- Metabolieten hebben vele functies: bouwstoffen voor macromoleculen, brandstof voor
energievoorziening, signaaltransductie, etc.
- Metabolisme integreert alle niveaus van cellulaire regulatie + omgevingsfactoren (dieet)
metaboloom is read-out van functioneren van een cel/organisme
- Δ metaboloom in vele complexe aandoeningen: kanker, obesitas, diabetes, etc.
Metabolomics toepassingen:
‘metabolic signatures’ van ziektetoestanden diagnose
Interventie mogelijk via dieet
Snelle analyse van therapierespons (bv. na orgaantransplantatie)
Probleem: Erg heterogene groep van moleculen.
5.1. Specifieke testen van individuele metabolieten
= traditionele metabolietanalyse
Vereist vaak specifieke opzuivering, optimalisering
van scheidingscondities, soms arbeidsintensief
RIA, HPLC, GC (gaschromatografie), CE, MS
Vaak enzymatische testen gekoppeld aan kleurreactie
bv. glucosetest voor diabetici.
5.2. Metabolomics
Metabolomics = allesomvattende en simultane analyse van metabolieten in een biologisch systeem
MetaboNomics = kwantitatieve analyse van een metabole respons op een stimulus Δ’en in het
metaboloom tgv. een stimulus.
, Staal pellet wassen snel invriezen
(quenchen)
Extractie met koude reagentia
Proteïne precipitatie
Quenchen = metabolisme zo snel
mogelijk stilleggen. We willen
metabolisme analyseren zoals het in de
cel is!
Apolair, alles wat niet Polair, alles wat oplost
oplost in water! in water!
5.2.1. Via NMR
NMR: spin van kernen met een oneven atoomgetal. Kern functioneert als een kleine magneet, deze
kleine magneet gaan we in een grote magneet zetten, oriëntatie volgens B 0. Radiogolf om spin van
kleine magneet om te draaien naar de hogere E-toestand.
Signaal is afhv. de elektronen-configuratie, deze schermen de kern af (kooi van Faraday) van
radiogolven. Afhv. de elektronen-configuratie gaan we verschillende radiofrequentie moeten
gebruiken. Spectrum met pieken die overeenkomen met protonen. Data afhv. protonen & B 0! Dus is
niet vergelijkbaar tussen labo’s. Oplossing hiervoor gebruikt met een standaard molecule (TMS) dat
we meten en aanvaarden als nulpunt.
# protonen op naburige C => # pieken in 1
piek. heel complex spectrum bij
complexere structuren.
Chemical shift = verschil in freq. nodig om
spins te draaien tov. freq. nodig om
standaardmolecule (TMS) spins te draaien.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lukanys11. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.42. You're not tied to anything after your purchase.
