Volledige samenvatting van METABOLISME (biochemie)
86 views 1 purchase
Course
Biochemie
Institution
Universiteit Gent (UGent)
Volledige samenvatting van partim 'metabolisme' binnen het vak 'biochemie' (revaki ugent), gegeven door prof. dr. Karolien De Bosscher. Zelf gemaakt, gebruikt, én geslaagd! Bekijk zeker ook de voordeelbundel voor alle samenvattingen van biochemie. Succes!
BIOCHEMIE: HET METABOLISME
DEFINITIE VAN METABOLISME
INLEIDING
Begrippen
Metabolisme = stofwisseling = samenspel van chemische reacties in levend organisme
Katabolisme: afbraak, energiewervend
Metabole paden
Anabolisme: opbouw, energievragend
Centrale doelstellingen
Aanmaak van voldoende energie voor levensfuncties
Bouwstenen verwerven om moleculen te vervangen / om te groeien
Opslaan van verworven energie
Betrokken biomoleculen
Koolhydraten = suikers: energie en structuur
Lipiden = vetten: energie en membranen
Proteïnen = eiwitten: aminozuurpolymeren en functionele biomoleculen
Nucleïnezuren en nucleotiden: dragen informatie
Energieverbruik (ATP = adenosinetrifosfaat)
Basaal metabolisme voor levensfuncties
60% van totale energie-uitgave
Hart, hersenen, lever en nieren
Mechanische arbeid, ionenpompen en chemische synthese
Energie voor spijsverteringsapparaat
Energie voor skeletspieren
Er komt meer energie vrij bij de verbranding van vetzuren t.o.v. suikers
Hoe meer gereduceerd voor de verbranding, hoe meer energie er uit te halen valt bij
de verbranding tot CO2: vetzuren kunnen meer gereduceerd worden (er kunnen
meer zuurstoffen aan geplakt worden)
Voordelen van metabolisme gecontroleerd door cel
Opdeling in kleine stappen => lagere activeringsenergie
Energiedragers: NADH en FADH2
Herhaling: enzymhoofdgroepen
OXIDOREDUCTASEN: katalyseren biologische redoxreacties
Dehydrogenasen
Substraatoxidatie/-reductie
Elektronenacceptoren/-donoren bv. NAD + en NADP+
Oxidasen: O2 als elektronenacceptor
TRANSFERASEN: brengen functionele groep van molecule (donor) naar ander (acceptor)
Kinasen: transfer van –PO32-
Hexokinasen: brengen groep van ATP naar hexose (meestal glucose)
HYDROLASEN: katalyseren hydrolytische splitsing in substraat
H2O als cosubstraat!
Katalyseren hydrolyse van volgende bindingen: C-O, C-S, C-N, O-P
Subgroepen
1
, HYDROLASEN WERKING
Esterasen Werken op verschillende esterbindingen
Carboxylesterhydrolasen Splitsen CO–OR
Fosfatasen:
fosfomonoësterasen
fosfodiësterasen…
Glycosidasen Suikeroligo/-polymeer als substraat
Glycosidasen:
N-glycosidasen
O-glycosidasen…
Peptidasen/proteasen Splitsen peptidenbindingen in peptide en eiwit
Serineprotease: chymotrypsine
Sulfhydrylproteasen…
LYASEN: splitsen binding tss. C-C, C-N, C-O… via eliminatiereactie => dubbele binding of ring
Decarboxylasen: verwijderen CO2
Dehydratasen: verwijderen H2O
Aldolasen: verwijderen aldehyde
Koolzuuranhydrase: omgekeerde gekatalyseerde additiereactie (synthase)
ISOMERASEN: katalyseren omleggingen in één substraat => isomeer als product
Racemasen: D-vorm → L-vorm
Epimerasen: R-vorm → S-vorm (en vice versa)
Cis-transisomerasen: cisisomeer → transisomeer
Mutase: bv. glucose 1-fosfaat → glucose 6-fosfaat
LIGASEN of SYNTHETASEN: katalyseren bindingen tussen reagensmoleculen
Vereist input van chemische energie
Bv. glutamine-synthetase: vorming glutamine uit glutamaat en NH 3
METABOLE PADEN EN METABOLE FLUX
Definities
Metabole weg: enzymatische reacties om stof A te converteren naar stof B kennen logisch
verband en vastliggende structuur
Metabole flux = hoeveelheid moleculen van een bepaalde metaboliet die per tijdseenheid
per celhoeveelheid langs een bepaald punt van het metabole pad passeert, beïnvloed door
Beschikbaarheid en mate van enzymen
Concentratieverschillen substraat/reactieproduct
Diffusieafstanden en toegankelijkheid van enzym tot substraat
Fluxbepalende stap = irreversibele stap, meestal in begin van metabole traject
=> vermijden van moleculaire ‘file’
Metabole fluxen: selectief geregeld door onafhankelijke regeling van sleutelenzymes
Fluxcontrole: afgestemd op behoeften van cel of van organisme in totaliteit
Genexpressie van fluxcontrolerende enzymen
Modificatie van enzymen op eiwitniveau
Toegankelijkheid van enzymen voor substraat
2
,Katabole wegen: een 4-fasenplan voor netto
energievrijstelling
1. Vertering van macromoleculen tot hun
oorspronkelijke bouwstenen via hydrolyse
Gebeurt extracellulair, behalve
glycogenolyse (glycogeen →
glucose): in cytosol
Nodig: hydrolasen
2. Omzetting van boutstenen tot acetyl-CoA
Glucose → pyruvaat (glycolyse)
→ Ac-CoA
Nodig: transaminasen
3. Oxidatie van Ac-CoA tot CO2 in Krebscyclus
Levering van energierijke elektronen door NADH en FADH 2
4. Oxidatieve fosforylering
Exclusief katabool
ATP-productie
Anabole wegen: energie-eisende processen
Processen die hierin aan bod komen
Gluconeogenese
Glycogeensynthese
Vetzuursynthese
Cholesterolsynthese
Aminozuursynthese
Nucleotidensynthese
Nodig
Bouwstenen
Van lichaamseigen moleculen
Via essentiële voedingsstoffen
Energie: ATP
Reducerend vermogen: toegeleverd via NADPH
(ontstaat tijdens oxidatieve fase van pentosefosfaatweg)
Amphibole reacties: betrokken bij zowel katabole als anabole paden (bv. Krebscyclus)
CELLULAIRE LOKALISATIES VAN METABOLE PADEN
Fluxbepalende enzymen = onderhevig aan regulatiemechanismen
Regeling van hoeveelheid enzymmoleculen per cel
Regeling van enzymatische activiteit
Regeling van toegankelijkheid
Via tijdenlijk ‘verstoppen’
Via compartimentalisatie: lipidemembranen als ‘grenswachters’ (Z.O.Z.)
3
, AANGEBOREN METABOLE ZIEKTEN
Metabole ziekten = zeldzame
aandoeningen door genetisch
defect aan enzymcoderend gen
Functioneel tekort door
mutatie (‘inborn error’)
=> wijziging in (regeling
van) flux
=> substraten stapelen
zich op + tekort aan
metabolieten
=> slechte
functionering of sterven van weefsels/organen
Metabole ziekten kunnen ook selectief voordeel bieden
Bv. dragers van allel voor familiale glucose-6-fosfaat dehydrogenasedeficiëntie zijn
beschermd tegen malaria
Voorbeelden van metabole ziektes
Galactosemie: galactosesuikerafbraak niet mogelijk
Metabool syndroom
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller emch. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $9.17. You're not tied to anything after your purchase.
