Samenvatting - Biochemie - Van Lint - Tandheelkunde/BMW
18 views 0 purchase
Course
Biochemie en moleculaire biologie (E08X3A)
Institution
Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Geen zin om een samenvatting te maken en geen zin om tijd te steken in het boek van biochemie? Dan is deze samenvatting perfect voor jou!
Dit is een samenvatting van het boek van Biochemie geschreven door prof. Van Lint. Ook staan er extra dingen bij die in de ppt's tijdens de les zijn gezegd e...
H1 BIOMOLECULEN
20 AMINOZUREN
1. Non-polair, alifatisch
- Glycine (Gly)
o Niet-asymmetrisch
o Geen zijketen (H)
o Conformationele flexibiliteit
- Alanine (Ala), Valine (Val), Leucine (Leu), Isoleucine (Ile), Mathionine (Met)
o Inert, alifatisch
o Non-polair, hydrofoob
o Geen functionele groepen
o Clusteren zijketens -> structuur stabiliseren (hydrofobe interacties)
o Verschillende vormen -> structuur door ruimte
2. Aromatisch
- Fenylaline (Phe)
o Benzeenring
o Hydrofoob, weinig reactief
o Apolair
- Tyrosine (Tyr)
o Intermediair polair
o Waterstofbruggen
o OH-groep = belangrijk functionele groep + belangrijk voor fosforylatie (door
tyrosinekinasen -> signaaltransductie)
- Tryptofaan (Trp)
o Intermediair polair (N in indolring)
o Grootste zijketen
o Zeldzaam
--> absorberen uv-licht (280nm) -> concentratie bepalen, zuiveringsproces
3. Polair, ongeladen
- Cysteïne (Cys)
o Sulfylhydryl R-groep (SH) -> polair (pKa 8,2)
o Ioniseert op licht
o Oxidatie -> disulfide (cystine)
o Disulfidebruggen -> 3D-structuur eiwit -> stabiliserend
o Katalytisch centrum van enzyme
o Ionisatie SH -> S- + H+ -> sterk nucleofiele zwavelgroep
- Serine (Ser), Threonine (Thr)
o OH-groep -> polair
o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
o Fosforylatie -> signaaltransductie
- Asparagine (Asn), Glutamine (Gln)
o Amiden van asparaginezuur en glutaminezuur
o Relatief polair
, o Waterstofbruggen (H-donor of H-acceptor)
- Proline (Pro)
o Cyclisch, ongeladen
o Rigide conformatie (vanwege ring)
o Geen waterstofbruggen
o Speciale structuur (knik) -> cisconfiguratie
4. Positief geladen
- Arginine (Arg)
o Guanidinogroep (positief geladen)
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Lysine (Lys)
o Primair amine
o pKa = 10 -> sterk positief geladen
- Histidine (His)
o Imidazol
o pKa = 7
o Elektrofiele N = H-donor
Nucleofiele N = H-acceptor
o Nucleofiele katalysator -> katalytisch centrum
o Niet-geladen vorm = protonacceptor
Geladen vorm = protondonor
o Veelzijdige eigenschappen
5. Negatief geladen
- Aspraginezuur (Asp), Glutaminezuur (Glu)
o Carboxylgroepen
o pKa (Asp) = 3, pKa (Glu) = 4
o volledig geïoniseerd bij pH 7-> zeer polair
o sterk negatief -> kationen en metalen cheleren (complexvorming)
SUIKERS
Mono- en disachariden
o D-glucose
o D-galactose: hydrolyse van lactose
o D-fructose
o D-ribose: nucleïnezuren
o Maltose: 2 glucoses
o Lactose: glucose + galactose
o Sucrose: fructose + glucose
- Suikerzuren: ‘-uronzuur’, ‘-onzuur’
o Glucuronzuur
o Gluconzuur
o gluconolaction
- Suikeralcohols: reductie van carbonylgroepen
o Sorbitol
o Glycerol
, o Ribitol
- Deoxysuikers : 1 zuurstof minder
- Suikerresten
- Aminosuikers: aminogroep
o Muraminezuur
o Neuraminezuur
Polysachariden: homo- of hetero-
o Zetmeel: aardappel
o Glycogeen: lever
§ Korte takken -> monomeren glucose uit te halen
o Cellulose: celwand plant
§ Lineair, onvertakt
§ Onverteerbaar
§ Waterstofbrugvorming -> grote sterkte
§ Stabiel
o Chitine: exoskeletten
§ Onverteerbaar
- Peptidoglycans: in bacteriële celwand
§ Peptide-crosslinks -> sterke wand
§ <-> lysozome en penicilline
- Glucosaminoglycans (GAG’s)
§ Herhaalde disachariden
§ N-acetylglucosamine of N-acetylgalactosamine met -uronzuur
§ Soms sulfaat -> negatief -> afstoting -> lineaire structuur (minimaliseren
van afstotingen)
§ Extracellulaire matrix -> ‘jungle’
§ Gesulfateerd en niet-gesulfateerd -> specifieke herkenning
proteïneliganden -> elektrostatisch binden
§ Covalent binden met proteïnen -> proteoglycans
o Hyaluronzuur
§ Glasachtig, translucent
§ Viskeus
§ Glijmiddel
§ Spankracht in extracellulaire matrix
§ Hyaluronidase (enzyme): splitsen -> verder doordringen bacteriën in
weefsels (zie ook zaadcellen tot eicel)
o Chondroïtinesulfaat
§ ‘gewricht’
§ Spansterkte
o Dermatansulfaat
§ ‘huid’
§ Plooibaarheid
o Keratansulfaten
§ ‘hoorn’
§ Geen -uronzuur
§ In hoornachtige structuren gevormd door dode cellen
o Heparine
, § ‘lever’
§ Anticoagulans -> sterk elektrostatisch
Glycoconjugaten: suikerpolymeren en eiwitten of lipiden
- Proteoglycans
o Macromoleculen in plasmamembraan of cellulaire matrix
o GAG-moleculen vastgehecht aan ‘core-proteïne’ (trisacharidebrug)
o Voorzien van mutipele bindingsplaatsen -> elektrostatische binding of
waterstofbruggen
o Bindweefsel (bv. kraakbeen) -> covalente interacties
o Aggrecans (complexen van meerdere core-proteïne) -> collageen binden ->
spankracht
o Integrale membraaneiwitten (bv syndecan) -> connectie tussen extracellulair
en intracellulair -> genexpressie beïnvloeden
o Onvertakte suikers
- Glycoproteïnen
o Kleiner, diverser dan GAG’s en proteoglycans
o Alle mogelijke functionele klassen van eiwitten
o O-linked of L-linked
o Vertakte suikers
o Complexer
o Hexosen, acetyl hexosamines, pentosen, methylpentosen, siaalzuren
o Functies
§ Modulatie: oplosbaarheid, viscositeit,...
§ Bescherming tegen proteolyse
§ Beïnvloeden proteolytische processing
§ Biologische activiteit
§ “reisaspecten” -> insertie, migratie,...
§ Embryonale ontwikkeling en secretie
§ Invloed metastasering van tumorcellen (uitzaaiing)
- Glycolipiden
o Gangliosiden
§ Membraanlipiden
§ Complexvorming
§ Bv. bloedgroepantigenen
o Lipopolysachariden (LPS)
§ Buitenste membraan gramnegatieve bacteriën (bv. E. coli)
§ Primaire doelwitten van antistoken
§ Serotypes (specifieke antistoken) bepaald door samensteling LPS
§ Toxisch -> infectie -> bloeddrukdaling -> ‘toxic shock syndrome’
- Lectines
§ Cel-herkenning + adhesie
§ Lectine (selectine) herkennen T-lymfocyt -> vertragen
§ Herkenning glycolipiden of glycoproteïnen
§ Virale lectine
§ Toxine als lectine
§ Als bacteriële vasthechting
VETTEN
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller paulien15694. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $12.00. You're not tied to anything after your purchase.
