Summary
Samenvatting Hoofdstuk 4 inleiding tot biochemische processen
- Course
- Institution
Samenvatting Hoofdstuk 4 van het vak Chemie en Inleiding tot de biochemische processen. Dit omvat lesnotities, samengevatte cursus.
[Show more]
Seller
Follow
Bix01
Reviews received
Content preview
H4: Eiwit-eiwit en eiwit-ligandinteracties4.1. Inleiding
Sterkte binding met bijhorende Kd waarde van 10-3 tot 10-12 M (zie H3 Calmoduline en Zn2+)
Contactplaats op eiwit voor 2e eiwit ligt op opp en is complementair qua vorm en lading
Meerdere (niet aaneensluitende) contactopp
Scaffold-fctie: eiwitten die fungeren als bouwsteiger waarop vele eiwitten vasthechten ter
vorming van multi-eiwitcomplex (bv celadhesiecomolexen, signaalcomplex, celrespiratie:
enzymcomplexen)
Bindingplaats kleinere (organische) molecule of ligand kan ook in een depressie of protrusie
(bv lus) zitten.
Diepe groeve=cleft of diepe holte=pocket
In binnenste eiwitdomein=cavity (ingesloten in intern micromilieu)
Kan vormveranderingen of conformatieveranderingen ondergaan
Treden op door binding partnermolecule (bv 2e eiwit, ligand of allostere inhibitor): zorgt
voor trigger => gaan zich vormelijk aan elkaar aanpassen = induced fit
Conformatieverandering kan ook optreden na posttranslationele modificatie
4.2 Skelet- en hartspiercontracties: showcase van eiwit-eiwitcomplexen, ligand-
geïnduceerde conformatieveranderingen, cooperatieve werking en competitie
Actine-eiwitten = dunne filamenten = opnames spiersarcomeerstructuur
Myosines=multimeren= hexamere quaternaire structuur (2 zware pptketens en 2 van
verschillende types kleinere pptketens)
‘Hoofdjes’
Sliding model= contact tssn dik en dun en regulatie ervan
Tropomyosine: associeert met actinefilament
Troponines hebben rol bij regulatie spiercontractie bij verhoging intracellulaire Ca2+
Spiercontractie is show-case eiwitwerking
DIAAAAAAAAAAAA
D
,
, 4.3
Structuur-
fctieverbanden in eiwitten betrokken in O2-binding en transport
Hemoglobine (Hb, bloedcel) en myoglobine (Mb, Myob, spierweefsel)
Hb: O2 in bloedbaan transporteren
Mb: O2 uit bloedbaan via diffusie binden en beschkbaar stellen voor mitochondrieen (ATP)
4.3.1 Myoglobine en hemoglobine binden O2 via haemgroep
Binden O2 via prosthetische groep = haemgroep
Haemgroep + O2 geeft rode kleur aan spieren en bloed
, Haemgroep= organische molecule (protoporfyrine IX)+ Fe2+ => Aromatisch karakter en
vlakke strctuur
4.3.2 Myoglobine:
eiwitstructuur en O2-
binding
Mb = 153 AZ tot all-alfaklasse
Bevat 8 alfa-helices verbonden door korte lussen
Hydrofobe holte = haemzak gevormd tssn E en F helix
Polaire propionaatgroep die naar buiten gericht zijn => unieke positie
Histidines in E en F helices zijn
belangrijk
Histidine in F-helix levert 5e
coordinatieve binding met ijzerion
, =>Fe ion uit haemvlak getrokken naar proximale His in F
Myoglobine met haemgroep = deoxymyoglobine of deoxy-Myob kan 1 O2 binden waarbij
Oxy-myoglobine gevormd wordt
His op E = distale His. O2 kan reversibele binding vormen met Fe2+ ion => 6 e coordinatieve
binding
Concentratie van ligand
O2 dat door diffusie uit
aanwezig bloedcapilairen
in spiercellen
binnenkomt, de conc van myoblobine in deze cellen en affiniteit van Mb voor dit ligand zal de
hoeveelheid Myob-O2 in spiercellen bepalen
Perifeer
weefsel zoals spierweefsel
is lage O2
Zuurstofconcentratie wordt weergegeven door partieeldruk O2 (pO2)
Lage partieeldruk van pO2 in rust = 20 torr = 20mmHg
Intensie spierwerking: 10 Torr
Om te kunnen werken
als effectieve
bindingsmolecule
verwacht mn hoge
affiniteit myoglobine
onder deze condities
O2-dissociatiecurve
,
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller Bix01. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.77. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
56326 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now