Summary
Samenvatting MGOT deeltentamen 1
- Course
- Institution
Samenvatting van alles van MGOT deeltentamen 1
[Show more]
Seller
Follow
pipleopold
Reviews received
Content preview
Genetica & modelorganismenModelorganismen
- Makkelijk
- Snelle groei
- Efficiente genetica toepassen
- Makkelijk mutanten vinden in screens
- Dubbelmutanten maken
- Manipulatie van het genoom
- Homologe recombinatie
- Expressie van plasmiden
Veelgebruikt:
- Prokaryoten
- Bacteriën (E.coli) en bacteriofagen (Lambda)
- Eukaryoten
- Schimmels (Aspergillus) en gisten (eencellig) (in het practicum)
- Planten (Arabidopsis thaliana)
- Dieren:
- Caenorabditis elegans (nematode) (in het practicum)
- Drosophila melanogaster (fruitvlieg) (college)
- Daniorerio (zebravis)
- Mus musculus (muis) (deel 4)
- Homo sapiens (mens) (deel 4)
Gist
- Eencellig
- Genetisch zeer goed te bestuderen
- Basale levensprocessen zijn vergelijkbaar met die van ons:
- Celdeling (o.a. DNA-replicatie, chromosoom scheiding)
- Metabolisme
- Eiwitlokalisatie en transport
- Meest gebruikt:
- Budding yeast (bakkersgist)
- Deelt via budding
- Rond
- Fission yeast
- Splits in tween
- Lange staaf
- Celdeling lijkt anders maar komt best overeen
- Redelijk overeenkomsten van eiwitten met mens
- Voordelen:
- Selectie mogelijk (op antibiotica)
- Transformeerbaar met plasmiden
- Genotypes kruisen
Plasmiden
- Cirkel vormig
- Gereguleerde promotor
- Galactose staat aan in aanwezigheid van galactose
- Selectie markers
- Mutant in marker aanbrengen —> gist kan niet groeien op dat medium
,Homologe recombinatie
- zeer efficient in gist
- Korte homologie sequentie is voldoende om in te bouwen
- Je kan primers bestellen met stukje extra homologie
- Knock out maken:
- Zit selectie marker in om te kijken of het gelukt is
- Unique barcode: terugvinden in sequencing
Combineren van genotypes
- Diploïde maken door conjugatie
- Gist kruisen met opposite mating type
Haploide - diploïde levenscyclus Budding yeast
- Als gist hem stress gaat hij haploide sporen vormen
- Twee samen kunnen conjugeren
- Mating type switchen, alpha kan a worden en andersom
- Homothalic yeast
- Regulatie net wat anders dan anderen
- HMR en HML wordt niet afgeschreven, wordt geremd
- Ho endonuclease knipt gen eruit en zet in het midden
- Na knippen volgt meestal een mating switch
- Het midden bepaald de mating type
- Is biased naar 1 switch
- Willen we niet in het lab: mutant van HO gen gebruiken
- Sporulatie wordt wel geïnduceerd: nutrient arm medium
Fission yeast
- Soortgelijke levenscyclus
- Haploid en diploid en kan sporen vormen
Genetische screen
Opzet:
- Proces waarin je geïnteresseerd bent: welke genen zijn hierbij betrokken?
- Mutant of DNA schade
- Wat heb je beschadigd?
, Genen betrokken bij celcyclus?
- Temperatuur gevoelige mutanten maken: niet functioneel bij (vaak) een hoge temperatuur
- Blijft hangen in metafase
Eiwitten gevonden in screens:
- CDC28 budding yeast/Cdc2 fission yeast
- Stimuleert celdeling
- Nu CDK1
- Celcyclus, snelheids bepalend
- Te weinig: geen celdeling
- Te veel: te snelle celdeling, te kleine gistcellen
- Wee
- Bindt aan cyclinen, reguleert cyclines
- Humane CDK1 kan gist CDK1 vervangen
- Wee1 deletie mutanten—> delen te snel
- Remt normaal celdeling
- CDC25 deletie mutanten —> stoppen celdeling (in mitose)
- Stimuleert celdeling
- Werken ze individueel of in een lineaire pathway?
——> genetische epistase analyse
Genetische epistase analyse
- Dubbel mutant maken van twee verschillende fenotypen
- Combineren —> welk fenotype?
- Cdc28-: mutant stopt celdeling
- Wee1-: mutant deelt te snel
- Observatie: dubbel mutant heeft het cdc28- fenotype: 2 valt af
- Wee1: negatieve fosforylering
- Cdc25: activerende fosfatase
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller pipleopold. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.54. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
60904 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now