Deze samenvatting omvat de stof die behandeld is in colleges 1 t/m 5, genaamd:
1. Molecules of Life
2. Proteins
3. Membranes and proteins
4. Homology
5. Folding
In de samenvatting zijn handige afbeeldingen verwerkt uit de bijbehorende stof uit het boek "Molecules of life" van Kuryian.
MBLS 105, EXAM REVIEW, EXAM Q&A, KEY POINTS OF LECTURES
All for this textbook (1)
Written for
Universiteit Utrecht (UU)
Scheikunde
Biomoleculaire Chemie
All documents for this subject (4)
2
reviews
By: tvhvanhunen • 3 year ago
By: LaureSchippers • 3 year ago
Seller
Follow
sanneerkamp
Reviews received
Content preview
Samenvatting Biomoleculaire
Chemie deel 1
Hoorcollege 1: Molecules of Life
De moleculen van het leven bestaan uit:
- DNA
- RNA
- Eiwitten
- Lipiden
- Suikers
- Water
Het Centrale Dogma stelt: DNA transcriptie RNA translatie Eiwitten
→ →
Intermoleculaire interacties zijn (vrijwel) altijd non-covalent. Alle non-covalente interacties zijn
bovendien elektrostatisch van aard:
- Van Der Waals interacties
- Elektrostatische interacties
- Waterstofbruggen
Elektronegativiteit neemt van links naar rechts en van beneden naar boven toe in het periodiek
systeem. Zuurstof is dus elektronegatiever dan stikstof en vormt dus een sterkere H-brug. H-bruggen
hebben naast een non-covalent ook een covalent karakter (overlapping orbitalen).
- Water heeft twee H-brug donoren en twee acceptoren. Het verzwakt elektrostatische
1 qi q j
interacties; U ij =( )( 2 ) met ε r ≡ 1 in vacuüm, 80 in water en 2-4 in eiwit.
4 π ε 0 ε r r ij
- Water verzwakt ook de effectieve sterkte van waterstofbruggen, want voordat H-bruggen
tussen moleculen gevormd kunnen worden, moeten de H-bruggen met water eerst
verbroken worden.
- Water zorgt voor het hydrofobe effect door veranderingen in de entropie van water. Vrije
watermoleculen kunnen snel ronddraaien (hoge entropie), maar watermoleculen bij een
apolair oppervlak kunnen minder ronddraaien (lage entropie). De apolaire oppervlakken
minimaliseren daarom hun oppervlak door te aggregeren.
∆ G=∆ H−T ∆ S . Hierbij heeft de enthalpie-term betrekking op de v.d. Waals interacties,
elektrostatische interacties en H-bruggen. De entropische-term heeft betrekking op het hydrofobe
effect (de term hydrofobe ‘interacties’ is daarom onjuist). Alleen losse aminozuren hebben geladen
groepen. Ze zijn (vrijwel) allemaal linksdraaiend.
1
, Aminozuren kunnen onderverdeeld worden in verschillende groepen:
Tryptofaan is zowel hydrofoob als hydrofiel, want het zit op de grens van het hydrofiele en hydrofobe
deel van het membraan.
Het eerste C-atoom in de zijketen wordt Cβ
genoemd en zo loopt de nummering verder
door.
Alfa-helices voldoen aan de waterstofbrug
capaciteit van de eiwit-backbone. Als er
geen H-bruggen zouden worden
gevormd door groepen binnenin het
eiwit, is dat energetisch zeer
ongunstig. Buiten het eiwit kunnen H-
bruggen met water gevormd worden. β-
sheets kunnen parallel of anti-parallel zijn.
Hydrofobe aminozuren zitten vooral binnenin het eiwit, neutrale polaire aminozuren vooral aan de
buitenkant en polaire geladen aminozuren vrijwel altijd aan de buitenkant. Eiwitdomeinen zijn
structureel relevanter dan de quaternaire structuur. Interacties:
De stabiliteit van wateroplosbare eiwitten komt vooral door het hydrofobe effect en dus door water.
2
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sanneerkamp. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.97. You're not tied to anything after your purchase.
