100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Previously searched by you
Previously searched by you
logo
Samenvatting Week 6 Genoombiologie $5.01
Add to cart
Quickly navigate to
Preview
  2.  
  3. Universiteit Utrecht (UU)
  4.  
  5. Genoombiologie (B3GENB09)

Summary

Samenvatting Week 6 Genoombiologie
 0 purchase
  • Course
  • Genoombiologie (B3GENB09)
  • Institution
  • Universiteit Utrecht (UU)

Dit document een samenvatting van week 6 van Genoombiologie. Dit betekent dat de kennisclips zijn uitgewerkt met bijbehorende afbeeldingen. Ook worden andere besproken aspecten vermeld in deze samenvatting. Zo heb je een goed overzicht van wat er deze week is besproken!

Preview 1 out of 4  pages

Document information

  • October 23, 2023
  • 4
  • 2022/2023
  • Summary

Subjects

  • genoombiologie
  • genoom
  • genetica
  • dna
  • rna
  • mrna

Written for

  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Biologie
  • Genoombiologie (B3GENB09)
All documents for this subject (20)

Seller

avatar-seller
wannabedoctor

Reviews received

Content preview

COMPARATIVE GENOMICS
WEEK 6


Het maakt niet uit wat je biologische vraag is, het principe is altijd hetzelfde en dat is het in
een sequencer gooien (zolang dat kan). Hieruit komt een hele lading aan sequenties en
uiteindelijk moet er een genoom geassembleerd worden. Hiermee kunnen functies voorspeld
worden over de organismen waar naar gekeken wil worden.
De vele nieuwe genomen die gesequenced zijn, zijn van fundamenteel belang bij veel
relevante organisme (fundamenteel en praktisch belang) maar ook op het moment dat de
moleculaire biologie nog niet bekent is, en deze ook lastig tot helemaal niet verkregen kan
worden.
Wanneer er een genoom sequentie beschikbaar is, kan hier veel van geleerd worden:
- Zo kan er bijvoorbeeld gene prediction / annotation gedaan worden, zodat er
bepaald kan worden waar op het genoom er genen bevinden;
- De functie en karaktereigenschappen van eiwitten kunnen bepaald worden;
- Er kan een voorspelling gedaan worden over andere features (zoals van non protein
coding genes);
- De evolutie kan bestudeerd worden.
Een verbindende factor tussen al deze losstaande dingen, is dat de belangrijkste tool om het
te onderzoeken is comparative genomics, dus het vergelijken met een genoom dat we al
kennen. En comparative genomics is ook belangrijk op het moment dat er onderzoeken
gedaan worden in diermodellen terwijl dit in de mens bepaald moest worden. Er wordt dan
bepaald welk gen in de mens hetzelfde is als het gen in een dier.
Het andere wat we nog met een genoom kunnen doen, is het gebruiken als een
platform/resource om genomic biology te doen (creëren van systematische knockouts, het
design van micro-assays, chip-seq, reads mappen, map variaties in populaties, CripsR, etc.).
Het belang van een genoom is dus niet de sequentie zelf (wel grootste doel nu), maar op
een genoom kan ook alles geprojecteerd worden en kunnen allerlei nieuwe technieken
gedacht worden om dingen te onderzoeken.




Als twee genomen met elkaar vergeleken worden, dan worden vaak bepaalde plaatjes (zie
afbeelding) getekend. De blauwe lijnen zijn elementen van hoge similariteit, vaak zijn dit dan
genen. En in de afbeelding is dus ook te zien dat de genen nog op dezelfde volgorde liggen,
en dit wordt co-lineair genoemd.
Een manier om hier naar te kijken zijn dotplots. Op
de x-as wordt de gen volgorde van het ene genoom
gezet, en op de y-as wordt de gen volgorde van het
andere genoom gezet. En op de plekken waar de
genen met elkaar overeen komen, wordt er een “dot”
geplaatst.

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller wannabedoctor. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $5.01. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

68175 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$5.01
  • (0)
Add to cart
Added