Dit document omvat de uitwerkingen van computer practicum 1 van immunobiologie over de diversiteit van het immuunsysteem. Afbeeldingen van grafieken, alignments, etc. zijn bij het document inbegrepen. LET OP: dit document bevat alleen uitwerkingen, en deze zijn dus niet per definitie correct! Het i...
Opdracht 1
Op de X-as staat log(p) (probability of recognition) en op de y-as staat Pi*n, n=het aantal
epitopen per pathogeen. Pi= probability of mounting an immune response
a. Als R0 kleiner wordt, verschuift de (het linkerdeel van de) grafiek naar rechts. Dit
betekent dat bij minder repertoire de p kleiner wordt doordat er minder kans is op
positieve selectie. Als de R0 groter wordt verschuift de grafiek naar links, doordat de
kans op epitoop herkenning groter wordt (meer positieve selectie)
Als S kleiner wordt, wordt het aantal self peptiden kleiner en vindt er minder
negatieve selectie plaats. Hierdoor verschuift het rechterdeel van de grafiek meer
naar rechts. Als S groter wordt is er meer negatieve selectie en verschuift het
rechterdeel van de grafiek naar links, want de probability of recognition wordt kleiner
omdat er meer T-cellen negatief geselecteerd worden.
> curve(Pin(logp=x),from=-10,to=0)
> curve(Pin(r0=1e8,logp=x),add=TRUE,col="blue")
> curve(Pin(r0=1e10,logp=x),add=TRUE,col="green")
> curve(Pin(s=1e4,logp=x),add=TRUE,col="red")
> curve(Pin(s=1e6,logp=x),add=TRUE,col="yellow")
b. Het immuunsysteem heeft een hoge diversiteit, omdat er ook een groot aantal self-
antigenen (S) is. De hoge diversiteit wordt dus niet veroorzaakt door het aantal
lichaamsvreemde antigenen, maar door het aantal lichaamseigen antigenen
(maximum Pi en dus de maximale immuunrespons kan namelijk worden gevonden
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sanneerkamp. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.22. You're not tied to anything after your purchase.