Summary
GEN30306 Genomics Samenvatting
- Course
- Institution
Uitgebreide samenvatting van zowel de collegestof als de practicals van het vak GEN-30306 Genomics.
[Show more]
Seller
Follow
eknaw
Reviews received
Content preview
GENOMICSLECTURE 2: GENETIC AND PHYSICAL MAPS
COLLEGESTOF
Gene mapping bepalen van de positie van een gen
en de afstanden tussen genen
Verschillende typen van genomic maps
Cytogenetic map representatie van positie
van genen op een chromosoom
Genetic linkage map volgorde van
genetische markers en genetic distance tussen
de markers
Physical map door genoom in stukjes te
knippen wordt de fysieke afstand tussen
markers bepaald
Genetic linkage mapping
Gebruik van polymorphic markers
o tonen variatie voor een bepaalde positie (polymorfisme, verschillende allelen)
o Microsatellites en SNPs
Pedigree noodzakelijk
o bepalen overerving van allelen informative meioses bepalen
Informative meioses bepalen welke van de 2 allelen van de ouders worden doorgegeven aan de
nakomelingen
Linkage mapping gebaseerd op recombinatie tijdens meiose
genen dicht bij elkaar gelegen, dan weinig mogelijkheid tot recombinatie weinig recombinanten
waargenomen
markers zeer ver uit elkaar of op verschillend chromosoom recombination frequency= 0.5
Recombination frequency aantal recombinants / (niet recombinants + recombinants) R/(N+R)
LOD score
bepalen of de gevonden recombinatie frequency significant verschilt van een random verdeling van de
allelen
o hoeveel x meer waarschijnlijk is het dat de geobserveerde frequentie wordt waargenomen ipv
frequentie voor random
verdeling van de allelen?
LOD score 10loglog
(Pobserved/Pnull)
Zie voorbeeldberekening
Aanvullingen:
Niet vergeten van biominale coefficient
totaal nakomelingen linksboven, aantal recombinanten rechts onder)
LOD >3.0log de gevonden data ondersteunt de aanwezigheid van linkage
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller eknaw. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.89. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52510 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now