100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Samenvatting De Cel - 5052CELX6Y $9.09
Add to cart

Summary

Samenvatting De Cel - 5052CELX6Y

 70 views  1 purchase
  • Course
  • Institution
  • Book

Samenvatting van het vak De Cel 5052CELX6Y gegeven in 2018 aan de Universiteit van Amsterdam. Boek: Essential Cell Biology vierde editie Zeer uitgebreide samenvatting!! Behaalde cijfer: 9,5

Preview 4 out of 88  pages

  • Unknown
  • January 7, 2019
  • 88
  • 2018/2019
  • Summary
avatar-seller
Day 2-1 Biomolecules
- Een groot deel van de moleculen in een cel bestaan uit koolstof atomen
o Koolstof is in staat om grote moleculen te vormen; 4 elektronen in schil dus
vormt 4 covalente bindingen. C-C bindingen covalent en stabiel
- Organic molecules; moleculen met koolstof verbindingen
- Inorganic molecules; moleculen zonder koolstof verbindingen, H2O
- Chemical groups; atoomcombinaties met hun eigen chemische en fysische
eigenschappen
o Methyl (CH3), hydoxyl (OH), carboxyl (COOH), carbonyl (C=O), posphoryl
(PO32-), amino (NH2)

- Organische moleculen van een cel in opgeloste vorm vrij in cytosol
- Meer macromoleculen aanwezig dan kleine moleculen
- Sommigen moleculen hebben meer dan één functie in de cel;
o Monomeren voor het maken van macromoleculen, eiwiten
o Energiebronnen dmv afraak in kleine moleculen
- Onderdelen van een cel zijn chemisch gerelateerd; afgebroken en gemaakt van
zelfde onderdelen en weinig variatie van chemische reacties die dat doen.
- Cellen bevaten 4 families van kleine organische moleculen; sugars, faty acids,
amino acids en nucleotides. --> vormen bouwstenen van macromoleculen en/of
energiebronnen.
o Sugars ; polysaccharides, glycogen en starch
o Faty acids; fats en membrane lipids
o Amino acids ; proteins
o Nucleotides; nucleic acids
Sugars
- Carbohydrates (monosaccharides); algemene formule is (CH2O)n
- Functie >> productie en opslag energie en ondersteuning van cel.
- Isomers; moleculen met dezelfde chemische formule maar een ander structuur, dus
formule alleen bepaalt niet het molecuul
- Optical isomers; gespiegelde isomeren; D-vorm en L-vorm
- Isomeren zorgen voor veel variatie onder de suikers.
- Glycosidic >> covalente binding om monosaccharides te vormen tot carbohyrates.
2 monosacchardis >> disaccharide
- Oligosaccharides en polysaccharides >> grote suiker polymeren van meerdere
monosaccharides
- Oligo- ; 2-10 monomeren en poly-; honderden duizenden monomeren
- Condensation reaction ; glycosidic verbinding gevormd tussen suikers door
verbinding tussen de OH- groepen waarbij water vrijkomt. Geldt ook voor proteins
en nucleic acids

, - Hydrolysis; verbinding tussen de suikers, glycosidic, verbreken mbv water
- Kunnen vertakkingen en veel verschillende structuren vormen door de vele OH-
groepen aan een monosaccharide.
- Monosaccharide glucose meest gebruikte energiebron door cel en de polysacharide
daarvan glycogen(dier)/starch (plant) worden gebruikt als reservevoorraad voor
energie.
- Zorgen ook voor ondersteuning van cel >> cellulose voor vormen celwand is
polysacharide van glucose en chitin voor exoskelet insect en celwand schimmel is
ook een polysacharide.
- Oligosaccharides vormen glycolipids/proteins in celmembraan>> beschermen
celoppervlak, hechten van cellen en verschillende combinatie zorgt voor
bloedgroepen. Ook cel herkenning
- Cellulose is meest voorkomende organische molecuul

Faty acids
- Zijn amphipathic; hebben een hydrophobic hydrocarbon tail en een hydrophilic
carboxylic acid head, waarmee ze verbinden aan andere moleculen.
- Verschillen alleen in de lengte en het aantal dubbele bindingen en de positie daarvan
in de hydrocarbon tail. Dit bepaalt daarom de eigenschappen ervan.
- Unsaturated veroozaakt knikken wat invloed heef op de compactheid en daarmee
de hardheid van veten en membrane fuidity.
- Faty acids in cytoplasma--> druppel van triacylglycerol (hydrofoob) --> 3 faty acid
chains en glycerol molecuul
- Ook energiebron door de afraak van de faty acids chains van de triacylglycerol.
- Saturated faty acids in vlees en melkproducten, unsaturated in plant olie -->
vloeibaar kampertemp.
- Saturated faty acids niet gezond--> stijging van cholesterol gehalte -->
atherosclerose
- Zijn onderdeel van de lipid bilayer --> de hydrofobe staarten van lipiden zijn faty
acids
- Phospholipids --> hydrofoob staart; 2 faty acid chains en glycerol,
hydrofel kop; fosfaatgroep en choline

Amino acids
- Bestaan uit amino en carboxyl-group en side chain (R) aan alfa C-atoom.
- Side chain maakt onderscheid tussen aminozuren, 20 soorten --> belangrijk voor
eiwitunctie
- In cytoplasma met pH van 7 in geïoniseerde vorm
- Bouwstenen van eiwiten (polypeptide), dmv peptide bonds gevormd door
condensation reaction
- Polypeptides zijn chemisch polair --> amino groep aan N-terminus en carboxyl- groep
aan C-terminus

, Volgorde altijd gelezen vanaf N-terminus
- Hebben ook optical isomers; alleen L-vorm in eiwiten

Nucleotides
- Het zijn de bouwstenen van DNA en RNA en komen voor als deoxyribonucleotides en
ribonucleotides.
- Het zijn nucleosides (ribose/deoxyribose met een base) met een of meerdere
fosfaatgroepen; suikerfosfaatgroep met covalente binding aan base.
- Pyrimidines; één ring met 6 atomen; Cytosine, Uracil en Thymine
- Purines; Twee ringen met een van 6 atomen en een van 5 atomen; Guanine en
Adenine
- Functie: nucleotiden kunnen energie dragen zoals de ribonucleotide adenosine
triphophate, ATP en ze kunnen ook zorgen voor de overdracht van chemische
groepen en bewaren van biologische informatie.
- De fosfaten in ATP zijn verbonden door phosphoanhydride bonds, het verbreken van
deze verbindingen mbv hydrolyse levert veel energie
- Energie voor het maken van ATP --> oxidatie van voedsel of mbv zonlicht (planten)
- Nucleic acids --> polymeren opgebouwd uit nucleotides die door phosphodiester
bindingen tussen de 3’ OH-groep en de 5’ PO3- groep zijn gevormd. Als het
opgebouwd is uit nucleoside triphosphates dan komt er tijdens de
condensatiereactie naast water ook pyrophosphate vrij.
- Twee verschillende soorten nucleic acids afankelijk van het soort suiker;

o Ribose --> RNA, enkelstrengs
o deoxyribose --> DNA ( OH- groep vervangen door H-groep), dubbelstrengs
- Lineaire volgorde van de nucleotides --> genetische informatie

Macromolecules in cells
- Macromoleculen zoals polysaccharides, eiwiten en nucleic acids zijn polymeren
gemaakt uit monomeren die door covalente bindingen gebonden zijn.
- Eiwiten zijn veelzijdig en veel functies;
o Enzymen, katalyseren reactie
o Bouwstenen voor structuur componenten, cytoskelet
o Moleculaire motoren; kracht en beweging produceren, myosin
- Elke polymeer groeit door het verbinden van monomeren aan een eind dmv
condensation reactions die gekatalyseerd worden door enzymen.
- De eenheden van een polymeerketen worden gerangschikt volgens een volgorde,
Sequence, die de functie bepaalt. Door variatie in sequence zijn er veel polymeren
mogelijk.

, - Covalente bindingen in een macromolecuul zorgen voor fexibiliteit van het
polymeer, doordat de atomen kunnen roteren --> het polymeer gaat conformaties
aan mbv warmte energie
- Noncovalente bindingen belangrijk voor functie en structuur van macromolecuul --
>zorgen voor stabiele conformatie --> bepaalt activiteit en interacties met
moleculen
- Verbreking noncovalente bindingen --> fexibiel en verliezen vaste conformatie en
daarmee functie
- Noncovalente bindingen;
o Electrostatic atractions: zwak in water door partiile ladingen water
o Hydrogen bonds: belangrijk vouwen polypeptide en DNA strengen
hechten
o Van der Waals atractions: elektrische aantrekking atomen, zwakker
dan hydrogen bonds, belangrijk aantrekking complementaire
macromoleculen
o Hydrophobic interaction: hydrofobe delen dicht op elkaar om
hydrofele interactie niet te belemmeren (H-bruggen), belangrijke rol
lipiden in membraan
- Covalente bindingen zorgen ervoor dat kleine moleculen zich hechten tot
macromoleculen en noncovalente bindingen zorgen ervoor dat macromoleculen met
elkaar hechten of kleine moleculen.
- Individuleel zijn noncovalente bindingen zwak, maar tussen macromoleculen die
goed hechten zorgen ze voor sterke aanhechting --> afankelijk aantal noncovalente
bindingen.
- Noncolvalent bindingen zorgen ervoor dat eiwiten als enzymen kunnen werken,
enzymsubstraat



Protein structure and function
- Eiwiten zijn de bouwstenen van een cel en zorgen voor vorm, structuur en voeren
veel functies uit ---> komen door de verschillende vormen die ze aannemen
o Enzymen; katalyseren vorming of verbreking van covalente bindingen
o Structural proteins; ondersteunen cel en weefsel (collageen, elastin, tubilin)
o Transport proteins; dragen kleine moleculen of ionen (hemoglobine)
o Motor proteins; regelen beweging in de cel en weefsel (kinesin en dynein)
o Storage proteins; bewaren aminozuren of ionen (ijzer)
o Signal proteins; dragen extracellulaire signalen van cel naar cel
(hormonen/insuline)
o Receptor proteins; nemen signalen waar en brengen over naar reactie
mechanisme (rhodopsin, licht waarnemen)
o Gene regulatory proteins; binden aan DNA om genen aan en uit te zeten

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller hilos24. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $9.09. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

48756 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling
$9.09  1x  sold
  • (0)
Add to cart
Added