Summary
Biochemie samenvatting volledige cursus
- Course
- Institution
samenvatting van Biochemie (bevat alle leerstof)
[Show more]
Seller
Follow
evanme
Content preview
BIOCHEMIEDEEL 1 INLEIDING TOT DE BIOCHEMIE
1.1 Wat is biochemie?
= studie vh ‘leven’ op moleculair niveau, chemie vd levende cel, de studie vd
scheikundige processen vh leven
-hoofdthema’s:
• Structurele chemie v biomoleculen
• Metabolisme
• Opslag en overdracht van informatie
1.2 Cel is opgebouwd uit 4 groepen biomoleculen
-chemische elementen levende organismen:
• Essentieel: H, C, N, O, P, S
• Sporenelementen, wellicht essentieel: Na, Mg, Cl, I, Fe, …
• Aanwezig in sommige organismen: B, F, Br, As, Se, …
à zeer beperkt (primair: C, H, O, beetje N)
à ook al is een element weinig aanwezig kan het zeer essentieel zijn in een bepaald
proces
-C is centraal element
--- >50% vh drooggewicht ve cel
---veelzijdig: enkel en dubbel gebonden, lineair of vertakt of ringvormig
---aan C kunnen functionele groepen hechten die de chemische eigenschappen
bepalen
1.3 structurele organisatie van levende cellen
-plantencel heeft celwand
-plantencel is groter
-chloroplasten enz komen niet
voor in dierlijke cellen
-cel is complex maar geordend
---membranen zorgen voor compartimenten (organellen)
---water tss compartimenten met macromoleculen in
1
,-bouwstenen worden aan elkaar gehecht tot macromoleculen
---‘moleculaire economie’ = modulaire opbouw v grote moleculen
---op diversie manieren gecombineerd voor grote variatie
---voordelen:
• Beperkte hvlheid aan ruwe materialen nodig om te overleven
• Info zit vervat id volgorde vd bouwstenen in een keten
---kenmerkend aan levende cellen: voorkomen van enkele essentiële
biomacromoleculen (zie deel 2)
• Eiwitten: aminozuren
• Nucleïnezuren: nucleotiden
• Polysachariden: suikers
• Lipiden: vetzuren
---macromoleculen vormen samen grotere meer complexe structuren
-cel = basisunit voor leven
1.4 Structuur en eigenschappen van water
-water als solvent voor biomoleculen
---als molecule zich kan omringen met water
---interactie met water (eiwitten, polysacchariden, membranen en nucleïnezuren)
---chemische eig v water bepalen de functies v biomoleculen
-water is zeer polair
---elektrische dipool: + (H) en – (O) à trekt elkaar aan
à netwerk van waterstofbruggen: 1 molecule omgeven door 4
anderen (en zo door)
à waterstofbinding tss partieel pos H-atoom en partieel neg
O-atoom v 2 watermoleculen
-leven alleen mogelijk in waterig milieu
---beïnvloedt de 4 zwakke niet-covalente interacties (zie 1.5)
1.5 Niet-covalente interacties in biomoleculen
1) Lading-lading interacties (ionenparing)
2) Dipoolinteracties
3) Van der Waals interacties
4) H-bruggen
5) Hydrofobe interacties
à spelen belangrijke rol!
à zorgt voor flexibiliteit ve systeem
-waterstofbruggen
---relatief zwak maar zeer veel dus som v alle krachten is groot
---door zwakte toch makkelijk verbroken à flexibiliteit
---intermoleculair (baseparing in DNA) en intramoleculair (eiwitten)
2
,-hydrofobe interacties
---niet-polair molecule met ander niet-polaire
---water vrezend à komen graag samen (clusteren)
---vb olie
---kan significant egect hebben op stabiliteit ve macromolecule
-in realiteit veel verschillende interacties binnen 1 biomolecule
1.6 Water als solvent voor organische moleculen
-pos en neg komen los van elkaar en omringen zich elk met water
-goed solvent:
1) Polair karakter
2) Kan H-bruggen vormen
-oplosbaarheid v moleculen in water
---afhv de ratio van polaire tov niet-polaire groepen ie molecule
---hoe groter aandeel van niet-polaire groepen, hoe minder
oplosbaar in water en omgekeerd
-ionische en polaire substanties lossen op in water
---hydrofiel en elektrolyten
---molecule of ion omgeven door H-moleculen is gehydrateerd
---alle biomoleculen behalve lipiden zijn oplosbaar (vb glucose: heeft 5 OH-groepen)
---vb alcoholen: hoe langer keten, hoe minder oplosbaar
-niet polaire substanties zijn onoplosbaar in water
---hydrofoob egect= de exclusie van niet-polaire substanties door water (clusteren)
---wnr toch in water, gaan zich draaien voor zo min mogelijk contact met water
-amfipatisch molecule
= hydrofobe ketens met polaire uiteinden
---vb detergenten
---wasmiddelen, reinigingsmiddelen
-(poly)amfoliet = moleculen met zowel pos als neg geladen groepen
-polyelektroliet= macromolecule met vele maar 1 type geladen groepen (vb alles pos)
-soms afhv pH (id cel 7,4 behalve in lysosomen 5; neutraal vs zuur)
DEEL 2 BIOMOLECULEN: STRUCTUUR, FUNCTIE EN ORGANISATIE ID CEL
2.1 NUCLEOTIDEN EN NUCLEÏNEZUREN
-DNA= desoxyribonucleïnezuur
-RNA= ribonucleïnezuur
-ketenvormige macromoleculen opgebouwd uit nucleotiden
-dragers van erfelijk materiaal, bewaren en geven genetische info door
-replicatie
3
, 2.1.1 Nucleotidebouwstenen: chemische structuur
-DNA vs RNA:
1) Aromatische heterocyclische basen
-purine: adenine, guanine
-pyrimidine: cytosine, thymine vs uracil
2) Suiker: pentose; deoxyribose vs ribose
3) Fosfaatgroep (geeft neg lading)
-nucleoside = base + suiker
à verbonden via glycosidische binding
-nucleotide = nucleoside + fosfaatgroep
-vb ATP (adenosine trifosfaat)
-nucleotiden kunnen UV-licht absorberen (l= 250-280 nm)
-pyrimidines en purines komen zelden voor in vrije vorm id cel
---NDP en NTP’s komen voor in cel in complex met Mg2+
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller evanme. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $10.27. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
52355 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now