Dit is een samenvatting van de cursus biochemie binnen het vak cel II. Deze samenvatting is enkel gebaseerd op de cursus, niet de lessen, maar volstond wel om perfecte score te halen op het examen :)
Cel II: Biochemie
1. De zwakke krachten en hun rol in de biochemie
- Intermoleculaire krachten
- Niet-covalente bindingen: delen geen elektronen
1.1 Watermoleculen vormen een netwerk via waterstofbruggen
- Zuurstof grotere elektronegativiteit dan waterstof
⇨ dipoolmoment (door polaire structuur)
⇨ Partieel negatieve O vormt bindingen met partieel positieve H
- Eigenschappen binding:
o Bindingsenergie opvallend lager dan covalente bindingen
o Afstand tussen kernen groter dan covalente bindingen
- Hoog kookpunt: veel intermoleculaire krachten
1.2 Waterstofbruggen ontstaan ook tussen biomoleculen met geschikte functionele
groepen
- Tussen
o Watermoleculen en functionele groepen met elektronegatief karakter (O-, N-atomen)
o Onderling tussen: alcohol-, amino-, carbonyl-, amidegroepen
- Goed oplosbaar in water: hydrofiele moleculen
o Waterstofbrugdonor: molecule met H-atoom
o Waterstofbrugacceptor: molecule met vrij elektronenpaar
- Eigenschappen binding:
o Afstand tussen kernen groter dan covalente bindingen
o Sterkte afhankelijk van positie van deelnemende atomen (lineair het sterkst)
1.3 De ionaire binding
- Groot verschil in elektronegatief karakter
⇨ Elektronenpaar gaat over naar meet EN atoom
⇨ Anion (-) en kation (+) oefenen aantrekkingskracht uit op elkaar (
- Eigenschappen binding
o Sterkte: onafhankelijk van richting, volgens wet van coulomb:
𝑞1.𝑞2
𝐹= 2
𝑟𝐷
D: diëlektriciteitsconstante -> hoe hoger, hoe zwakker krachten
o Ionen goed oplosbaar: watermantel gevormd en energie komt vrij
(watermoleculen richten zich naar tegengestelde lading rondomrond)
▪ Ionen door membraan: moeten mantel (deels) verliezen
1.4 De Van-der-Waalskrachten
- Elektronen bewegen
⇨ Niet altijd gelijk verdeeld
⇨ Tijdelijke ladingsverschillen binnen moleculen (= transiënte dipool)
⇨ Induceren op hun beurt ladingsverschillen bij naburige moleculen enz.
, - Eigenschappen binding:
o Kracht sterk afhankelijk van afstand tussen moleculen
▪ Optimale afstand: van-der-Waals radius
o Energie gering
1.5 Het hydrofobe effect
- Moeilijk oplosbare deeltjes in water: hydrofobe moleculen
o Waternetwerkstructuur verstoord -> energetisch ongunstig
o Afzonderlijke hydrofobedeeltjes samenplakken => hydrofobe oppervlakte kleiner
1.6 Vele kleintjes maken één groot
- Zwakke intermoleculaire krachten belangrijk:
o Biochemische processen
o Tot stand komen en stabiliseren van moleculaire structuren
- Verschillende soorten krachten niet onafhankelijk van elkaar (vaak combinatie)
- Twee moleculen interageren enkel als
o Vormen van oppervlakte complementair zijn
o EN energetisch gunstige interacties kunnnen aangaan
2. Lipiden en cellulaire membranen
2.1 Inleiding
- Hydrofoob => wateronoplosbaar
- Functies:
o Signaalmoleculen
o Brandstof
o Onderdeel biologische membranen
▪ Fosfolipiden
▪ Glycolipiden
▪ Cholesterol
- Afwijkingen lipidenmetabolisme kan ziekten veroorzaken
2.2 Fosfolipiden
- Bouw:
o Glycerolruggengraat
o C1: veresterd met vetzuurketen
o C2: veresterd met vetzuurketen, chiraal centrum
o C3: veresterd met fosfaatgroep
- Vetzuurketens:
o Koolstofketens met carboxylfunctie
o Verzadigd of onverzadigd (dierlijk: meestal elk 1)
o 16 of 18 C-atomen meest voorkomend (12-24 mogelijk, altijd even)
o Zie quizlet voor namen
- Polaire groepen (achter fosfaatgroep): neutraal of - geladen
o OH-groep => diaglycerol-3-fosfaat
o Ethanolamine
o Serine
, o Choline
- Inositolringen dragen één of meerdere fosfaatgroepen: polyfosofïnositiden
o Interageren met membraangeassocieerde eiwitten
o Spelen belangrijke rol als secundaire boodschappermoleculen
- Varianten:
o Difosfatidyglycerol
o Glycerofosfolipidenvarianten
▪ Etherbindingen ipv esterbindingen: fosfolipide-ether
2.3 Glycolipiden
- Ceramide + diacylglycerol + suikergroep
- 3 groepen
o Cerebrosiden: onvertakte suikerketens, meestal:
▪ 1ste glucose
▪ Volgende: galactose of N-acetylgalactosamine
o Groep 2: vertakte, langere neutrale ketens
o Gangliosiden: complexe, negatief geladen met N-acetylneuraminezuur (=siaalzuur)
2.4 Cholesterol
- Typisch voor dierlijke systemen (vooral in plasmamembraan)
- Neutraal
- Vlakke molecule (door stoelconfiguratie en transfusie naburige ringen)
- Polair gedeelte: hydroxylgroep
2.5 Fosfolipidendubbellaag
- Alle membraanlipiden één algemeenstructureel kenmerk: amfipatisch
⇨ In waterige omgeving gaan hydrofobe staarten spontaan samenklitten
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller elisabethdm. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $8.68. You're not tied to anything after your purchase.
