Centrale dogma van de moleculaire biologie: DNA RNA eiwitten transcriptie translatie
DNA/RNA = base + cyclisch monosaccharide + fosfaatgroep
Base :
o Purine : Adenine, Guanine
o Pyrimidine : Cytosine, Thymine (DNA), Uracil (RNA)
Suikerstructuren :
o DNA : deoxyribofuranose (1 zuurstof minder dan RNA)
o RNA : ribofuranose
Base Nucleoside Nucleotide
Adenine Adenosine Adenylzuur
Ade Ado Adenosine monofosfaat
A A AMP
Guanine Guanosine Guanylzuur
Gua Guo Guanosine monofosfaat
G G GMP
Cytosine Cytidine Cytidylzuur
Cyt Cyd Cytidine monofosfaat
C C CMP
Thymine Thymidine Thymidylzuur
Thy Thd Thymidine monofosfaat
T T TMP
Uracil Uridine Uridylzuur
Ura Urd Uridine monofosfaat
U U UMP
Nucleoside = base + ribose
Nucleotide = nucleoside + fosfaatgroep
Fosfodiesterbinding : polymeren van nucleotide door binding tussen C3 van ribosering nucleotide X
en fosfaatgroep op C5 van nucleotide X+1
DNA
Watson-Crick model:
2 polynucleotideketens draaien rond gemeenschappelijke as tot dubbelhelix
2 strengen lopen antiparallel: 5’ -> 3’ / 3’ -> 5’
Basen in de kern, suiker-fosfaatgroepen periferie
Baseparing via waterstofbruggen
oThymine – Adenine (2 waterstofbruggen)
oCytosine – Guanine (3 waterstofbruggen)
, Negatieve lading door fosfaatgroep
Oppervlakte 2 groeven: een grote en een kleine
Lengte wordt beschreven volgens aantal baseparen (bp) of kilobasepaar (kb)
Andere helicale structuren:
B-DNA = model Watson-Crick
10 basenparen per draai
A-DNA
dehydraterende omstandigheden
bredere, plattere rechtsdraaiende helix
11 basenparen per draai
Grote holte in middelste van dubbelhelix
Vlakken van de basen 20° gedraaid tov as van de helix
Zeer brede grote groeve en ondiepe kleine groeve
Z-DNA
Linksdraaiende dubbele helix
12 basenparen per draai
Veel langer dan B-DNA
Diepe kleine groeve en bijna afwezige grote groeve
Regulatorische functie
Andere ruimtelijke structuren:
Gebogen DNA
4-6 adenines gescheiden door 10bp
Adeninesequenties rigide, andere flexibeler
Fundamenteel in DNA-eiwitinteracties (replicatie, transcriptie, recombinatie)
Herkenningssignaal voor DNA reparatie mechanismen
Cisplatine: anti-tumoraal antibioticum, vormt inter en intra strengbruggen in DNA
door vervanging van 2 CL atomen door N7 atomen van 2 guanines -> veroorzaakt
sterke buiging -> wordt herkend door DNA bindende eiwitten -> transcriptie en
apoptose
Kruisvormig DNA
Ontstaan uit inverted repeats
Naast controleregio’s of bij beginpunten van DNA-replicatie
Moleculaire schakelaars tussen replicatie en transcriptie
Verbreken waterstofbruggen tussen complementaire strengen en vorming intra-
streng waterstofbruggen -> kruisvormige structuur
Triple helix
Bevatten homopurine sequentie
Vrije posities voor H bruggen op N-7 en O-6 bij guanine, N-7 en NH 2-6 bij adenine
Specifieke condities: Hoogesteen of omgekeerde Hoogesteen base triplets
Hoogesteen waterstofbruggen: TAT en CGC
Omgekeerde Hoogesteen waterstofbruggen: GGC, AAT en TAT
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller lottehulselmans. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.74. You're not tied to anything after your purchase.
