HC 1 Edwin Pos Biodiversiteit
Verschil tussen alfa en bèta diversiteit:
• alfa diversiteit is binnen een enkele gemeenschap (lokaal)
• beta diversiteit is verschil tussen twee gemeenschappen
• gamma diversiteit is totale regionale diversiteit
➔ Bij bèta diversiteit bekijk je de turnover van soorten→je vergelijkt de 2 en kijkt hoe de 2
overlopen in elkaar, verschil in soorten in de ruimte
→ als twee sites totaal verschillend zijn dan is beta hoog
→ x-as meest algemene soort volgorde, 1 meest daarna 2 etc.
➔ Dit patroon vind je bijna altijd → waar komt dit patroon vandaan? Komende colleges
Schalen van diversiteit:
evenness is verspreiding van individuen
dominance is tegenpatroon van evenness
, • Alfa diversiteit
➔ ONE SAMPLE
Scaler statistic = een getal
Evenness = of alle soorten evenveel individuen hebben of dat er dominantie is (bv vlinder en
soin 2x)
P = {p1,…,…, pi}→ vector p1 t/m pi , hoeveel pi t.o.v. totaal
Hoe meer species in de community, hoe groter de diversiteit
Niet alleen hoeveel soorten in elk gebied maar ook hoeveel van elke soort
Als ze het hebben over diversiteit→kijken welke maten ze meenemen, de combinatie van
soortenrijkheid (s) en de soorten abundantie (N) is heel erg belangrijk
Shannon index van diversiteit: komt uit informatie theorie (pas later voor biologie)
➔ Vermenigvuldig relatieve abundantie van 1 soort met de log van relatieve abundantie soort
1→ en doe je voor elke soort en telt op , geeft info over structuur van de gemeenschap
Simson index → kans dar je 2 x een individu trekt uit populatie → hoe groot is de kans dat het
‘dezelfde’ soort is bij random sampling. Tegenovergestelde manier diversiteit→ voor diversiteit vaak
1-D = diversiteit gebruikt.
,Fishers alfa → log series patroon→ singletons (soort met 1 individu)→meest voorkomende klasse in
systeem → hoeveel soorten hebben maar 1 individu alfa X . common species are rare and rare
species are common. Alfa wordt hier gebruikt als een maat voor diversiteit, zegt iets over de
verdeling van de distributie
• Beta diversiteit (tussen 2 gebieden)
➔ MULTIPLE SAMPLES
Turnover van soorten over een afstand→ hoe verandert de diversiteit over een afstand
Indexen:
• Whittaker = Relative species difference per site in comparison with total diversity
βW = (γ - αav)/αav = γ/αav – 1 gamma= total species diversity. alfa is gemiddelde soorten
diversiteit per site voor alle site
• Jaccard = Species overlap, without looking at abundance (only presence / absence)
J = a/(a+b+c) (a=shared)
• Sorenson = Similar to Jaccard, but with more emphasis on species overlap than difference
S = 2a/(a+b+c) → 2 want hier telt overlap zwaarder
• Bray curtis = Quantifying compositional difference between samples
• …
, Sorenson geeft meer gewicht aan de overlap dan aan die alleen voorkomen : plaatje 2 rondjes met
overlap
Daarom maal 2
• Gamma diversiteit
Totale soorten diversiteit in een landschap (gamma) wordt bepaald door de alfa en
bèta diversiteit
Gamma = bèta * alfa
Beta omlaag → gamma ook omlaag
→ geen gradiënt (consequente uitkomsten) → er is geen competitie → goede fit :
Verschil tussen alfa en bèta diversiteit:
• alfa diversiteit is binnen een enkele gemeenschap (lokaal)
• beta diversiteit is verschil tussen twee gemeenschappen
• gamma diversiteit is totale regionale diversiteit
➔ Bij bèta diversiteit bekijk je de turnover van soorten→je vergelijkt de 2 en kijkt hoe de 2
overlopen in elkaar, verschil in soorten in de ruimte
→ als twee sites totaal verschillend zijn dan is beta hoog
→ x-as meest algemene soort volgorde, 1 meest daarna 2 etc.
➔ Dit patroon vind je bijna altijd → waar komt dit patroon vandaan? Komende colleges
Schalen van diversiteit:
evenness is verspreiding van individuen
dominance is tegenpatroon van evenness
, • Alfa diversiteit
➔ ONE SAMPLE
Scaler statistic = een getal
Evenness = of alle soorten evenveel individuen hebben of dat er dominantie is (bv vlinder en
soin 2x)
P = {p1,…,…, pi}→ vector p1 t/m pi , hoeveel pi t.o.v. totaal
Hoe meer species in de community, hoe groter de diversiteit
Niet alleen hoeveel soorten in elk gebied maar ook hoeveel van elke soort
Als ze het hebben over diversiteit→kijken welke maten ze meenemen, de combinatie van
soortenrijkheid (s) en de soorten abundantie (N) is heel erg belangrijk
Shannon index van diversiteit: komt uit informatie theorie (pas later voor biologie)
➔ Vermenigvuldig relatieve abundantie van 1 soort met de log van relatieve abundantie soort
1→ en doe je voor elke soort en telt op , geeft info over structuur van de gemeenschap
Simson index → kans dar je 2 x een individu trekt uit populatie → hoe groot is de kans dat het
‘dezelfde’ soort is bij random sampling. Tegenovergestelde manier diversiteit→ voor diversiteit vaak
1-D = diversiteit gebruikt.
,Fishers alfa → log series patroon→ singletons (soort met 1 individu)→meest voorkomende klasse in
systeem → hoeveel soorten hebben maar 1 individu alfa X . common species are rare and rare
species are common. Alfa wordt hier gebruikt als een maat voor diversiteit, zegt iets over de
verdeling van de distributie
• Beta diversiteit (tussen 2 gebieden)
➔ MULTIPLE SAMPLES
Turnover van soorten over een afstand→ hoe verandert de diversiteit over een afstand
Indexen:
• Whittaker = Relative species difference per site in comparison with total diversity
βW = (γ - αav)/αav = γ/αav – 1 gamma= total species diversity. alfa is gemiddelde soorten
diversiteit per site voor alle site
• Jaccard = Species overlap, without looking at abundance (only presence / absence)
J = a/(a+b+c) (a=shared)
• Sorenson = Similar to Jaccard, but with more emphasis on species overlap than difference
S = 2a/(a+b+c) → 2 want hier telt overlap zwaarder
• Bray curtis = Quantifying compositional difference between samples
• …
, Sorenson geeft meer gewicht aan de overlap dan aan die alleen voorkomen : plaatje 2 rondjes met
overlap
Daarom maal 2
• Gamma diversiteit
Totale soorten diversiteit in een landschap (gamma) wordt bepaald door de alfa en
bèta diversiteit
Gamma = bèta * alfa
Beta omlaag → gamma ook omlaag
→ geen gradiënt (consequente uitkomsten) → er is geen competitie → goede fit :
