Samenvatting is een combinatie van informatie van de hoorcolleges, de werkcolleges en het boek. De nadruk wordt gelegd op de leerdoelen die door cursuscoördinator wordt gegeven. Er worden plaatjes uit het boek en de hoorcolleges gebruikt. De belangrijkte termen zijn onderstreept en de samenvatting...
Microscopie
Lichtmicroscopie kleinste bacterien en organellen niet zichtbaar
-brightfield cel kleuringen
-fluorescentie structuur kleuringen & reporter eiwitten
Elektronenmicroscopie kleinste bacterien en organellen zichtbaar
-scanning elektronen microscoop SEM : oppervlakte cellen structuren in beeld
-transmissie elektronen microscopie TEM : binnenkant contouren van cellen structuren in beeld
Kweken
Kweken in cultuur brengen in petrischaal vloeistof
-vooraf veel informatie nodig: welke energiebronnen koolstofbronnen, nutrienten aminozuren &
a biotische omstandigheden?
-morfologie m.b.v. microscopie
-selectieve media, experimenten
-sequencing 1 soort : Sanger taxonomie + short-and long term read sequencing genoom
analyse
, Metagonics
Metagonics sequencing onafhankelijk van kweken
-isoleren DNA 1 soort of uit omgevingssample of microbioomsample
-PCR met universele primers tegen: 16S rRNA gen bacterien + ITS-Internal Transcribed
Spacer schimmels
16S ITS:
-onderdeel van rDNA wat geconserveerd is in variabele stukken: makkelijk ontwikkelen primers
-werkt bij iedere soort: gen amplificeren en sequentie bepalen + vergelijken tussen soorten
voor identificatie verwantschap
PCR twee primers + nucleotiden, Taq polymerase
1. denatureren DNA
2. binden primers
3. verlengen DNA ketens
4. herhalen
Groeicurve, generatietijd & hoeveelheid cellen in cultuur
Groeicurve:
1. lagfase: bacterien passen zich aan aan groeiomstandigheden
2. logfase: populatie groeit exponentieel
3. stationaire fase: populatie netto geen nieuwe bacterien
4. afstervingsfase: aantal bacterien neemt af
Generatietijd tijd die bacterie nodig heeft om zich te delen tijdens logfase
-berekenen door: tijd is 1 uur en aantal cellen is 4 dus 30 min per deling
Hoeveelheid cellen in cultuur bepalen:
-plaattelmethode: 1 mL monster uit oplossing en hiermee verdunningsreeks maken + tot goed
kunnen tellen maar niet te weinig + berekenen met 1: 10.000 is 32 is 320.000 + meet
levende cellen
-optische dichtheidmethode met spectrofotometer : meet levende dode cellen
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller nebark. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $5.81. You're not tied to anything after your purchase.
