100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Previously searched by you
Previously searched by you
logo
Samenvatting CELLEN - Hoorcollege 27 t/m 34 - 2017/2018 $4.99
Add to cart
Quickly navigate to
Preview
  2.  
  3. Universiteit Utrecht (UU)
  4.  
  5. Cellen

Summary

Samenvatting CELLEN - Hoorcollege 27 t/m 34 - 2017/2018
 0 purchase
  • Course
  • Cellen
  • Institution
  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Book
  • Essential Cell Biology

Hoorcollege 27 t/m 34 van het vak Cellen (Biomedische Wetenschappen, Universiteit Utrecht) uitgewerkt (2017/2018). De volgende onderwerpen komen aan bod: DNA-repair en DNA-recombinatie (hoorcollege 27 en 28), celcyclus en apoptose (hoorcollege 30 en 31), micro-organismen (hoorcollege 32, 33 en 34).

Preview 3 out of 28  pages

Document information

  • Unknown
  • April 29, 2018
  • 28
  • 2017/2018
  • Summary

Subjects

  • hoorcollege
  • biomedische wetenschappen
  • bmw
  • cellen
  • dna repair
  • dna recombinatie
  • dna
  • celcyclus
  • apoptose
  • micro organismen
  • samenvatting
  • universiteit utrecht
  • 20172018

Connected book

book image

Book Title:

Author(s):

  • Edition:
  • ISBN:
  • Edition:

Written for

  • Universiteit Utrecht (UU)
  • Biomedische Wetenschappen
  • Cellen
All documents for this subject (85)

Seller

avatar-seller
anoukbmw

Reviews received

Content preview

CELLEN – HOORCOLLEGE 27-34 – 2017/2018

Hoorcollege 27 + 28: DNA Repair en recombinatie (16-10-2017)
DNA-repair
• Fouten tijdens DNA-replicatie (delende cellen).
• Proofreading: enkele DNA streng.
• Mismatch repair: enkele DNA streng.
• Fouten na DNA-replicatie (niet-delende cellen).
• BER (Base Excisie Repair): enkele DNA streng.
• NER (Nucleotide(n) Excisie Repair): enkele DNA streng.
• Non-homologous end-joining: dubbele DNA streng.

Homologe recombinatie: dubbelstrengs breuk
• Homologe recombinatie tijdens S-fase en G2-fase: zuster chromatide.  Homologe chromosomen
liggen dicht bij elkaar.
• Homologe recombinatie tijdens meiose: ouder chromatide.  Geen DNA-schade, maar een
geïnduceerde dubbelstrengs breuk (geplande recombinatie).

Bij enkelstrengs breuken kan de andere streng gebruikt worden voor herstel van de streng d.m.v.
complementaire basenparing.

DNA schade veroorzaakt een DNA damage response. Er worden eiwitten getranscribeerd en getransleerd
voor:
• DNA repair
• Het stopzetten van de celcyclus.
• Remming/Stimulatie van transcriptie van bepaalde eiwitten.
• Apoptose van de cel.

Repair mechanismen voor fouten die tijdens DNA-replicatie ontstaan
Een ouderstreng wordt als template gebruikt om een dochterstreng te synthetiseren. DNA-replicatie is
semi-conservatief. Dit proces verloopt bijna foutloos. Het geeft onze cellen genetische stabiliteit.

Fouten tijdens DNA-replicatie kunnen worden hersteld door twee mechanismen: proofreading en
mismatch repair.

Proces Nauwkeurigheid
DNA-replicatie (zonder proofreading) 1 fout per 105 nucleotiden.
DNA-replicatie (met proofreading, zonder 7
1 fout per 10 nucleotiden.
mismatch repair)
DNA-replicatie (met mismatch repair) 1 fout per 109 nucleotiden.

De kans dat een fout in een stukje DNA zit dat codeert voor een essentieel eiwit (en het eiwit verandert) is
heel klein, want DNA bestaat slechts voor 1,5% uit stukjes die coderen voor eiwitten.

Proofreading
DNA-polymerase heeft twee activiteiten: polymerisatie en proofreading.



1

,Proofreading = Als een foute nucleotide wordt ingebouwd, wordt deze verwijderd door de exonuclease
activiteit van DNA-polymerase.

Werking:
1. Elongatie DNA-replicatie.
2. Proofreading (herkennen fout door vormverandering DNA).
3. DNA-polymerase verplaatst naar achter en verwijdert de verkeerde
nucleotide door de exonuclease activiteit.
4. Elongatie DNA-replicatie.

Nucleotiden dragen zelf de energie bij zich voor de koppeling. Het is dus makkelijk
om een nucleotide los te maken en weer te koppelen.

Mismatch repair
Fouten die gemaakt worden tijdens DNA-replicatie kunnen worden opgelost met
mismatch repair. Het is belangrijk dat er onderscheid gemaakt wordt tussen de
ouderstreng en de nieuw gesynthetiseerde streng.

Werking:
1. Mismatch wordt herkend door specifieke repair eiwitten.
2. Verwijdering van een stuk van de nieuw gesynthetiseerde streng
m.b.v. een helicase.
• Eukaryoten: 30 nucleotiden.
• Prokaryoten: 13 nucleotiden.
3. Nieuwe synthese van het ontbrekende deel door DNA-polymerase.
4. De DNA-backbone sluiten door DNA-ligase.

Onderscheid tussen de ouderstreng en de nieuw gesynthetiseerde
streng bij prokaryoten
Bij prokaryoten wordt het DNA gemethyleerd bij specifieke
sequenties:
• 3’ GGTCC 5’.
• 3’ CTAG 5’.
• 3’ GGACC 5’.
Nieuw gesynthetiseerd DNA is nog niet gemethyleerd. Eiwitten die de mismatch repair uitoefenen
kunnen het onderscheid tussen wel of niet gemethyleerd DNA maken, waardoor er onderscheid
tussen de ouderstreng en de nieuw gesynthetiseerde DNA streng gemaakt kan worden.

Mutaties
Mutaties kunnen voorkomen in germ cells (geslachtscellen) en somatic cells (lichaamscellen).
Ze kunnen ontstaan door:
• Fouten van DNA-polymerase. (Iedere nucleotide kan muteren.)  Tijdens DNA-replicatie.
(Onderscheid tussen ouderstreng en de nieuw gesynthetiseerde DNA streng.)
• Chemische reacties in een cel.  Na DNA-replicatie. (Geen onderscheid tussen ouderstreng en de
nieuw gesynthetiseerde DNA streng.  Repair mechanisme weet na DNA-replicatie niet in welke
streng de fout is ontstaan.)
• Depurinering.
• Deaminering.


2

, • UV-licht/Straling.  Na DNA-replicatie. (Geen onderscheid tussen ouderstreng en de nieuw
gesynthetiseerde DNA streng.  Repair mechanisme weet na DNA-replicatie niet in welke streng
de fout is ontstaan.)
• Thymine dimeren.

Deaminering
Een aminogroep (NH2-groep) wordt van de base (C,
A of G) afgehaald. De suikerfosfaat-backbone blijft
behouden.

Cytosine verandert door deaminering in uracil. 
Er ontstaat een RNA-DNA-koppeling.  Dit wordt
herkend als een fout.


Ook guanine en adenine kunnen gedeamineerd worden.  Er ontstaat een
base die niet bestaat in een normale cel.  Dit wordt herkend als een fout.

Gevolg (als de fout niet wordt opgelost) bij DNA-replicatie:
• 50% kans dat er een mutatie ontstaat in de nieuw gesynthetiseerde
streng.  Puntmutatie.
• 50% kans dat er niets verandert in de nieuw gesynthetiseerde streng.

Depurinering
De gehele base wordt van de nucleotide gehaald. Alleen de suikergroep en fosfaatgroep blijft over. Dit is
een hydrolyse reactie. De suikerfosfaat-backbone blijft behouden.

Dit gebeurt alleen op purine basen: adenine en guanine.




Gevolg (als de fout niet wordt opgelost) bij DNA-replicatie:
• 50% kans dat er een deletie optreedt.
• 50% kans dat er niets verandert in de nieuw
gesynthetiseerde streng.

Thymine dimeren
Twee basen aan dezelfde streng worden covalent met elkaar verbonden. Dit vormt een barrière voor DNA-
polymerase en RNA-polymerase.

Mogenlijk tussen:
• Twee thymines (TT).
• Twee cytosines (CC).
• Een cytosine en een thymine (CT).
3

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller anoukbmw. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $4.99. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

66184 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$4.99
  • (0)
Add to cart
Added