Deze samenvatting combineert de aanvullende informatie die tijdens de lessen door de docent is gegeven met het handboek "Principles of Biochemistry eight edition" door David L. Nelson en Michaem M. Cox
3. aminozuren, peptiden en eiwitten
3.1 aminozuren
- chiraal (behalve Gly)
- 20 AZ basis voor eiwitten (= covalent gebonden AZ)
- L-stereoisomeren (aminogroep links) zijn per toeval meer abundant
- klassiek 5 groepen
1) apolair
- Gly G, Ala A, Pro P, Val V, Leu L, Iso I, Met M
- hydrofobe interacties
2) aromatische
- Phe F, Tyr Y, Trp W
- Trp, Tyr: absorberen licht → absorptie van eiwitten bij 280 nm
- Wet van Lambert-Beer: absorptie
log(I0/I)= epsilon*c*l
3) polair, ongeladen
- Ser S, Thr T, Cys C, Asn N, Gln Q
- meer wateroplosbaar door H-bruggen
, 4) positief geladen zijgroepen
- Lys K, His H, Arg R
5) Negatief geladen zijgroepen
- Asp D, Glu E
verder: 300 AZ niet in eiwitten: ze zijn niet proteïnogeen
- 4-hydroxyproline: afgeleid van Pro, planten CW, collageen
- Selenocysteine (Sec, U): afgeleid van serine
- Ornithine,citruline:intermediairen in arginine synthese en ureumcyclus
⇒ post-translationele modificatie
- reageren als zuren en basen
- in water ⇒ zwitterion (zowel pos als neg lading) (amfoteer of amfolyt)
pI= iso-elektrisch punt=pH waar de
nettolading 0 is
,3.2 peptiden en eiwitten
- peptide: ketens van AZ
- condensatie reactie
- N → C-terminus
(ook AZ sequentie qua naamgeving)
- verbreken peptidebinding is exotherm
- veel proteine bestaan enkel uit AZ groepen, maar sommige
- geconjugeerde proteïnen: proteïnen die een permanente associatie van een
niet-AZ groep bevatten
- niet-AZ groep = prosthetische groep
- vb: lipoproteines: lipids
- glycoproteine:suikers
- metalloproteins: metalen
3.3 werken met eiwitten (EXAMEN: methodiek kennen, met voor- en nadelen)
.eiwitten kunnen worden gescheiden en gezuiverd
- eiwitten kunnen worden gescheiden en gezuiverd
1) extractie: breken weefsels/cellen in een buffer (zodat de proteine in de cel vrijkomen)
- differentiële centrifugatie: scheiding naar densiteit
- stapsgewijze scheiding door de snelheid op te voeren (lichte en zware
fractie)
- snelheid opvoeren ⇒ zware deeltjes sedimenteren
, - kolomchromatografie
- vaste (stationaire) fase: poreuze matrix
- mobiele fase: vloeistof, beweegt door matrix
- bewegingssnelheid afh van eigenschappen
- fractioneren= scheiden eiwitmengsel in fracties
- de proteine opl vormt een band door diffusie spreiding ⇒ bandverbreding,
maar dit zorgt voor een verdunning (nadeel)
- separatie verbetert naarmate de lengte groter wordt(en ook de
verdunning is minder)
- ionenuitwisselingschromatografie
- interactie geladen eiwitten met matrix
- matrix synthetisch polymeer met geladen groepen
- kationen uitwisseling: matrix met anionen
- anionen uitwisseling: matrix met kationen
- scheiding afh van pH van opl
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller YLilla. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.69. You're not tied to anything after your purchase.
