Summary
Samenvatting Plantenontwikkeling en Omgeving tentamen 1 & 2
- Course
- Institution
In deze samenvatting staan aantekening van alle hoorcolleges gedurende de hele cursus, voor beide tentamens.
[Show more]
Seller
Follow
mbleeker
Reviews received
Content preview
Plant Development and EnvironmentShade Avoidance
Leerdoelen:
1. Begrijpen hoe planten buurplanten detecteren
Planten detecteren buurplanten door de lage R:FR verhouding waar te nemen.
Planten hebben verschillende receptoreiwitten waarmee ze verschillende spectra kunnen
waarnemen.
- Cryptochromen: (de hoeveelheid) blauw licht
- Fytochromen: de verhouding tussen rood en verrood licht
2. Begrijpen wat shade avoidance is en hoe het adaptief is voor planten
De kenmerken van Shade Avoidance Syndrome:
- Hyponasty (toegenomen kanteling van de bladeren)
- Strekking van de plant door versnelde groei aan de onderkant van de plant,
gereguleerd door ethyleen (komt ook voor in geval van overstroming)
- Petiool en hypocotyl elongatie
- Reallocatie van de fotosynthetische machinery
Effecten van dichte plant gemeenschappen op groei:
- Verminderde accumulatie van biomassa per plant
- Dominantie en suppressie
3. Beschrijven van de basis fotobiologische karakteristieken van fytochroom
Langgerekte bladeren ontstaan bij fytochroom (B) mutanten, een continue SAS respons.
Wanneer meer fytochromen worden uitgeschakeld, verandert de rosette in een stengel.
, - Fytochroom is onderdrukker van SA, deze moet geïnactiveerd worden d.m.v.
verrood licht of mutaties om SA fenotype te krijgen.
Pr is de inactieve vorm die geactiveerd kan worden door verrood licht. Pfr is de actieve
vorm die kan worden geïnactiveerd door rood licht.
4. Uitleggen hoe fytochromen gen transcriptie reguleren via PIFs (Phytochrome
Interacting Factors.
Bij een hoge R:rR verhouding is er een actief fytochroom. De actieve vorm beweegt zich
richting de nucleus en bindt daar aan de phyb en phya binding domains van de PIFs.
Hierdoor worden de PIFs gefosforyleerd. Vervolgens wordt het complex herkend en
afgebroken door 26S proteasoom. Hierdoor vindt er geen binding plaats aan de E-BOX en
worden er geen shade induced genen afgeschreven.
PIF4 en PIF5 reguleren de laag R:FR respons. PIF7 heeft eenzelfde functie maar is een
sterkere regulator.
- PIF7 reguleert auxine transcriptioneel (biosynthese, transport etc.) en zorgt zo voor
de toegenomen groei in schaduw omstandigheden
Bij hoog R:FR gaat actief fytochroom niet naar celkern, inactieve vorm zit erin. PIFs zijn
ongebonden, accumuleren en kunnen binden aan een G-BOX (of E-BOX) motief waardoor
de shade induced genen afgeschreven worden, wat resulteert in SAS.
PIN3 stimuleert de lage R-FR respons in zaailingen, speelt een rol in de transport van
auxine.
Mogelijke andere signalen:
- Aanraking
- Weinig groen licht
- Weinig blauw licht
- Laag PAR (totale lichtintensiteit)
, PIF protein control of shade avoidance
Leerdoelen:
1. Begrijp hoe PIFs en hun activiteit worden gereguleerd
PIF4, PIF5 en PIF7 zijn de main PIFs betrokken bij SAS responses. PIFs interacteren met
PHYs via specifieke domeinen: APB (phyBfr), APA (phyAfr) en bHLH (DNA-bindend).
PIFs staan aan het begin van een auxine pathway die resulteert in planten groei.
PIF5 accumuleert bij laag R:FR (schaduw) , maar niet bij hoog R:FR.
- Te onderzoeken door middel van een Western Blot
- PIF5 heeft een APB maar geen APA, wat betekent dat het kan interacteren met
phyB
PIFS zijn fosfoproteïnen, wat inhoudt dat ze ge(de)fosforyleert kunnen worden.
PIF7 is gedefosforyleerd bij laag R:FR, het is meer stabiel dan PIF4 en PIF5.
- Schaduw induceert de nucleaire lokalisatie van (een deel van) PIF7
- 14-3-3 eiwitten vertragen de schaduw-geïnduceerde nucleaire translocatie en
defosforylatie van PIF7
2. Leg uit wat voor soorten PIF interactors er zijn
3. Omschrijf hoe PIF interactor PIF activiteit coreguleren
DELLA is in staat aan PIF te binden en activatie te remmen. GA (groeistimulator) heft dit op
en promoot zo PIF functie. DELLA is essentieel voor SA maar niet voldoende voor inductie.
PIF regulatoren:
- phy, Pfr: eiwit stabilisatie en inhibitie van DNA binding
- HLHs, DELLAs: inhibitie van PIF binding aan DNA door de binding site te bezetten
- HY5: inhibitie van PIF activiteit
- BZR1, FHY1, HDA15: transcriptionele co-regulatie met PIFs
PIL1, HFR1 en ATHB2 zijn shaduw-marker genen, aangezien deze altijd opgereguleerd zijn
in de schaduw.
- HFR1 heeft een HLH domein, die ervoor zorgt dat PIFs niet aan G-boxen binden
- Dit is een negatieve regulator, opgereguleerd door een laag R:FR
(schaduw)
4. Beschrijf de BAP/D module
BZR1, ARF6 and PIF4 reguleren positief hypocotyl elongatie.
- ARFs worden gereguleerd door auxine
- Bij een laag auxine gehalte wordt de ARF functie geïnhibeerd
- BZR1 & PIF4 promoten ARF6 DNA binding
- Brassinosteroïden (BR) functioneren slecht in de afwezigheid van ARFs
- De combinatie van de drie is nodig voor optimaal functioneren
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller mbleeker. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $10.73. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
50064 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now