Cel IV : Moleculaire biologie en genetica (D012574A)
All documents for this subject (7)
Seller
Follow
marthemoors
Content preview
3 GENOOM ORGANISATIE EN EVOLUTIE
3.1 VELE GENOOMSEQUENTIES ZIJN ONTRAFELD
• Genoom = al het genetisch materiaal van een organisme
• In een cel ziet DNA eruit als chromosomen
• Genomen ontrafelen
o Genoomsequenties bepalen
o Men tracht aan te geven wat de functie per genoomsequentie is
o Alle experimentele info wordt verzameld over de hele wereld
o Zoekrobots
• Ontdekking: prokaryoten bestaan uit 2 klassen: (eu)bacteria + archaea
o Gefocust op ribosomale DNAs
• In multicellulaire organismen bevat elke cel een identieke versie van het genoom!!!!
o Er zijn hier wel wat afwijkingen op bij ziekten (dus geen normale cellen) (bv bij
downsyndroom), maar ook gewone uitzonderingen
▪ Gameten (want zijn haploïd)
▪ Rode bloedcellen (want hebben geen kern)
▪ Witte bloedcellen: B en T cellen (recombinaties)
o Heeft wetenschappers aangezet tot onderzoek naar klonen: Dolly het schaap
▪ Ondertussen mogelijk om mens te kloneren: heeeeeel kleine slagingskans
▪ Ethisch verantwoord? NEEN
• Grootte van genomen verschilt bij complexiteit van organisme
o Virus < bacterie < insect < vis < zoogdier (over het algemeen)
o Er zijn uitzonderingen: C-valueparadox
▪ C-value = grootte vh haploïd genoom
▪ Men heeft gezien dat het niet zo is dat een grote c-value correleert met de
complexiteit van een organisme
3.2 VARIATIES IN GENOOMORGANISATIE
• Virale genomen zijn over het algemeen zeer klein: kunnen verschillende vormen aannemen:
o Dubbelstrengig circulair
o Enkelstrengig circulair
o Dubbelstrengig lineair
o Enkelstrengig lineair
• Bacteriën
o Dubbelstrengig circulair
• Eukaryoten
o Dubbelstrengig lineair
• Zelfs soorten met verschillende aantallen chromosomen, zal nog steeds dezelfde info te vinden zijn,
maar doorheen de evolutie op verschillende plekken terechtgekomen zijn = syntenie
, • Wat is een gen?
o Vroeger: stukjes in DNA waar de code inzit voor een eiwit
▪ Gen => mRNA => eiwit => functie
o Ondertussen weten we dat ook RNAs functioneel zijn
▪ Gen => ncRNA => functie
o Startcodon (Methionine) en stopcodons (TAA bijvoorbeeld)
o Genoom: veel intergenisch materiaal: stukken tussen genen waar er geen directe functionele
sequenties inzitten
▪ Bij eukaryoten nog complexer: genen opgebouwd uit exonen en intronen
▪ Die intronen moeten daar nog uit: splicing
• Exonen + intronen = DNA
• Intronen = niet-coderend DNA
• Overgeschreven exonen + intronen = RNA
• Overgeschreven exonen = mRNA
o Eiwitadressering = mechanismen die ervoor zorgen dat eiwitten op de juiste plaats in een cel
terechtkomen:
▪ Een eukaryoot heeft veel meer genen die instaan voor eiwitadressering
▪ Prokaryoot heeft niet al die complexe orgaanstelsels => veel meer regulatie nodig bij
prokaryoten dan bij eukaryoten
3.3 EUKARYOTE GENOMEN BEVAT TEN VEEL REPETITIEF DNA
• 3 soorten DNA
o Repetitief DNA
o Gemiddeld repetitief DNA
o Uniek DNA
• Repeats
o Interspersed repeats (gwn allemaal random gelegen stukjes die herhaald worden)
▪ (Retro)transposons (= zijn geïntegreerd en zijn verplaatst over het genoom
▪ Onderverdeeld op basis van lengte
• SINE, LINE (short/long interspersed nuclear elements)
• Bekend: LINE-1, Alu
• Functie? “Selfish” parasitair DNA
o Tandemly repeated DNA (herhaalde stukjes die achter elkaar liggen) = satelliet DNA
▪ Waarom satelliet DNA? => onderscheidbaar vd rest van het genoom dmv densiteit
• Densiteit verschilt omdat die satellietDNAs een lager GC-percentage hebben
dan het gemiddelde DNA in ons genoom
• Betekent ook dat je ze kan onderscheiden van de bulk van het genoom
wanneer je een densiteitscentrifugatie doet (populaties DNA met
verschillende densiteiten onderscheiden
▪ Waar tandemly repeated DNA?
• Thv centromeren en telomeren
• Ribosomale RNAs
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller marthemoors. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.51. You're not tied to anything after your purchase.