Summary Molecular Biology of the Cell 2 (book) (WBFA007-04)
Summary Regenerative Medicine
All for this textbook (62)
Written for
Universiteit Utrecht (UU)
Biomedische Wetenschappen
Genoom
All documents for this subject (46)
Seller
Follow
anoukbmw
Reviews received
Content preview
Hoofdstuk 6: How cells read the genome (from DNA to protein)
Centraal dogma = Genetiche informate wordt overgedragen van nucleïnezuren DNA en RA ) naar
eiwiten. lle cellen Dvan bacteriën tot menien) hebben dezelfde ‘foww van genetiche informate.
Tranicripte: van NA naar RA .
Tranilate: van RA naar eiwit.
Er zijn echter wel verichillen tuiien organiimen, bijvoorbeeld dat er bij eukaryoten nog proceiiing van
RA -moleculen plaativindt.
From DNA to RNA
Een cel kan een gen in verichillende mate van efciënte tot expreiiie laten komen,
zowel op niveau van tranicripte ali tranilate.
RA moleculei are iingle-itranded D6.5)
Tranicripte = Het procei waarin een NA -molecuul wordt overgeichreven naar een
RA -molecuul.
Verichillen tuiien NA en RA zijn:
NA RA
Neioxyribonucleotden: bevaten de Ribonucleotden: bevaten de iuiker
iuiker deioxyriboie Dzonder -OH-groep riboie Dmet -OH-groep aan het 2e
aan het 2e koolitofatoom). koolitofatoom).
Bevat baie thymine DT). Bevat baie uracil DU).
Nubbelitrengi. Enkelitrengi.
In RA zijn ook andere typen baienparing mogelijk. RA kan gevouwen worden in een bepaalde vorm. Het
ii dan ook op bepaalde plaatien een dubbelitrengi helix.
Tranicripton producei RA complementary to one itrand of NA
Tijdeni tranicripte dient n itreng van het NA ali template om een complementaire RA -itreng te
iynthetieren. Het RA -molecuul blijf niet gebonden aan het NA . Ne baienparing wordt meteen
verbroken waarna de originele NA -helix weer gevormd wordt.
RA polymeraie carry out tranicripton D6..1)
Tranicripte wordt uitgevoerd door RA -polymeraie. Vanaf de NA -template iynthetieert RA -
polymeraie nucleotde voor nucleotde een complementair RA -molecuul in een 5w naar 3w richtng. Ne
iubitraten voor RA -polymeraie zijn TP, CTP, UTP en GTP. Er kunnen meerdere RA -polymeraie
tegelijkertjd actef zijn op n gen, waarbij elke RA -polymeraie hetzelfde RA -molecuul iynthetieert,
maar op een verichillend moment ii geitart met tranicripte. Aet ali NA -polymeraie heef RA -
polymeraie een proofreading mechaniiche. Ne acteve plaati van RA -polymeraie kan namelijk verkeerd
gekoppelde nucleotden eruit knippen.
Verichillen tuiien NA -polymeraie en RA -polymeraie:
NA -polymeraie RA -polymeraie
Primer nodig. Geen primer nodig.
Aauwkeurig. Minder nauwkeurig.
Maakt het product in delen. Maakt het gehele product in n keer.
.
,Celli produce diferent categoriei of RA moleculei
Meiienger-RA wi DmRA wi) = Ne RA -moleculen die getranileerd worden naar eiwiten.
Aoncoding RA wi = RA wi die niet coderen voor eiwiten.
Type RA Functe
mRA Dmeiienger RA ) Coderen voor eiwiten.
rRA Driboiomal RA ) Vormen de baiiiitructuur van het riboioom en
katalyieren de eiwitiyntheie.
tRA Dtranifer RA ) Spelen een belangrijke rol bij de eiwitiyntheie ali
adaptor tuiien mRA en aminozuren.
inRA Dimall nuclear RA ) Functoneert in verichillende nucleaire proceiien,
zoali iplicing van pre-mRA .
inoRA Dimall nucleolar RA ) Helpt bij het bewerken en chemiich modifceren
van rRA .
miRA DmicroRA ) Reguleren genexpreiiie door tranilate van
ipecifeke mRA wi te blokkeren waarna deze
mRA wi afgebroken worden.
iiRA Dimall interfering RA ) Stoppen de genexpreiiie door de afraak van
ielecteve mRA wi en het tot itand brengen van
compacte chromatne itructuren.
piRA Dpiwi-interactng RA ) Binden aan piwi-eiwiten en beichermen daarmee
de kiemlijn tegen tranipoioni en andere
tranipoiitei.
lncRA Dlong noncoding RA ) Nienen veelal ali icafoldi. Reguleren verichillende
proceiien in de cel, zoali de deactvate van het X-
chromoiom.
Signali encoded in NA tell RA polymeraie where to itart and itop D6...)
Voor de initate van tranicripte in prokaryoten aiiocieert de iigmafactor met RA -polymeraie.
RA -polymeraie-holoenzym = RA -polymeraie gebonden aan de iigmafactor.
Promotor = Een NA -iequente die de itart van tranicripte aangeef.
.. RA -polymeraie-holoenzym glijdt over het NA .
2. li het de promotor tegenkomt zal RA -polymeraie-holoenzym itrak binden aan het NA .
3. Op de promotor wordt de dubbele NA -helix geopend door RA -polymeraie-holoenzym, waardoor
de tranicriptebubbel ontitaat.
4. Ne iigmafactor bindt aan de ene NA itreng en RA -polymeraie begint met de tranicripte van de
andere NA itreng Dtemplate itreng).
5. Abortive initiation
RA -polymeraie iynthetieert de eerite ten nucleotden m.b.v. het scrunching mechaniime. RA -
polymeraie blijf gebonden aan de promotor, terwijl het upitream NA richtng de active siee trekt.
Hierdoor ontitaat ipanning, wat ervoor kan zorgen dat het geiynthetieerde RA vrijkomt.
2
, 6. Uiteindelijk wordt bovenitaand procei overwonnen en
zorgt de ipanning ervoor dat het kernenzym DRA -
polymeraie) loibreekt van de promotor en dat de
iigmafactor diiiocieert.
7. Aucleotden worden n voor n gekoppeld in de
elongatefaie.
8. li RA -polymeraie een terminateiequente tegenkomt
Dterminator), itopt de tranicripte: RA -polymeraie laat
loi van het NA en RA en reaiiocieert met een
iigmafactor om RA -polymeraie-holoenzym te vormen.
Het terminateiignaal beitaat uit:
Een itukje -T nucleotdeparen.
Een tweevoud iymmetriiche NA iequente, dat in RA
een haaripeld vormt.
Tranicripton itart and itop iignali are heterogeneoui in nucleotde iequence D6..2, 6..3)
Een conieniuinucleotdeiequente D= Een volgorde van nucleotden waarin de meeit voorkomende
nucleotden in een iequente met dezelfde functe wordt weergegeven) komt tot itand door voor elke
poiite te bepalen welke nucleotde het vaakit op die plek wordt aangetrofen, ali je een groot aantal iterk
gelijkende promotori met elkaar vergelijkt. Ne iequente die hieruit iamengeiteld wordt, zegt dui niet dat
er individuele promotori beitaan die exact deze iequente bevaten. Toch ii de conieniuiiequente een
zeer belangrijke informatebron. Een vergelijking van de echte iequente met de conieniuiiequente geef
namelijk een indicate van de ‘iterktew van de promotor D= Het aantal initategebeurteniiien per
tjdieenheid per promotor).
Ne NA -iequentei van individuele bacteriële promotori en terminatori verichillen van elkaar. Hierdoor ii
de ‘iterktew van elke promotor en terminator anderi.
Ne nucleotdevolgorde van de promotor bepaalt hoeveel en welke chemiiche interactei er kunnen
ontitaan tuiien de nucleotden in de promotor en de eiwiten die op de promotor moeten binden. Hoe
meer interactemogelijkheden er zijn, hoe iterker de binding van de eiwiten en hoe groter de kani ii dat
er inderdaad tranicripte-initate zal plaativinden. Je zou dui kunnen zeggen dat bij een iterke promotor
de nucleotdenvolgorde Den dui de chemiiche iamenitelling) duidanig ii dat de benodigde eiwiten er
optmaal aan kunnen binden.
Promotoriequentei zijn aiymmetriich en dubbelitrengi. Nit zorgt ervoor dat RA -polymeraie ilechti op
n manier kan binden op het dubbelitrengi NA : alleen in die oriëntate kan het de juiite interactei met
het NA aangaan en de NA -helix openen. RA -polymeraie kan RA alleen iynthetieren van 5w naar 3w.
Hierdoor bepaalt de oriëntate van de promotor de richtng van tranicripte en dui welke itreng de
coderende itreng en welke itreng de template itreng ii.
In de afeelding hiernaait gebruiken de genen die getranicribeerd worden van linki naar rechti de
onderite NA itreng ali template. Ne genen die getranicribeerd worden van rechti naar linki gebruiken
de bovenite NA itreng ali template.
Tranicripton initaton in eukaryotei requirei many proteini
Bacteriën bevaten n type RA -polymeraie. Eukaryoten bevaten drie typen RA -polymeraie:
RA -polymeraie I: meeite riboiomale genen.
RA -polymeraie II: meeite genen incluiief eiwit-coderende genen.
3
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller anoukbmw. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.87. You're not tied to anything after your purchase.
