Dit document omvat de uitwerkingen van computer practicum 3 van immunobiologie over TRECs en telomeren. Afbeeldingen van grafieken, alignments, etc. zijn bij het document inbegrepen. LET OP: dit document bevat alleen uitwerkingen, en deze zijn dus niet per definitie correct! Het is puur bedoeld als...
Opdracht 1
a. De rode lijn is het aantal CD4 cellen, de blauwe lijn TRECs en de groene lijn TREC
content.
Vervolgens wordt sigma verlaagd, want je verwacht dat HIV de output uit de thymus
verlaagt.
Wanneer je de thymus output een factor 10 verlaagt, neemt de average TREC output
maar een beetje af in 2 jaar volgens het model. De experimentele data laten echter
een afname van een factor 10 zien in 1 jaar dus dat is veel meer dan wat het model
kan verklaren. Kan de thymus output überhaupt deze data verklaren? Wanneer de
thymus output met een factor 1000 of meer verlaagt is er nog steeds niet zo’n grote
afname van een factor 10 van TRECs, welke wordt gevonden in de experimentele
data. Dit betekent dus dat de afname in TRECs niet wordt verklaard door een
verlaging van de thymus output. De kleine afname in TRECs zelfs wanneer de
thymus output zeer sterk is verlaagd, wordt verklaard doordat de T-cellen en de
TRECs zeer lang levend zijn en de hoeveelheid TRECs dus redelijk constant blijft.
b. Het totale aantal naïeve T cellen en
het aantal TRECs neemt af. De
TREC content neemt echter toe. Dit
wordt verklaart doordat er meer
naïeve T cellen zijn zonder TRECs
dan naïeve T cellen met TRECs.
Wanneer er dus meer T cellen
doodgaan vanaf 30 jaar, gaan er
relatief meer T cellen dood zonder
TRECs. Dit zorgt ervoor dat het
aantal TRECs per totaal aantal T
cellen toeneemt (totaal aantal T
cellen neemt sneller af dan aantal
TRECs), waardoor de TREC content
(average TRECs) toeneemt.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sanneerkamp. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.22. You're not tied to anything after your purchase.