Summary
Samenvatting Genetica en cardiovasculaire ziekten
- Course
- Institution
Samenvatting hoorcollege cardiovasculaire biologie genetica en cardiovasculaire ziekten
[Show more]
Seller
Follow
evelienfloor
Reviews received
Content preview
Vascular Biology Evelien FloorGenetica en cardiovasculaire ziekten
Genetica is relevant voor bijna alle hart- en vaatziekten. Een mens heeft ongeveer 22.000 genen terwijl
een druif maar liefst 30.000 genen heeft. Druiven hebben meer genen omdat ze minder efficiënt met
het genoom om gaan dan de mens. Met 22.000 genen kan de mens veel meer eiwitten maken dan een
druif. Druiven maken per gen 1 eiwit, ze hebben geen alternatieve splicing.
99.9% van het DNA is identiek tussen twee (niet gerelateerde) individuen. Het grootste deel van de
varianten in het genoom zijn SNPs. Er komen ongeveer 10 miljoen gemeenschappelijke SNPs voor in
een populatie. Gemeenschappelijk wil zeggen: komt meer dan 1% voor in de populatie.
Evolutie van humane genetica
Tijdens de meiose is het genotype random bepaalt. Een voordeel van genetisch onderzoek is dat
genotypen onveranderd blijven tijdens ziekten. Uitzonderingen zijn echter somatische mutaties in
kanker.
Linker studies
Linker studies kijken naar familiaire ziektes (borstkanker, CMPs, Huntington). Een Mendeliaanse
eigenschap heeft een zeer voorspelbaar genotype, waarbij de mutatie de gen functie enorm verandert.
Daarnaast hebben milieu, gedrag en kans weinig invloed op de uitkomst. De klinische toepassing is
voornamelijk predictie, echter zijn er ook zeldzame ziekten waar we (nog) geen genetische basis voor
hebben gevonden.
Er zijn al meer dan 4.000 single-gene ziektes gevonden, waaronder sikkelcelanemie, CF, Huntington,
spierdystrofie, kanker (BRCA), diabetes (MODY), en hypertensie. Bij complexe genetische ziektes is het
wat lastiger omdat deze een genetische basis hebben maar ook beïnvloed worden door andere
factoren zoals gedrag, milieu en kans.
Kandidaat gen studies
Bij kandidaat gen studies wordt gebruik gemaakt van een groep cases en een groep controles. In elk
van deze groepen wordt gekeken naar een specifiek gen, en de associatie met de ziekte. Al snel bleek
dat deze studies niet gerepliceerd konden worden (veel vals-positieven). Een aantal problemen was te
kleine sample groottes, kleine kans op ontwikkelen van de ziekte (2%), geen wijde standaarden voor
kwaliteitscontrole en associatie claims, en populatie stratificatie. Dit is abstract, maar het gaat erom
dat men aanneemt dat er een homogene populatie bestudeerd wordt terwijl dit vaak niet het geval
was (verschillen in etniciteit tussen groepen)
Genome wide association studies
Er zijn twee grote GWAS uitgevoerd: HapMap en 1000 genomes. HapMap heeft in 3 continentale
populaties (N= 270) gekeken naar de SNPs en vond er 3 miljoen. 1000 genomes heeft 28 populaties
van 5 continenten (N> 2.000) gesequenced en vond meer dan 80 miljoen varianten. Met deze
informatie konden de verschillen binnen en tussen populaties bekeken worden. Zo werd op grote
schaal gekeken naar verschillen tussen cases en controles.
Met genoomwijde SNP microarrays is het mogelijk om het genotype van
honderdduizenden genen te meten in een enkel experiment. Er wordt dan
weer vergeleken tussen cases en controles. Zo kunnen SNPs geassocieerd
met ziekte geïdentificeerd worden. Een van de eerste SNPs die gevonden is
bevindt zich op plek 9p21. Deze SNP is geassocieerd met coronary artery
disease (CAD). Velen Jaren later zijn er nog 47 andere loci gevonden
geassocieerd met deze ziekte.
1
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller evelienfloor. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.35. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
72001 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now