Alle behandelde stof uit het twaalfde en dertiende hoorcollege van het vak 'Cellen'.
Eiwitten worden tot in detail behandeld, onder andere conformatieveranderingen en de invloed van omgevingsfactoren komen aan bod.
Gegeven op de opleiding Biomedische Wetenschappen aan Universiteit Utrecht.
Summary cell biology part of From Molecule to Mind course in master Neurosciences VU
lomoarcpsd|18743735 complete test bank: Essential Cell Biology, 4th Edition 4th Edition By Bruce Alberts (Author) Graded A+ Latest Update
All for this textbook (13)
Written for
Universiteit Utrecht (UU)
Biomedische Wetenschappen
Cellen
All documents for this subject (85)
Seller
Follow
SemBMW
Content preview
XXX
Hoorcollege 12 & 13: Eiwitten
Eiwitten worden gepolymeriseerd; bestaat uit een reeks aminozuren die gekoppeld zijn.
Aminogroep & COOH groep aan de uiteinden. (Een links, een rechts)
Aminozuren worden gekoppeld doormiddel van een peptidebinding; vorming is belangrijk
Hier wordt water bij verbruikt. (OC-NH = peptidebinding)
Schrijfwijze: N-terminus naar C-terminus. (Aminogroep, COOH groep)
Eiwitten zijn polypeptide ketens, flexibiliteit wordt bepaald door de zijgroepen van de aminozuren.
Zijgroepen zijn belangrijk; kunnen reactief zijn (interactie met de omgeving, zuren, basen, afhankelijk
van pH omgeving.) Ook kunnen de OH groepen van tyrosine reageren met de omgeving.
Zijgroepen zijn bepalend voor de functie van eiwitten.
Functie eiwitten
Veel verschillende functies en 3D structuren.
• Enzymen
• Motoreiwitten
• Genregulatoren
• Hemoglobine (transport zuurstof)
De structuur van een eiwit bepaalt welk substraat het kan vervoeren/opnemen.
Alles wat eindigt op -ase is een eiwit.
Variabelen die de structuur en werking van een eiwit bepalen:
• De omgeving
• De aminozuursamenstelling en volgorde
• De secundaire en tertiaire structuur
• De post-translationele modificaties
• Binding van andere moleculen
1. De omgeving
Eiwitten in een waterige omgeving in de cel
65% van het menselijk lichaam bestaat uit water.
Water heeft het grootste effect in de cel op zwakke interacties
Zwakke interacties zijn benodigd voor:
• Dynamiek van moleculen in de cel
• Interactie tussen eiwitten
• Overbrengen van energie van ene naar andere molecuul
Niet-covalente reacties vormen en verbreken spontaan en snel.
Biomedische wetenschappen – Cellen
, XXXI
Eigenschappen water:
1. Eenvoudige samenstelling
2. Elektrische dipool (O = elektronegatief, H = elektropositief)
3. Is donor en acceptor voor het maken van waterstofbruggen
a. Donor: Het molecuul dat een H ‘afstaat’
b. Acceptor: Het molecuul dat een binding met het H-atoom aan gaat.
• Grote oppervlakte spanning
• Zeer hoog kookpunt (100C)
• Dynamisch: levensduur H-brug is 10-10 seconden -> Kookpunt is daarom 100C
Water neemt deel aan chemische reacties in de cel.
Zuren en basen
Een zuur staat een proton (H+ ) af (dissociatie)
• Zwak zuur (Evenwichtsreactie)
• Sterk zuur (Aflopend)
Een base neemt een proton (H+) op (associatie)
• Zwakke base (Evenwichtsreactie)
• Sterke base (Aflopend)
Beide afhankelijk van de pH van de omgeving.
Stel:
HA <-> H+ + A-
pH KA /Kz
pH zegt iets over de H3O+ concentratie van een oplossing. ( pH = - log [H+] )
Is op te schrijven als een evenwichtsvergelijking:
Keq = ([H+] x [A-])/ [HA] → pKA = -log KA (pKA is een constante, die uniek is voor elk zuur/base)
(Blz 41, 42 (Blokboek/Alberts?))
Keq = ([H+] x [A-])/ [HA] → pH = pK + log [A-] / [HA]
• Evenwicht wordt sterk beïnvloed door [H+], en dus door pH
• 50% dissociatie: [A-] = [HA] ([A-] / [HA] = 1, log 1 = 0) pH = pK
o (Henderson-Hasselbalch vergelijking)
Belangrijk: Werkcollege 2 bekijken
Als pH > pK dan zal een zuur negatief geladen worden. Als pH = pK (+ 1 en -1 marge) dan 50/50
lading. Maar hij zal nooit positief worden; neutraal of negatief.
Als pH < pK dan zal een base positief geladen worden. Als pH = pK (+1 en -1 marge) dan 50/50
lading. Maar hij zal nooit negatief worden; neutraal of positief.
Biomedische wetenschappen – Cellen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller SemBMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.89. You're not tied to anything after your purchase.