Summary
Samenvatting biochemie
- Course
- Institution
volledige samenvatting biochemie van Johan van Lint. Met deze samenvatting ben ik in de 1ste zit direct geslaagd.
[Show more]
Seller
Follow
jaravandiepenbeek
Content preview
Biochemie: biomoleculen‘3 dimensionale wetenschap’
• Vb. R-thalomide en S-thalomide: stereoisomeren die dezelfde chemische eig. hebben
maar in cel andere eig. vertonen
• S: softenon (zwangerschap: kinderen met aandoeningen)
• R of S bindt op bepaalde passende stof en reageren zo anders: 3D en functie hangt
nauw samen
Aminozuren (amine+ zuur groep) : algemene structuur en optische eigenschappen
• aanduiding:
o Grieks: start vanaf centrale C (amino en
carboxylgroep)
o Cijfers: start vanaf C met carboxylgroep
• Enkel L- aminoz. In ons lichaam; bacteriën hebben
ook D vorm die ze gebruiken voor peptide (korte stukjes AZ)
Indeling AZ volgens eig. van zijketen (R-groep)
,Glycine
• niet asymm.: centrale C heeft geen 4 verschillende groepen rond zich
• Grotere conformationele flexibiliteit: eiwt met configuratie waarbij
bepaalde delen flexibeler zijn dan andere; rotatie om as mogelijk door
weinig sterische hinder (H)
Nonpolaire AZ met alifatische zijketens
• Inert (alifatisch)
• Nonpolair en hydrofoob
• Geen functionele groepen
• Zijketens klusteren samen: belangrijk voor vorming eiwitten (lineair naar 3D)
Extra asymm. centrum
Alanine:
• In vitro mutagenesis: codon van AZ wordt
verandert door code van alanine omdat dit het
equivalent is van AZ waarbij een keten is afgeknipt
(afknippen van AZ is in praktijk onmogelijk)
• niet mogelijk bij glycine: je induceert conf. Flex.
Waardoor het effect groter wordt (je wilt klein effect op
een bepaalde plaats)
AZ met aromatische R-groepen
• zeer hydrofoob, apolair, weinig reactief
• OH: intermediair polair, deelname aan H-bruggen
• Functionele groep in enzymen
• Fosforylatieplaats: na aanmaak gaan eiwitten veel
modificaties ondergaan
• Intermediair polair (door N)
• Zeldzaam tov andere AZ
,Concentratie van eiwitten bepalen
• licht door monochromator waaruit licht met 1
bepaalde golflengte komt; gaat door buis met
gekende concentratie; licht met kleinere
intensiteit wordt gemeten; absorbantie meten
voor bepaling concentratie
AZ met polaire ongeladen R-groepen:
• SH: sulfidehydriel groep dus polair (pka=8)
• Vormt cystine door oxidatie: 2 aan elkaar gebonden cysteine door een
disulfidebrug (disulfidebruggen worden ook gebruikt bij het vouwen van
eiwitten in 3D)
• Belangrijke groep in het katalytisch centrum van enzym (= eiwit met eiwit
opp. + katalytisch centrum)
• OH: polair, kunnen worden gefosforyleerd, H-bruggen
• Amiden
• Polair
• H-brugvorming
• cyclisch, gematigd polair
• Rigide (door ring): kan niet roteren
• Geen H op N: geen H-bruggen
‘knikvorming’ ter hoogte van prolines in peptideketen
• transconfiguratie is hier het gunstigst: door bocht
bij cis is het waarschijnlijk dat zijketen botsen (sterische
hinder!)
• Cis kan hier wel: zijketen ongeveer even ver uit elkaar
als bij trans
, AZ met positief geladen R-groepen
Primair amine guanidinogroep
Beide pka=10
Histidine
• veelzijdige zijgroep: veel enzymen maken hier gebruik van om reactie te
bespoedigen
• Pka=7: dus 50/50 geladen en ongeladen
• Imidazol
• zeer nucleofiel: acceptor H brug
• Zeer elektrofiel: donor H brug
AZ met negatief geladen R-groepen
• Volledig geinoniseerd op pH=7: D= 3.65 en
E=4.25
• Zeer polair en kunnen metalen en kationen
cheleren
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller jaravandiepenbeek. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $11.77. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
48756 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now