Summary
Samenvatting - Biochemie II: metabolische diversiteit (C000577A)
- Course
- Institution
Samenvatting deel 4 van les + cursus. Mijn vriendinnen en ik gebruikten deze en zijn er allemaal door.
[Show more]
Seller
Follow
liendespiegeleir
Content preview
Hoofdstuk 4: de citroenzuurcyclus4.1 Inleiding
• Centrale pathway voor oxidatie van metabolische
brandstoffen:
– Aminozuren
– Vetzuren
– Koolhydraten (glycolyse → pyruvaat)
• Eerst oxidatie tot acetyl-CoA
– Pyruvaat word gesplitst in CO2 en een acetyl groep
• Verdere oxidatie van acetyl-CoA:
– Vrijstellen CO2 (uitademen)
➢ Pyruvaat heeft 3C en acetyl coA maar 2 →
gaat vrijstellen onder CO2
– Met elektronen wordt NADH en FADH2 gevormd
(worden doorgegeven naar O2 → zie volgend
hoofdstuk)
• Pathway bestaat uit 8 reacties
• Genoemd naar product van 1e reactie: citraat of citroenzuur
– Citraat heeft 6C en je geeft 2 keer CO2 af dus je eindigt met 4C (oxaloacetaat)
• Hier word brandstof opgebruikt tot CO2 maar intermediairen worden opnieuw gebruikt bij
iedere cyclus
• Ontstaan wanneer hoeveelheid aan atmosferische zuurstof sterk is beginnen stijgen
4.2 Overzicht van de citroenzuurcyclus
Volledige cyclus resulteert in 2CO2, 3NADH, 1 FAHD2
en 1 hoog-energie’ verbinding
Pyruvaat → acetyl coA reactie word niet gezien als
onderdeel van citroenzuurcyclus
Krebs was de eerste die aantoonde dat het metabolisme van
deze verbindingen een link had met de oxidatie van
metabolische brandstoffen
,Algemene kenmerken
1. - citroenzuurcyclus = Krebs cyclus = tricarboxylzuur cyclus (TCA)
- oxidatie van acetyl groepen
- centrale pathway in het metabolisme
2.
3. - regeneratie oxaloacetaat (OAA) in laatste stap en gebruik in eerste stap
- OAA is katalysator van continue oxidatie van acetyl groepen
4 - gaat door in mitochondrium
- transport substraten/producten van/naar cytosol
5. C-atomen in CO2 en acetyl groep zijn niet dezelfde in één cyclus
➢ Koolstofatomen die verbanden en die eruit gaan als CO2 komen van de vorige cycli
6. Intermediairen zijn precursoren voor biosynthese van andere verbindingen (vb.
oxaloacetaat in gluconeogenese)
7. Vrije energie bij oxidatie van acetyl groep:
• 4 paar elektronen (3 NADH + 1 FADH2), dus 8 in totaal
• GTP (of ATP)
➢ GTP + ADP GDP + ATP
➢ Eveniwhcts reactie, je wisselt fosfaat uit
4.3 De synthese van acetyl-co-enzym A
Synthese acetyl-CoA
• Thioester acetyl-CoA = substraat van citroenzuurcyclus
• Eindproduct van verschillende katabole pathways
• Vb. koolhydraten → pyruvaat (glycolyse):
– Je gaat nooit tegelijkertijd een fermentatie hebben of pyruvaat dehydrogenase
– Anaeroob: pyruvaat → lactaat of ethanol/CO2 (fermentatie)
– Aeroob: verdere oxidatie
pyruvaat in citroenzuurcyclus
• Import in mitochondrium via transporteiwit (pyruvaat-H+ symporter)
• Oxidatie tot acetyl-CoA door pyruvaat dehydrogenase
, • Vb. Afbraak vetten: glycerol + vetzuren. Vetzuren → Acetyl CoA via vetzuur-oxidatie.
• Vb. Afbraak aminozuren rechtstreeks tot acetyl-CoA (Ile, Leu, Lys), of via pyruvaat (Ala, Cys,
Gly, Ser, Thr, Trp).
Pyruvaat dehydrogenase
• = Multi-enzymcomplex:
– Associatie van verschillende enzymen
– Katalyseren 2 of meer opeenvolgende stappen uit pathway
• Voordelen:
– Afstand die substraat moet afleggen naar de verschillende enzymen (door diffusie) is
kleiner → grotere reactiesnelheid
– Intermediairen worden binnen complex doorgegeven, geen ongewenste bijreacties
met componenten uit solvent
– Gecoördineerde controle van enzymactiviteit → zitten allemaal samen in complex,
dus je kan ze ook allemaal samen reguleren
• Pyruvaat dehydrogenase complex (E. coli):
– Gaat acetyl-CoA vormen uit pyruvaat
– 24 x pyruvaat dehydrogenase = E1 (in kern, in kubus)
– 24 x dihydrolipoyl transacetylase = E2
– 12 x dihydrolipoyl dehydrogenase = E3
– Kinase en fosfatase (regulatie)
1 transfer enzym ( E2) en 2 oxidatieve enzymen (E1? E3)
E2 C-terminus is lang en flexibel met verschillende domeinen.
Deze dienen om E1 en E3 te verankeren en om substraat te
verplaatsen tussen E1/2/3 actieve sites.
Op die keten zitten er kleine domeintjes, om zowel die E1 en E3 te
verankeren, ofwel stukjes substraat te dragen (roze stipjes)
Per arm heb je er 3 met een roze stipje en er is altijd wel 1tje
beschikbaar om substraat op te pikken
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller liendespiegeleir. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.24. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
72841 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now