Alle hoorcolleges, practica en xertes verwerkt in één grote samenvatting. Hierin is niet het hele boek meegenomen, maar wel veel van de belangrijke punten.
Principles of Development 6th Edition By Lewis Wolpert; Cheryll Tickle; Alfonso Martinez Arias 9780198800569 Chapter 1-14 Complete Guide .
Principles of Development 6th Edition By Lewis Wolpert; Cheryll Tickle; Alfonso Martinez Arias 9780198800569 Chapter 1-14 Complete Guide .
Principles of Development 6th Edition By Lewis Wolpert; Cheryll Tickle; Alfonso Martinez Arias 9780198800569 Chapter 1-14 Complete Guide .
All for this textbook (15)
Written for
Universiteit Utrecht (UU)
Biologie
Ontwikkelingsbiologie (BB2OBI07)
All documents for this subject (51)
1
review
By: metteschuckinkkool • 5 months ago
Seller
Follow
thomvd
Reviews received
Content preview
DT2 Ontwikkelingsbiologie
Cell differentiation and stem cells + Xerte
Differentie van een cel door expressie bepaalde genen
-cel wordt neuronale cel of bijdragen een hematopoetische bloedlijn
-veranderingen zijn gradueel
-na terminale differentiatie -> geen verandering meer
-200 verschillende humane cellen
-structureel anders
-verschillende genexpressie
-10% actieve genen zorgt voor differentiatie/cell fate (micro array/RNAseq)
-na differentiatie geen/beperkt aantal celdelingen
Transcriptiefactoren reguleren expressie genen
-beperkt aantal zorgt al voor fate (1 al!) -> master regulatory gen
-combinatie expressiegenen bepaald celtype
Genexpressie
-gen heeft:
-controle regio -> (core) promotor (5’, bindt TF/RNA polymerase) + enhancer (kunnen ver weg
liggen, beïnvloeden plaats/tijd expressie)
-bepalen of belangrijk is door promotor (controle regio) zetten voor gen wat
normaliter niet gemaakt wordt (mensenhormoon in muis, expressie in ander weefsel,
zie afb) -> komt door binden TF+complex aan controle regio’s
-meer promotors per gen is mogelijk
-coderende regio -> mRNA (intronen worden eiwit, exonen eruit geknipt)
-onvertaalde regio’s -> bindingsplekken eiwitten die reguleren aan ´3-kant (niet altijd in
gebruik, maar kunnen heel belangrijk zijn!)
-RNA polymerase gebruikt 3’-5’ keten, RNA is dus kopie van 5’-3’ keten
,Eiwitcomplex:
-TF reguleren (binden promotor) RNA polymerase II -> transcriptie initiatie complex
-kan activeren/repressen, meerdere enhancers binden, gen kan meerdere enhancers nodig
hebben
-enhancers binden activators/repressors -> reguleren -> co-activator/repressor -> linkt aan TIC
-mediator multi eiwit complex bindt alle activatoren/repressors aan RNA polymerase II
-mogelijk door flexibiliteit DNA
-promotor aan 5’ gen
-controle regio op 5’ of 3’ gen -> kan 1000en kb’en van gen liggen!
Combinatie spatio-temporale (tijd/plaats) expressie bepaalt TF en expressie genen
-vb. even skipped:
-in elk ander parasegment tot expressie
-in vroeg embryo strepen (expressie in parasegmenten, 7 strepen), in laat embryo stipjes
(expressie in mesoderm, spier)
-mogelijk door andere TF expressie in vroeg/laat embryo -> geen activators voor expressie
zeven eve-strepen in laat embryo
-tinman -> laat stage -> hart/spier in mesoderm -> handelt niet alleen!
-late stage activatie zodat geen eve actief in verkeerde regio’s
-combinatie TF brengt expressie even skipped
,Eén massa-TF kan andere TF tot expressie brengen
-gen tot expressie als andere TF binden aan regulatie gebieden
-combinatie en hoeveelheid bepaalt regulatie
-associatie met co-activatoren en co-repressors
-kunnen ook gen hoog/laag tot expressie brengen
Topologically associated domains (TADs) -> sterk gevouwen gebied
-delen van chromatiden wat gevouwen is
-kleuren en hoogte piramide geeft complexiteit vouwing aan
-donker = veel vouwing = hoge piramide
-kunnen megabp in lengten zijn
-kunnen gebieden tussen liggen die minder sterk zijn gevouwen
-gereguleerd door CTCF -> binden cohesine -> trekt DNA erdoor en vouwt dit
-vouwen, zodat TF niet kunnen binden! -> regulatie!
-gevouwen = heterochromatine (donker), niet gevouwen = euchromatine (licht)
, Hoxa cluster ligt tussen twee TADs
-enhancers van dit gen liggen in de sterk gevouwen TAD
-bij expressie cluster -> ontvouwen TADs -> regulatie cluster
In Hoxa cluster
-op E6 (embryonale dag 6) is chromatine gecondenseerd, repressie histonenmarks
-op E7 -> Wnt (Wingless + Int) signalering ontvouwt chromatide -> TF-complexen binden -> activatie
Wnt-responsive enhancers -> afschrijven Hoxa cluster
-hoe verder ontvouwen -> hoe verder Hox afgeschreven
-correleert met anterior-posterior expressie
-voortgaande decondensatie chromatine
-modificatie histonen
-op E10 -> laatste Hoxa gen tot expressie -> anterior Hox gen uit, posterior aan
In Drosophila eiwitten Hox expressie
-expressie: trithorax
-repressie: polycomb
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller thomvd. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $10.20. You're not tied to anything after your purchase.
