Dit document omvat alle hoorcolleges, kennisclips en de xerte module van Planten en micro-organismen voor deeltoets 2. Dit is handig om te gebruiken tijdens het kijken van het hoorcollege of de kennisclip, of tijdens het studeren voor het laatste tentamen. Alle hoorcolleges, kennisclips en de xerte...
Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - hoorcollege en kennisclip - deeltoets 2
hoorcollege 9 jan. 2024 – introductie
leerstof deel II
Campbell – H26, H27, H31 en aanvullende info samengevat in leerdoelen
hoorcolleges en online kennisclips
online blackboard quiz – deadline vrijdag 17h
online xerte module (week 7)
werkcolleges 16 en 25 jan. (week 8 en 9) en practicum 18 jan.
eindtoets 30 jan. weegt voor 30% mee
microbiologie – belangrijk en divers vakgebied
● virussen
○ technisch gezien niet levend / geen organisme
○ wel veel invloed op levende organismen
○ bevatten genetisch materiaal
○ hebben een eiwitmantel
○ zijn afhankelijk van andere cellen voor replicatie
● prokaryote micro-organismen
○ domein Bacteria en Archaea
○ eencellig
○ geen nucleus en geen organellen
● eukaryote micro-organismen
○ koninkrijk schimmels
○ protisten: alle eukaryoten behalve planten, dieren en schimmels
○ een- en meercelligen
○ nucleus en organellen
microbiologie tools
● microscopie
○ lichtmicroscopie
■ Brightfield – celkleuringen (fuchsine, Gram)
■ fluorescentie – structuur kleuringen, reporter eiwitten
○ elektronenmicroscopie
■ SEM (scanning) – oppervlakte cellen/structuren
■ TEM (transmissie) – binnenkant en contouren cellen/structuren
● kweken: nutriënten, koolstofbronnen, (a)biotische factoren
○ petrischaal met agar en media
○ erlenmeyer met vloeibaar media
○ fermentoren
● sequencing: sanger (DNA van 1 organisme), metagenomics (meerdere organismen)
○ kan ook onafhankelijk van kweken (metagenomics)
○ DNA isoleren uit reincultuur (1 soort) of uit een omgevingssample of
microbioomsample (community)
○ detectie van moleculaire markers: PCR met universele primers tegen
■ 16 rRNA gen (bacteriën)
■ ITS – Internal Transcribed Spacer (schimmels)
, Planten en micro-organismen (B-B1PLMI20) - hoorcollege en kennisclip - deeltoets 2
Waarom microben kweken?
● bepalen met welke (nieuwe) soort men te maken heeft
○ morfologie m.b.v. microscopie
○ diagnostiek → selectieve media, experimenten
○ reincultuur → sequencing
■ taxonomie (sanger sequencing)
■ genoom analyse (short- and long read sequencing)
moleculaire markers sequencen
● 16S (bacteriën – kleine subunit ribosoom) of ITS (schimmels)
○ ITS codeert niet voor eiwit → mutaties kunnen behouden worden
● onderdeel van het rDNA
● geconserveerd
● variabele stukken
● PCR (polymerase chain reaction) amplificatie met ‘universele’ primers
○ denaturatie (hoge temperatuur) → DNA strengen uit elkaar
○ 2 primers hechten op een bepaalde temperatuur aan de strengen
○ nucleotiden (bouwstenen), Taq polymerase
○ temperatuurcyclus
■ denatureren DNA
■ binden primers
■ verlengen DNA keten
○ herhalen → veel DNA → makkelijker te sequencen
● sequencen van PCR producten
● vergelijken met sequenties in database → al bekend of verwant aan bekende soorten
○ identificeren en verwantschap
Hoe ga je te werk om een schimmel te identificeren?
● sanger sequencing ITS
belang van studie naar micro-organismen
● belangrijke mutualisten en ziekteverwekkers
● grote invloed op ecosystemen – rol in cycli van elementen
● producenten van toepasbare enzymen, medicijnen
● biologische bestrijdingsmiddelen
● voedselbereiding en -productie
kennisclip 7.1 Virussen
eigenschappen virussen
● zijn klein
● hebben erfelijk materiaal
● delen niet
● missen eiwit translatie machinerie
● synthetiseren geen ATP
● zijn afhankelijk van gastheercellen voor vermenigvuldigen
● virussen infecteren mensen, dieren, planten, schimmels en bacteriën
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Ribizlik. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.36. You're not tied to anything after your purchase.
