100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting Moleculaire Biologie: partim 1 $5.96   Add to cart

Summary

Samenvatting Moleculaire Biologie: partim 1

 134 views  1 purchase
  • Course
  • Institution

Uitgebreide samenvatting van de cursus Moleculaire Biologie (partim I) van prof. Tavernier en prof. Gerlo. Aangevuld met schema's en tabellen.

Preview 4 out of 59  pages

  • June 22, 2018
  • 59
  • 2017/2018
  • Summary
avatar-seller
Moleculaire Biologie
Partim 1: Inleiding tot de
moleculair-biologische
informatiesnelweg
DNA = primaire drager van genetisc maaeriaal  geceel aan genetisce info = genoom

DNA + RNA + eiwitenn aiii erfelijk iyiaeem

Tranisripte v DNA  RNA renga soderende info over naar syaoplaima  aranilate aoa eiwiten

Genenn nusleïnezuren  produste van eiwiten of niea-soderend RNA  gesonaroleerde expreiiie



1. Inleiding
1.1 Chronologie

 Biologisch onderzoek: Mendel – paaroon van overerving (1865)
- 1 kenm epaald door 2 fasaoren, onaf van elkaar overgeërfd
- Dominana/ reseiiief
- ‘Erfare partkeli’ = genen of allelen
- Denkwijze voor Mendeln kenm overgedragen via loed
 Scheikundig onderzoek: Mieiscer – scemiisce iameniaelling van selkern (1869)
- 1/3 DNA en 2/3 eiwia
 Fysisch onderzoek: onawikkeling liscamisroisopen mea vercoogde reiolute  Flemmingn cerkenning
scromoiomen (1882), miaoie, karyoaype

 20iae eeuwn ceronadekking weten van Mendel door Correni, De Vriei en Tiscermask
 1902n Sutonn syaogenetisce verklaring voor erfelijkceidiprinsipei van Mendel  meioie, gameaen
 ver and aii scromoiomen en ‘erfare partkeli’ van Mendeln
- Aanwezig in soniaana aanaal
- Veriscillend in aanaal, aype, kleurpaaroon aii dieriooraen
- Verdu elen nea voor seldeling
- Veraonen iegregatepaaroon
 1909n Jocaniienn aermen ‘gen’, ‘genoaype’, ‘fenoaype’
 1910n Morgann gekoppelde genen, resom inate, sroiiing-over, resom inatefrequente,
koppelingianalyie
 1928n Grifacn ‘araniforming prinsiple’
 1944n Avery, MsLeod en MsCaracyn elang nusleïnezuur DNA voor overdrasca erfelijke kenm
 1944n MsClinaoskn jumping genei, aranipoioni
 1950n Ccargafn vercouding purine/pyrimidine = 1
 1952n Hericey en Ccaien DNA = asteve somponena in asaeriofagen & laaa infestei aoe
 1953n Waaion en Crisk (mede door Wilkini & Franklin)n molesulaire iarusauur van DNA

1

,  1955n Tjion 46 scromoiomen in normaal cumaan karyoaype
 1966n Niren erg, Kcorana en Oscoan genetisce sode
 2000n eeriae ruwe veriie vd nusleotdeiequente vc menielijk genoom

1.2 Basisvereisten vh genetssh materiaal

1. Doorgeven van kenmerken aan cea nageilascan
Ali du ele maarijin 1 DNA-replisate  genetisc maaeriaal onadu elen & doorgeven
2. Expreiiie en sonarole vd erfelijke kenmerkenn
Inaerastei DNA en eiwiten  sondeniateaoeiaand + sonarole aranisripte en aranilate
3. Aanpaiiing aan milieun
Muaatei  ondercoud vd inaegriaeia van genetisc maaeriaal & vermogen aoa adapaate



2. Van nucleïnezuren tot genomen
2.1 Nusleïnezuren zijn lineaire polymeren van nusleotien

Nusleïnezurenn gesodeerde info  in primaire iarusauur v DNA en RNA (= opeenvolging van nusleotden)

Nusleotden foifaaagroep + penaoie + organiisce aie

Penaoien ri oie in RNA, deoxyri oie in DNA  iaeedi sysliisc in
Haworac projestee -D-sonfgurate

HOCH2 op 5’n D-poiite OH op 1’n -poiite

5’-Cn eiaer inding mea foifaaa 1’-Cn koppeling mea aie

Ri oien 2 OH-groepen op 2’ en 3’ naar onder gerisca

2-Deoxyri oien op 2’ H naar onder, 3’ OH



Baien in DNA  A, G (purinei) & C, T (pyrimidinei)

Baien in RNA  A,G (purinei) & C, U (pyrimidinei)

Purinei mea 9-N gekoppeld aan 1’-C op penaoie, pyrimidinei mea 1-N

Baien = ceaerosysliisc mea aiiisc karakaer (door N)  niea geproaoneerd ij neuarale pH

Zuur karakaer van DNAn foifaaagroepen

Naamgeving (zie p6)n Baien

Baien + penaoie = nusleoiide

Baien + penaoie + foifaaa = nusleotde (nusleoiide monofoifaaa, difoifaaa…)

Oligo-/ polynusleotden koppeling 3’-OH-groep op penaoie eeriae nusleotde & 5’-foifaaagreop van aweede
nusleotde  foifodiëiaer rug, mea afipliaiing pyrofoifaaagroep



2

,Consl.n nusleïnezuren ce enn penaoiefoifaaa ruggengraaa mea aien ali zijkeaeni

Oriënaaten 5’  3’

2.2 DNA

Sarusaurele eigeniscappen

 du ele celix, opge ouwd uia 2 geaiiosieerde polynusleotdekeaeni (Waaion-Crisk model)
 3 vooriaellingenn scemiisc iarusauurmodel – ruimaevullend model – isanning aunneling EM opname
 Diameaern 2 nm
 10,6 p per omwenaeling (3,4 nm)
 Elke kernn 2m DNA  enorme sondeniate nodig
 Sesundaire iarusauurn
o Penaoiefoifaaaruggengraaa aan uiaenzijde, aien aan innenzijde
o Antparallele iarengen
o Sarengen iamengecouden door waaeriaofruggen en cydrofo e inaerastei
(=iaapelingiefesa)
o Rescaidraaiend agv ,D-sonfgurate vd peniaoiefoifaaaruggengraaa
o Baienpaarsomplemenaariaeia agv groote, vorm & scem. eign iaeedi een purine aegenover een
pyrimidine  Regel van Chargafn A+G/ C+T = 1 (iom purine = iom pyrimidine)
o Geen sovalenae indingen  iarengen isceiden door vercoging Tn energetisc gunitg en
eenvoudig
o A-Tn 2 H- ruggen & G-Cn 3 H- ruggen
!! H- rug = inaermolesulaire krasca aii e—paar op iaerk EN aaoom en na urig H-aaoom
ge onden aan ander iaerk EN aaoom !!
o G-C gecalae ilaaa op primaire iarusauur ( GC op iesundaire)
 Waaion-Crisk sonformate = B-DNA
 A-DNA = sompasaer, niea in fyiiologiisce, waaerige milieu, enkel in organiisce iolvenaen
 Z-DNA = linkidraaiend, koma wel voor in sel, regulerende rol ij genexpreiiie, afankelijk v
aiensom inate
 B-DNA= groae en kleine groefn in groae groef  inaerastei aien mea eiwiten
 -celix en du ele celixn
o -celixn H- ruggen in lengaerisctng
o DNA du ele celixn H- ruggen dwari  flexie eler  uiging geïnduseerd door
nusleotdeniequente of indende eiwiten
 TBP (TATA- ox indend proaeïne)n inda acv eukaryoae promoaori  iaerke uiging DNA mea losale
onawinding van B-vorm verloren

Denaaurate en renaaurate

 Denaturate/ imelaenn iarengisceiding dmv aemperaauurivercoging of coge pH, oiv ureum of
formamide ( inden door sompette)
 Spesarofoaomeariisc gemeaenn aien a ior eren UV ij =260 nm
o A iorpte enkeliarengign 2x groaer dan du eliarengig (penearate efsiënaer ij enkeliareng)
o Tm = veriscillend van DNA aoa DNA-polymeer + iaerk epaald door G-C gecalae (coe groaer G-
C, coe coger Tm)
o Bij Tm = ½ geimolaen


3

,  Renaturate (cy ridiiate)n reaiiosiate van gedenaaureerde iarengen  af v iequentecomologie
!! inaerferente mea DNA iarengen mea niea-verwanae iequente !!

o Snelceid af vn
 DNA sons
 Ionensons (‘+’ geladen ionen neuaraliieren ‘-‘ foifaaagroepen aan uiaenzijde DNA
 onderlinge afiaotng daala)
 Temperaauur (daala onder Tm)
 Complexiaeia vc genoom
o DNA n DNA < DNA n RNA < RNA n RNA = iaa ielia

 Detecte repettee DNA in Eukaryote genon en
1. Breken v aoaaal DNA in fragmenaen v +- 1000 p
2. Denaaurate en renaaurate
3. Opiaellen reaiiosiatesurve
4. Fragmenaen uniek –> renaaurate even inel
Deelfraste meer voorkomend  inellere renaaurate door vercoogde sons
MENSn 109 p  106 fragmenaen van 103 p


 Gel-elektroeorese en Southern blotng (p17-19)
o – foifaaagroepen lopen naar + lading onderaan
o Ssceiding o v groote door gel (reiolute af van ioora gel)
o Gel < agaroie
o Hoe kleiner cea fragmena, coe verder cea geraaka !! onaf vd aie !!
o Viiualiiering doorn
 Kleuring vc gel mea iaof die oplisca onder UV (fluoreisenae merkeri)n iaof
inaersaleera aii de p en worda gesonsenareerd acv DNA  kleuring aoona alle
molesulen
 Auaoradiografen radioasteve iaraling van radioastef gemerka DNA zisca aar op
gevoelige flm  voorafgekozen ieleste zisca aar


o Na isceidingn Souacern lotngn
1. denaaurate ij coge pH
2. gearanifereera door sapillariaeia op niaroselluloie of nylon mem raan
3. fxate mea UV-iaraling  exasae replisa
4. cy ridiiate-experimenan
 radioastef gemerkae pro e lijf alleen over na cy ridiiate en waiien waar
DNA aienparing ge eura
o Endonusleaien (reiariste-enzymen)n iequenteipesifek (cerkennen meeiaal pallindromen)
o EsoR1n pro a iliaeia = 1/ 46 = 1/4096
 DNAn 3.109 p  geknipa mea EsoR1n 3.109.1/4096 = 106 fragmenaen
o Pro e = iaukje enkeliarengig DNA, unieke iequente (+- 20 aien)
 voorkomenn 1/ 420

Voorkomen van DNA en RNA in genomen


4

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller gdlc. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $5.96. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

80796 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$5.96  1x  sold
  • (0)
  Add to cart