INLEIDING
1. BIOCHEMIE IS EEN BIOLOGISCHE EN EEN CHEMISCHE WETENSCHAP
- Macromoleculen: grote biomoleculen
- Interacties van biologische macromoleculen vormen de basis van alle leven
(chemische interacties)
2. DE 3 BIOPOLYMEREN: EIWITTEN, NUCLEÏNEZUREN EN POLYSACCHARIDEN
- Verschillende types biomoleculen:
Eiwitten
Nucleïnezuren
Polysacchariden
Vetten (lipiden)
- Eiwitten, nucleïnezuren, polysacchariden: opgebouwd door covalent binden van
stabiele eenheden of monomeren
Biomoleculen (macromoleculen) Bouwsteen (monomeer, covalent
gebonden)
Eiwitten Alfa-aminocarbonzuren (aminozuren)
Polysacchariden Monosacchariden (eenvoudige
suikers)
Nucleïnezuren DNA/RNA (erfelijk Nucleotiden (suiker + base +
materiaal) fosfaatgroepen)
- Eiwitten worden ook polypeptideketens genoemd
3. HET BELANG VAN NIET-COVALENTE AANTREKKINGSKRACHTEN IN DE STRUCTUUR,
STABILITEIT EN FUNCTIE VAN BIOMOLECULEN
- Functie van macromoleculaire biopolymeren hangt af van niet-covalente
elektrostatische aantrekkingskrachten tussen delen van deze grote moleculen
- Eiwitten moleculaire herkenning
4. HERHALING: FUNTIONELE GROEPEN EN COVALENTE KOPPELINGEN TUSSEN
FUNCTIONELE GROEPEN VAN BELANG IN BIOMOLECULEN
- Koolstofskelet met functionele groepen
HOOFDSTUK 1: ZWAKKE KRACHTEN TUSSEN
BIOMOLECULEN
- Covalente bindingen
- Niet-covalente bindingen:
Ionaire of elektrostatsiche binding
, Waterstofbinding (H-brug)
Van der Waals krachten
1. IONAIRE OF ELEKTROSTATISCHE AANTREKKING OF ZOUTBRUG
- Anion in de buurt van kation coulombkracht
- Wet van coulomb:
F = q1q2 / r2D
- D : dielektriciteitsconstante (vacuüm D = 1 , water D = 80)
- = zoutbrug (33 kJ/mol)
- Gevormd tussen eiwitten
- Belangrijke rol bij eiwitopvouwing, enzymatische katalyse, …
- Tussen polaire moleculen of functionele groepen dipool-dipoolkrachten /
keesomkrachten
2. WATERSTOFBRUGGEN
- Aantrekking tussen watermoleculen
- Ook tussen moleculen met geschikte functionele groepen
- Tussen O-H en N-H groepen
- Waterstofdonor: functionele groep met H-gebonden op O of N
- Waterstofbrugacceptor: oefent aantrekking uit op het H-atoom
- Geen elektronenuitwisseling
- Sterkte waterstofbrugvorming hangt af van positie van betrokken atomen (lineair/
niet-lineair)
- H-bruggen stabiliseren o.a. secundaire structuur van eiwitten (α-helix)
3. VAN DER WAALS KRACHTEN OF LONDONKRACHTEN
- Aantrekking tussen apolaire moleculen
- Geïnduceerd dipool resulteert in zwakke aantrekking
- Elektronenverdeling varieert dus asymmetrisch
- Optimale afstand voor interactie: som van de van der waals radii van atomen
- Van der waals radius: afstand van kern tot oppervlak van de ruimte bezet door
elektronen
4. HET EFFECT VAN WATER OP ZWAKKE AANTREKKINGSINTERACTIES
- Levende organismen bevatten 70-80% water
- Water is polair:
O-atoom trekt gemeenschappelijke elektronenparen van covalente bindingen naar
zicht toe permanente polaire structuur, dipoolmoment
- Waterstofbruggen tussen watermoleculen wisselen constant dynamisch netwerk
Water zeer cohesief
, Oppervlaktespanning
Hoog kookpunt
- Water is excellent solvent voor polaire moleculen en ionen
Watermantel zorgt ervoor dat de ladingen afgeschermd worden en minder
kunnen reageren met andere groepen
- Ionaire interacties en waterstofbruggen tussen biomoleculen worden afgezwakt in
water
5. HET HYDROFOOB EFFECT
- Hydrofoob vs hydrofiel
- Hydrofobe moleculen associëren in waterige oplossing
6. VEEL ZWAKKE KRACHTEN SAMEN MAKEN EEN STERK GEHEEL
- Vraag 1: hoe kunnen zwakke krachten van belang zijn als ze zwak zijn?
Vele kleintjes maken 1 groot (velcro)
Som van de individuele energiebijdragen van deze interacties voldoende
stabiliteit
Co-operativiteit: wanneer aantrekking optreedt op een deel van de chemische
groepen, brengt dit weer andere groepen dicht genoeg om attracties op elkaar uit
te oefenen
- Vraag 2: welk voordeel levert het zwak karakter vanuit biologisch standpunt?
Zwak karakter dynamisch
Delicate balans nodig tussen samenwerken en loslaten
HOOFDSTUK 2: AMINOZUREN EN PEPTIDEN
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller yannickkesteloot. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.83. You're not tied to anything after your purchase.