Summary
Samenvatting MGOT deeltentamen 1
- Course
- Institution
Samenvatting van alles van MGOT deeltentamen 1
[Show more]
Seller
Follow
pipleopold
Reviews received
Content preview
MGOT deeltentamen 1HC 2 & 3 & DNA Repair
DNA komt voor in:
- Kern
- Mitochondrium
- Chloroplast
Genetische elementen
- Chromosoom
- Circulair (Prokaryoten)
- Lineair (Eukaryoten)
- Plasmiden
- Circulair DNA
- Heeeeel bijzonder in Eukaryoten
- Virale genomen
- DNA of RNA
- Geïntegreerd of vrij in de cel
- Transposons
- Mobile genetische elementen
- Organellen
- In mitochondrien
- In chloroplasten
Replicatie
- Prokaryoten
- Unieke origin
- Ori en terminatie zone
- Eukaryoten
- Geen sterk gedefinieerde Ori
- Meerdere plekken replicatie
- Kan zelfs replicatie in een replicatie
- Alleen dan duurt replicatie maar 20 min
Seggregatie
- Eukaryoten
- Segregatie duurt langer omdat het uit chromatines moet
worden gepakt
- Replicatie en transcriptie lopen tegen elkaar in
- Elk gen heeft z’n eigen promoter
- 1 gen —> 1 mRNA —> 1 eiwit
- Prokaryoten:
- Hebben geen kern maar een nucleoid waar chromosomen
“samen komen”
- Geen mooie mitose, de nucleoiden gaan naar de
uiteinden, dan kan deling plaatsvinden
- Replicatie en transcriptie lopen niet tegen elkaar in
- Op 1 operon vinden meerdere start en stop sequenties
plaats
- Meerdere genen
- Lac operon: 3 genen —> 1 mRNA —> 3 eiwitten
,Plasmiden
- Extrachromosomaal DNA
- Bevat niet essentiële genen
- Zorgt dat bacterie kan leven in andere milieus (vergroot aanpassingsvermogen)
- Afbraak van vervuiling
- Resistentie tegen bacteriën
- Pathogeniteit
- Symbiose
- Onafhankelijke replicatie
- Gebruikt hiervoor enzymen van de cel
- Maakt zelf eiwitten voor replicatie-initiatie
- COlE1 plasmide
- ROP en RNAI reguleren RNAII
- RNAII zorgt voor start van replicatie
- RNA bindt aan enkelstrengs DNA en functioneert als primer voor DNA pol
- Ori belangrijk voor:
- Compatibiliteit
- Twee plasmiden met dezelfde ori kunnen niet samen in de cel voorkomen
- Zijn niet compatibel
- Hierdoor gaat de cel delen, denkt dat het twee dezelfde plasmiden zijn
- Host range
- Copy number
- Single copy
- Replicatie lijkt op die van chromosoom
- 1 replicatie per celcyclus
- Gecontroleerde segregatie over dochtercellen
- Iedere dochtercel krijgt een plasmide
- Multiple copy
- Meerdere replicaties per celcyclus
- Vaak een karakteristiek aantal (bijv. 10-20/cell)
- Segregatie verloopt random (niet gereguleerd)
- Dochtercellen normaliter iig 1 plasmide
- Partitionering
- Verdeling van plasmiden over cellen
- Single copy: actieve partitionering
- Plasmide codeert voor toxine en antigif —> antigif vervalt —> cel dood
- Alleen plasmide kan de cel redden
- Passieve segregatie
- Bij high copy plasmiden
- ColE1 bestaat uit toxinegen en immuniteitsgen
- Zo is het plasmide selfish DNA, ten koste van de host
- Antidote maken zodat de host niet dood gaat
DNA topoisomerase
- Topoisomerase II kan supercoils maken
- Maakt het compacter, minder toegankelijk
DNA gelelektroforese
- DNA is negatief geladen
- EtBr gaat tussen de basen van DNA zitten —> fluoriseren
,- Topologie van DNA bepaald mobiliteit
- Supercoiled: compact maar heeft nog alle lading
Intronen zitten in het gen, integeen DNA zit tussen genen (junk DNA)
Mechanismen van genetic exchange
- Conjugatie
- F pili trekt bacteriën bij elkaar —> kanaaltje
- Plasmide wordt overgedragen in enkelstrengsvorm
- Nick wordt gemaakt in DNA —> DNA polymerase gaat de streng polymeriseren —> de
andere streng komt vrij en wordt naar de acceptor gebracht
- F plasmide groot plasmide: veel genen nodig voor conjugatie
- Operon met transfer genen: kanaal maken, DNA vrijmaken
- Transfer vindt plaats op de oriT: transfer origin
- TraA codeert voor eiwitten die pili maken
- TraJ: regulatie eiwitten
- TraY maakt nick in het DNA en multimer ontwindt het DNA
- Acceptor moet nog geen F plasmide hebben: anders geen conjugatie
- Tet resistentie: herkennen
- F plasmide kan ook integreren in het genoom: episoom
- Conjugatie kan nog steeds plaatsvinden
- Enorm belangrijk in bacteriële evolutie
- Sommigen plasmide zijn niet zelf overdraagbaar:
- Hebben oriT maar hebben ander plasmide nodig voor tra functie —> gebruiken tra genen
van andere bacterie stam
- Accepter, helper & donor
- Transductie
- Faag lambda
- Lineair maar wordt circulair in de bacterie
- Lysogeen
- Integeren in het genoom —> is dan een profaag
- Basis voor gateway cloning
- Repliceert mee met het chrosomosoom
- Proces kan ook omgedraaid worden waardoor hij in de andere fase komt —> “Integratie
& Excisie”
- Lytisch
, - Virusdeeltjes worden gemaakt
- Circulair DNA wordt verpakt in faagdeeltjes
- Foutief kan er ipv faag DNA, E. coli DNA
worden verpakt in de faag
- Omdat het DNA dan homoloog is kan het
DNA worden uitgewisseld
- Defect a- gen uitgewisseld worden voor een intact a+ gen:
- Transformatie
- Naakt DNA inbrengen met DNA bindende eiwitten op het membraan van de bacterie
- Kan zijn dat bacterie dat dan houd als gunstig is
- Enkelstrengs —> dubbelstrengs —> recombinatie —> in het genoom
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller pipleopold. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.53. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
57114 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now