maakt niet uit, allebei sterische hinder
- rond cov bind tss Cᾳ en CO = ψ psi
- rond cov bind tss CO en NH = ω omega (=eig peptidebinding)
o beperking dr resonantie
(= elektronendelokalisatie: e- verspringen over O, C en N)
=> peptidebinding krijgt partieel dubbelingskarakter
Welke waarden mogelijk voor de hoeken?
- ω-hoek = 180°: ligt vast <= willen alleen in trans staan
- ϕ en ψ, rotatie mogelijk: hoeken knn veranderen vn waarde <= vlakken vn AZ tov
mekaar knn bewegen
o waarde afh vn rotatiehoeken vn dihedrale hoek
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller anneleenverhaeghe. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.01. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
56326 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now