Summary
Biochemie samenvatting hoorcollege 1-7 en boek general organic, and biological chemistry
- Course
- Institution
- Book
samenvatting van alle hoorcolleges stof uit het boek van Biochemie voor de DBG 2.2 in blok 2.2
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
3 reviews
By: daandevleeschouwer • 5 year ago
By: peterjanlp • 5 year ago
By: floordejong57 • 5 year ago
Seller
Follow
JeffreydeBruin
Reviews received
Content preview
Hoorcollege 1 biochemie:Start metabolisme:
Metabolisme = chemische reactes oor energie
- katabool: afraak koolhhydraten eten en er olgens afreken)
- anabool: opbouw
Stap 1 metabolisme: ertering en hhydrolhse
Stap 2 metabolisme: ertering en sommige zuurstof reactes in kleinere moleculen
Stap 3 metabolisme: inydt plaats in yde mitochonydriën ) hier haal je yde energie uit oeyding
Alles wat je afreekt eiwitenn koolhhydraten en eten worydt uiteinydelijk acethl-CoA ydie belangrijk
is in yde citroenzuurchclus waar energie uit worydt gehaalyd in yde orm an ATP. Naast ATP ontstaat er
ook NADH en FADH2
Acetyl CoA:
=O
C-C ~ SCoA
~ = energie rijke binyding
Citroenzuur = 6 C
Een acethl CoA heef 2 en moet ydus 6 C hebbenn ydus gaat ydie samen met oxaalazijnzuur OAA)n
er olgens woryden het 6C en gaat het yde citroenzuur chclus in. Maar heb je olydoenyde energie ydan
gaat yde acethl CoA o er in et. Dus heb je energie noydg ydan koppelt elke acethl CoA met een
oxaalazijnzuur.
Oxaalazijnzuur is een katalhsator want hij koppelt aan acethl CoA gaat yde citroenzuur chclus in maar
worydt hier niet gebruikt en komt weer terug. Dus kun je oxaalazijnzuur weer gebruiken.
ATP:
1 aydenosine ydeeltje bestaat weer uit aydenine ydie koppelt aan een suiker ribose)
3 fosfaat ydeeltjes
ATP houydt energie ast omydat het 3 fosfaat groepen heef. Door hhydrolhse water) gaat er 1 fosfaat
groep weg en krijg je ADPn en omydat er een fosfaat groep afgehaalyd worydt komt er energie rij en
ydan heb je ADP + P + 7n3 kcal/ mol energie komt er rij oor het lichaam.
Dit kan ydie 1 keer ydoen maar ook 2x ydan splitsen er ydus 2 fosfaat groepen af
Co-enzymen: er zijn 2 ydie in yde citroenzuur chclus oorkomen:
NAD+ kan 2 h’tjes opnemen en ydan worydt het een NADH + H+ en ydit houydt eel energie ast. Die
H’tjes gaat ie uiteinydelijk ergens inle eren waar energie rij komt.
Geoxiydeeryde orm: NAD +
Gereyduceeryde orm: NADH + H+
Met FAD is het hetzelfyde erhaal
Oxidatieve fosforylering: yde H springen o er naar een sterkere oxiydator)
- yde oxiydator NAD+ ontrekt 2H aan een substraat SH2)
- ydeze 2 elektronen woryden eryderop gesplitst in 2H+ en 2 elektronen
- ydeze 2 elektronen woryden in yde ketenn sprongsgewijs op een steeyds sterkere oxiydator o ergeydragen
- als laatste op yde sterkste oxiydator en ydat is zuurstof. Het ge ormyde O2- ion koppelt met yde 2H+
ionen tot water
- yde elektronen o erydracht naar een steeyds sterkere oxiydator
OVERNEMEN VAN DE PP BELANGRIJK !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
,Co enzymen:
NADH + H+ + 0n5O2 +3ADP + 3P NAD+ + H2O + 3ATP
FADH2 + 0n5O2 + 2ADP + 2P FAD + H2O + 2ATP
FAD le ert maar 2 ATP omydat FAD eryderop in yde keten pas een oxiydator inydt ydie sterker is ydan
hemzelf. Want FAD is zelf al een reydelijk sterke oxiydator.
Citroenzuurcyclus:
- start met een acethl-CoA koppelt met een oxaalazijnzuur waaruit citroenzuur ontstaat het start met
6C en einydigyd met 4C oxaalazijnzuur) ydus raakt op 2 stappen in yde chclus 1 C kwijt in yde orm an
CO2.
Lastge uitleg:
Je begint met acethl CoA koppelt aan oxaalazijnzuur tot citroenzuur bij ydeze koppleing splitst CoA af.
En hou je 6C afn bij yde olgenyde stap splitst er een CO2 af en worydt het ydus 5Cn en hier komen er ook
2 H rij hierbij bieyd het co-enzhm NAD zich aan en ormt NADH + H+. er olegsn gaan we an het C5
ydeeltje naar een 4C ydeeltje waarbj er ook weer 2H afsplitsen en bieyd NAD zich weer aan. Ver olgens
gaat C4 eryder gaat nog een aantal stappen en er komt ergens energie rij en er ontstaat een GTP
hetzelfyde als ATP maar ydan G ip A) ydeeltje en ydie GTP is nog geen energie maar geef zijn fosfaat
groep af een ADP en je krijgt ydan ATP. Ver olgens nog een aantal plaatsen en er komt ook een FAD
ydeeltje langs oor 2Hn er olgens bieyd zich nog ergens een NAD+ aan oor weer 2H. ydus er woryden
op 4 plekken 2 H weggege en. Dus er onstaatn 3 NADH+ H+ ydeeltjes en 1 FADH 2. Hierbij woryden er
ydus 12 ATP ge ormyd uit ydeze chclus.
Samenvatting boek (Timberlake) H22 paragraaf 22.1 metabolisme en energie:
De term metabolisme betekent alle chemische reactes ydie energie noydig hebben en yde substantes
ydie noydig zijn oor celgroei. Er zijn 2 thpe metabole reactes:
Katabole reacties: complexe moleculen woryden afgebroken tot kleine waarbij energie rij komt
Anabole reacties: energie in yde cel worydt gebruikt om kleine moleculen op te bouwen tot grotere.
Katabole reacties gebeurt in 3 stages:
- stage 1: begint met ertering waarbij enzhmen grotere moleculen in kleine moleculen knippen ydoor
miydydel an hhydrolhse. Polhsachariyde monosachariydenn Fat glhcerol en etzurenn eiwiten
aminozuren. Deze proyducten ydifunyderen in yde bloeydstroom en gaan naar yde cellen.
- Stage 2: hier gaat yde ertering eryder en woryden ze nog eryder afgebroken tot 2 en 3 atoom
binydingen zoals phru aat en acethl CoA
- Stage 3: yde belangrijke proyducte an energie inydt plaats in yde mitochonydriën waarin het yde
citroenzuurchclus ingaat samen met yde co-enzhmen NADHn NADPHn FADH2. Zolang yde cellen zuurstof
hebben woryden yde waterstofonen en elektronen an yde co-enzhmen uitgewisselyd naar elektron
transport om ATP te maken.
Celstructuren voor metabolisme:
COMPONENT FUCNTIE
CELMEMBRAAN Scheiydt yde cel an zijn omge ing en be at structuren om met anydere cellen te
communiceren
CYTOSOL Is het loeibare geydeelte an het chtoplasman be at enzhmen oor ele
reactes an yde cel
LYSOSOOM Be at enzhmen oor ertering en rechclen an ouyde cel structuren
MITOCHONDRIË Be at yde structuren oor shnthese an ATP ydoor energie proyducerenyde
N reactes
NUCLEUS Be at genetsche informate oor DNA replicate en yde shnthese an eiwiten
, RIBOSOOM Hier gebeurt yde eiwit shnthese met gebruikt an het mRNA
In onze cellenn yde energie ydie rijkomt ydoor oxiydate an ydatgene an wat we eten is opgeslagen in
hoge energieke binydingen genaamyd ATP aydenosine trifosfaat) het ATP molecuul bestaat uit 1 base
aydeninen en ribose suiker en 3 fosfaat groepen.
Hydrolyse van ATP:
ATP onydergaat hhydrolhse hierbij worydt 1 fosfaat groep afgebroken. Ver olgens worydt ATP ADP. De
losgelaten Pi is noydig oor cel metabolisme. De hhydrolhse an ATP kan 7.3 kcal/mol maken of
31kJ/mol. De losse Pi is ook wel HPO4-2 een niet organisch groep.
De ADP kan nog een keer hhydrolhseren tot AMP. Wat ook weer 7n3 kcal/mol of 31 kJ/mol ople ert.
Elke keer als we onze spieren aanspannenn substantes ydoor membranen ydooratenn signalen
ydoorge en en shnthese ydoen gebruiken we ATP.
Wanneer we oeydsel innemen worydt ADP worydt aan elkaar gemaakt met P tot ATPn om er olgens
weer gebruikt te woryden.
Paragraaf 22.2: belangrijke co-enzymen in de metabolisme:
Een co-enzhm ydat H atomen en elektronen krijgt is gereyduceeryd. En een co-enzhm ydat h atomen en
elektronen erliest aan een substraat is geoxiydeeryd. Oxiydate reactes proyduceren energie en
reyducte reactes hebben energie noydig.
Oxidatie Reductie
Verlies an elektronen e-) Krijgen an elektronen
Verliest an waterstof atomen H of H+) Krijgen an waterstof atomen H of H+)
Krijgen an zuurstof Verlies an zuurstof
Proyduceeryd energie Verliest energie
NAD+ (nicotinamide adenine dinucleotide):
Is een belangrijk co-enzhm waarbij yde itamine niancine yde nicotnamiyde groep bieydt. Wat ast zit
aan een ribose molecuul en yde nucleotyde ADP. De geoxiydeeryde orm an NAD+ onydergaat een
reacte wanneer een C atoom in yde nicotnamiyde ring reageert met 2 H atomen. Waarydoor het NADH
+ H+ worydt yde gereyduceeryde orm an NAD+)
Foto boek
NADP+ is een co-enzhm ydie gebruikt worydt in anabole reactes zoals et en nucleïnezuur shnthese.
Het NADP+ is bijna gelijk aan NAD+ alleen in plaats an 2 H atomen is er een fofaat groep. De
gereyduceeryde orm an NADP+ is NADPH.
FAD (flavin adenine dinucleotide):
Is een co-enzhm ydat yde nucleotyde aydenosine ydifosfaat en ribofa ine be at. Ribofa ine B2) bestaat
uit ribitol suiker alcohol) en fa in. De geoxiydeeryde orm FAD onydergaat een reacte wanneer 2 N
atomen in het fa in geydeelte reageert met 2 H atomen tot yde gereyduceeryde orm FADH2.
Foto boek
Co-enzym A (CoA):
Dit co-enzhm bestaat uit pantothenic zuur B5)n fosfaat ADP en aminoethanolhiol. Een belangrijke
functe an CoA is om klein achl groepen oor te bereiyden oor reactes met enzhmen. Het reacte e
an CoA enzhm is yde thiol -SH) wat een erbinyding aangaat met 2 C acethl groepen om het
energierijke acethl CoA te proyduceren.
Foto boek
Type metabole reacties:
Foto boek
, Hoofdstuk 23 paragraaf 1 de citroenzuur cyclus:
De citroenzuur chclus is een serie an reactes. De citroenzuur chclus gebruikt 2-C-acethl groepen an
Acethl CoA om CO2 te proyduceren en reyduceeryd yde co-enzhmen NADH en FADH2. De
citroenzuurchclus is genaamyd oor yde 6-C citroen ion an citroenzuur C6H8O7).
6 C atomen bewegen ydoor 8 reactes in yde citroenzuurchclus. In yde chclus worydt CO2 geproyduceerydn
3x NADHn 1x FADH2n 1x ATP. De reactes ydie in yde chclus oorkomen zijn: conydensaten hhydraten
oxiydaten reyducte en hhydrolhse. Bij elke beurt worydt er een C afgehaalyd.
Reactie 1: (vorming citroenzuur):
hier koppelt oxaalazijnzuur aan acethl CoA en krijg je citroenzuur 6C) + co-enzhm A CoA) yde energie
om citroenzuur te ormen komt ydoor yde hhydrolhse an yde hoge energie thioester binyding in acethl
CoA. Dus uit proyduct bij yde 1e reacte is citroenzuur C6H8O6) + CoA ydeze splitst ydus af).
Reactie 2: isomerisatie:
De citroenzuur in reacte 1 is een tertaire alcohol ydie niet geoxiydeeryd kan woryden. In reacte 2 worydt
citroenzuur gerangschikt tot zijn isomeer isocitroenzuurn een secunydaire alcohol ydat wel geoxiydeeryd
kan woryden. Het enzhm acenitase katalhseert yde ydehhydrate an citroenzuur naar Cis-aconitate wat
worydt ge olgyd ydoor een hhydrate ydat isocitraat ormt een secunydaire alcohol. Hier heb je nog 6C.
Reactie 3: oxidatie en decarboxylisatie:
De secunydaire alcohol groep in isocitrate 6C) worydt geoxiydeeryd tot een keton ydoor isocitrate
ydehhydrogenase. Een ydecarboxhlisate erwijyderyd 1 C an isotrate ydoor omzetng an een carboxhlaat
groep COO-) naar een CO2 molecuul. Ver olgens worydt het ydus niet 6c maar 5C en noem je het a-
ketoglutarate. Tijydens yde oxiydate erwijyderyd een ydehhydrogenase ionen H) en elektronen ydie
gebruikt woryden om NAD+ te reyduceren naar NADH + H+.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller JeffreydeBruin. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.97. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
64438 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now