Summary
Samenvatting - Metabolisme en metabole regeling Hoofdstuk 2
- Course
- Institution
Samenvatting Hoofdstuk 2 Metabolisme
[Show more]
Seller
Follow
n280405
Content preview
2. Enzymen2.1 Algemene inleiding
2.1.1 Wat zijn enzymen
(A) zijn eiwitten die kunnen optreden als katalyst voor bepaalde reacties hebben active
site waar substraat bindt en reactie plaatsvindt. Daar kunnen ook cofactoren gebonden zijn
= niet-proteïnefactoren die enzym nodig heeft voor katalytische functie uit te voeren
(B) substraat vormt bindingen met AZ-residu’s in katalytisch domein induceert vaak
conformatieverandering in de katalytische site
(C)functionele groepen v/d AZ en v/d cofactoren nemen deel aan reactie. Tijdens reactie
vormt het enzym een complex met de transitietoestand v/h substraat dat gestabiliseerd
wordt doordat het enzym additionele bindingsmogelijkheden heeft voor binding aan de
transitietoestand.
(D) De reactieproducten dissociëren, het enzym keert terug naar oorspronkelijke
conformatie. (figuur 2.1 p.41)
2.1.2 Typische eigenschappen van enzymen: katalytische sterkte, specificiteit en regeling
- Katalytische sterkte: verhouding reactiesnelheid in aanwezigheid enzym t.o.v.
afwezigheid
- Specifiek: geen enkele substraatmolecule wordt omgezet via zijreacties,
specificiteit wordt verkregen door zeer intieme interacties tussen enzymen en hun
substraten door een structurele complementariteit.
- Regelbaarheid van werking: vb. reversibele proteïne fosforylering, allosterie, G-
proteinen, proteolyse, lokalisatie, eiwitexpressie
2.1.3 de meeste enzymen zijn eiwitten
Ook reacties gekatalyseerd door RNA: katalytische RNA/ ribozymes voldoen aan
enzymatische criteria: substraatspecifiek, verhogen reactiesnelheid, komen onveranderd uit
reactie MAAR hun katalytische efficiëntie niet zo hoog als die van eiwitten.
2.1.4 Nomenclatuur van enzymen
Veel genoemd naar substraat van hun reactie en/of naam van hun werking met daarachter
het suffix ‘-ase’
Sommige hebben triviaalnaam vb.: trypsine of papaïne
Nood aan universele naamsysteem v/d Enzyme Commission: verdeelt de enzymen is 6
klassen elk met subklasse gebaseerd op de reactie die wordt gekatalyseerd:
1. Oxidoreductase 3. Hydrolase 5. Isomerase
2. Transferase 4. Lyase 6. Ligase
elk enzym krijgt viercijferige naam en een enzymatische naam , die de reactie die erdoor
wordt gekatalyseerd identificeert
Vb: ATP + D-glucose ADP + D-glucose-6-fosfaat
enzym: ATP:glucose fosfotransferase (2.7.1.1, hexokinase)
1e cijfer (2) = de klassenaam (transferase),
2e cijfer (7) = de subklasse (fosfotransferase),
3e cijfer (1) = duidt aan dat het gaat om fosfotransferase met hydroxylgroep als acceptor,
4e cijfer (1) = geeft weer dat D-glucose de fosforylgroepacceptor is
Triviaalnaam = hexokinase
2.1.5 Opbouw van enzymen
, Cofactoren kunnen anorganische ionen zijn (Fe2+, Mg2+, Mn2+, Zn2+) of kunnen meer complexe
organische moleculen (= co-enzymen: zij functioneren als transiënte carriers van specifieke
functionele groepen) zijn. Sommige enzymen hebben als cofactor zowel een metaal als een
co-enzym.
Prothetische groep: Co-enzym of metaalion + enzym covalent aan elkaar gebonden
Holo-enzym: enzym + cofactor
Apo-enzym: eiwit gedeelte van een halo-enzym, dus halo-enzym – cofactor
Zijn vaak afgeleid van vitamine: organische voedingsbestanddelen die in kleine
hoeveelheden in het dieet aanwezig zijn
CO-ENZYM VITAMINEBRON METABOLEROL N/P
Groepstransfe ATP - Transfervanfosforylofnucleotidylgroepen N
r co-enzymen co-enzymeA Panthotenzur Transfervanacylgroepen N
(vitamineB3)
thiaminepyrofosfat(TP) Thiamine(vitamin Transfervantwekolstofragmentendieencarbonylgr P
e oep
B1) bevaten(bvaldehyden)
Pyridoxalfosfat(PLP) Pyridoxine Transfervanaminogroepenvanennar P
(vitamineB6) aminozuren
Biotine Biotine ATP- P
afhankelijkecarboxyleringvansubstratenofcarb
oxyltransfer
tusensubstraten
Tetrahydrofolat Foliumzur Transfervan1- N
kolstofgroepen,voralformylenhydroxymethyl
groepen.VorzietbvdemethylgroepvorthymineinDN
A
S-Adenosylmethionine - Transfervanmethylgroepen N
Uridinedifosfatglucose - Transfervanglycosylgroepen N
Adenosylcobalamine Cobalamine TransfervanHatomenenalkylgroepen P
Redoxco- NAD+enNADP+ Niacine Transfervanhydrideionen(:H-)inredox-reacties N
enzymen FMNenFAD Riboflavine Transfervan1of2e-inredoxreacties P
(vitamineB2)
Lipoamide - OxidatievanenhydroxyalkylgroepvanTP P
gevolgddortransfer
alsenacylgroep
Ubiquinone(co- - Lipideoplosbareelektroncarier N
enzymeQ)
Haem -
Varia Retinal VitamineA Zicht P
VitamineK VitamineK Carboxyleringvanbepaldeglutamatresidu’s P
2.2 Werkingsmechanismen van enzymen
Het enzym- substraatcomplex is centraal voor alle enzymwerking is het startpunt waarvan
je vertrekt voor de mathematische beschrijvingen van de kinetiek van enzym gekatalyseerde
reacties en voor de theoretische beschrijving v/d enzymmechanismen.
2.2.1 Thermodynamische beschouwingen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller n280405. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.28. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
56326 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now