Garantie de satisfaction à 100% Disponible immédiatement après paiement En ligne et en PDF Tu n'es attaché à rien
logo-home
Recherché précédemment par vous
Recherché précédemment par vous
logo
Volledige samenvatting hoofdstuk 2 methoden in het biomedisch onderzoek 3 $5.61
Ajouter au panier
Accédez rapidement à
Aperçu
  2.  
  3. Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
  4.  
  5. Biomedische Wetenschappen

Resume

Volledige samenvatting hoofdstuk 2 methoden in het biomedisch onderzoek 3

1 vérifier
 1 fois vendu
  • Cours
  • (E0F95A)
  • Établissement
  • Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)

Volledige samenvatting hoofdstuk 2 van methoden in het biomedisch onderzoek 3. Hoge punten al bewezen na gebruik van deze samenvatting, 16+/20! alle sequencers op volledige en begrijpbare manier neer geschreven met alle uitleg vandien.

Aperçu 4 sur 37  pages

Infos sur le Document

  • 16 novembre 2023
  • 37
  • 2022/2023
  • Resume

Sujets

  • methoden
  • methoden 3
  • bmw
  • biomedische wetenschappen
  • leuven
  • methoden in het biomedisch onderzoek 3
  • methoden in het biomedisch onderzoek
  • ku leuven

École, étude et sujet

  • Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
  • Biomedische Wetenschappen
  • (E0F95A)

1  vérifier

review-writer-avatar

Par: mayavounckx • 1 année de cela

Vendeur

avatar-seller
lukanys11

Avis reçus

Aperçu du contenu

Methoden 3 – samenvatting
H1: inleiding

Methoden 3: van één (enkele) molecule(n) naar omics

- Next Generation sequencing = NGS

Multi-omics:




Bulk- vs single cell-omics




 Spatial
omics: ruimtelijke info behouden, cellen bekijken terwijl ze nog in het weefsel zitten
o Fruit bekijken terwijl het nog in de fruitschaal ligt en dus info blijft behouden van
waar in de fruitschaal het zich bevindt.

Interactomics  interacties bekijken

Fluxomics  meten hoe moleculen worden omgezet in een ander en de snelheden  Pathway
analyse.

Gen modulatie: biomedisch probleem bv. ziekte  adhv. omics identificatie gen, proteïne, lipide dat
veranderd is in ziekte  gen modulatie toepassen om functie van gen/lipide/proteïne in ziekte na te
gaan.

DOEL: Concrete vraagstellingen beantwoorden  integratie van methoden.

,H2. DNA
2.1 DNA sequentiebepaling


De novo genoom sequentiebepaling

- Ongekende genomen
- HGP
- Overlappen om zo te achterhalen hoe deze in elkaar passen, repeats zijn een uitdaging!

Resequencing

- Gekende genomen
- Referentiegenoom  achterhalen hoe alle fragmenten in elkaar passen door te mappen tov.
referentiegenoom
- Verschillen tussen individuen
o SNP’s
o Ziekten
- Diagnose, farmacogenetica, etc.

Sequentiebepaling als teller

- #DNA moleculen achterhalen

de novo seq. vs reseq.

,2.1.1. 1ste generatie sequentiebepaling
Maxam & Gilbert = chemische klievingsmethode

- Differentiële chemische klieving van nucleïnezuren in 4 verschillende reacties, gevolgd door
scheiding volgens grootte op gel en visualisatie via autoradiografie
- Strengen radioactief merken
 Relatief korte fragmenten
 Niet helemaal specifiek  sequentie niet altijd eenduidig



Fragmenten merken => knippen zodat maar 1 merker per
fragment is.

Dan verschillende klievingsreacties

- Knippen na een G
- Knippen na een G of A
- Knippen na een C of T
- Knippen na een C

Op gel zetten dan adhv. waar bandjes kan je afleiden
welke base zich op die plek bevindt.
ddNTP = ontbreken van 3’ OH,
deze vormt normaal
fosfodiesterverbindingen in een
DNA met
Sanger sequencing = nieuwsynthese keten
dideoxy-keten
terminatie

Template = gefragmenteerd genoom dat geamplificeerd wordt door cloneren of een specifiek
fragment dat geamplificeerd wordt met PCR.

Polymerase + primer + mengsel van 4 dNTPs + ddNTPs (elke ddNTP met verschillend fluorescent
label). Reactie gaat gwn door bij inbouw van dNTPs maar stopt bij inbouw van een ddNTP. Daar
fluorescente merker.  aflezen in capillaire gelektroforese = elektroferogram, kortse fragment eerst
en zo sequentie bepalen.

- Juiste verhouding dNTPs/ddNTPs
- Betrouwbaarheid verhogen door reactie in beide richtingen uit te voeren  FW en RV
primer
 Beperkt tot ~500nt, lastig met repeats
 €

Phred-Score van elektroferogram:

- 10 = 1/10 bp is fout
- 20 = 1/100 bp is fout
- 30 = 1/1000 bp is fout
 Liefst 20 of 30

,  Sequentie fout vs mutatie?  FW en RV primer ter bevestiging

Craig Venter
Sequentie v.e. individuele mens voor eerste keer. Gedaan adhv. whole genome shotgun
sequencing.

- Random clones, geen mapping
- Sanger

Heel moeilijke data-analyse om alles te assembleren  random korte sequenties zonder mapping
reassembleren

Enorme impact op:

- Technologische ontwikkeling van sequencing
- Bio-informatica
- Visie op delen van data  open science
- Biologische kennis  nagenoeg hele sequentie humane genoom gekend, nu kijkend naar
genetische verschillen en evolutie.
- Etc.

Nieuwe uitdagingen:

- Persoonlijke genoomsequenties van iedereen
 Personalized precision medicine
o Sequentie gekend met SNPs  diagnose, prognose, preventie, gebruik medicatie,
inzicht in aandoeningen
o THERAPIE OP MAAT

 Ethisch!



2.1.2. 2de generatie sequentiebepaling: short-read next-generation
sequencing
DOEL = veel hogere throughput aan veel lagere kost  massale DNA sequentiebepaling mogelijk

Parallelle detectie (Massive parallel sequencing)

- Korte sequenties massief parallel sequencen

Miniaturisatie van reacties

Integratie van het proces (pipeline)

- Directe detectie (<> scheiding fragmenten vie gelelectroforese)



4 basis stappen:
- Stap 1: aanmaak DNA library
- Stap 2: Klonale in vitro amplificaties
- Stap 3: Sequencing/sequentiebepaling
- Stap 4: Data analyse

Les avantages d'acheter des résumés chez Stuvia:

Qualité garantie par les avis des clients

Qualité garantie par les avis des clients

Les clients de Stuvia ont évalués plus de 700 000 résumés. C'est comme ça que vous savez que vous achetez les meilleurs documents.

L’achat facile et rapide

L’achat facile et rapide

Vous pouvez payer rapidement avec iDeal, carte de crédit ou Stuvia-crédit pour les résumés. Il n'y a pas d'adhésion nécessaire.

Focus sur l’essentiel

Focus sur l’essentiel

Vos camarades écrivent eux-mêmes les notes d’étude, c’est pourquoi les documents sont toujours fiables et à jour. Cela garantit que vous arrivez rapidement au coeur du matériel.

Foire aux questions

Qu'est-ce que j'obtiens en achetant ce document ?

Vous obtenez un PDF, disponible immédiatement après votre achat. Le document acheté est accessible à tout moment, n'importe où et indéfiniment via votre profil.

Garantie de remboursement : comment ça marche ?

Notre garantie de satisfaction garantit que vous trouverez toujours un document d'étude qui vous convient. Vous remplissez un formulaire et notre équipe du service client s'occupe du reste.

Auprès de qui est-ce que j'achète ce résumé ?

Stuvia est une place de marché. Alors, vous n'achetez donc pas ce document chez nous, mais auprès du vendeur lukanys11. Stuvia facilite les paiements au vendeur.

Est-ce que j'aurai un abonnement?

Non, vous n'achetez ce résumé que pour $5.61. Vous n'êtes lié à rien après votre achat.

Peut-on faire confiance à Stuvia ?

4.6 étoiles sur Google & Trustpilot (+1000 avis)

64670 résumés ont été vendus ces 30 derniers jours

Fondée en 2010, la référence pour acheter des résumés depuis déjà 15 ans

Commencez à vendre!

Récemment vu par vous

Examen ·

(0)

LCR4805 Assignment 2 (ANSWERS) Semester 2 2024 - DISTINCTION GUARANTEED

Examen ·

(0)

Contemporary Issues in Biology Final ~ TCU, Sawey Exam Questions and Answers

Examen ·

(0)

WGU C777 Practice Test C | 100% Correct Answers | Verified | Latest 2024 Version

Examen ·

(0)

Illustrator GMetrix Exam Study Guide questions with correct answers

Resume ·

(0)

Samenvatting Sociologie boek De samenleving 14e editie, ISBN: 9789043035774

Resume ·

(0)

Samenvatting Materieel strafrecht - Materieel Strafrecht (RS0702171814)

Examen ·

(0)

NSG 6430 WEEK 9 QUIZ / NSG6430 WEEK 9 QUIZ (LATEST 2023 VERIFIED, 100% CORRECT

Examen ·

(0)

Rise Up Customer Service Test: Questions With Solutions (Correctly Answered)

Resume ·

(0)

Samenvatting Aardrijskunde Examencommissie 2023 (Slagen gegarandeerd!)

$5.61  1x  vendu
  • (1)
Ajouter au panier
Ajouté