Uitgebreide samenvatting van de casussen. Hierbij is elk figuur wat behandeld wordt benoemd en beschreven inclusief het plaatje van het figuur. Ook de bijbehorende conclusies zijn beschreven. De casussen zijn ook onderdeel van het tentamen.
Casus 1A: neurale buis defect
Grhl2 verlies resulteert in abnormale mesenchymale fenotypes in non neuronaal ectoderm
en neurale lijst cellen. Het verlies van neuronale ectoderm integriteit speelt een rol in het
niet kunnen bewegen naar de middenlijn van de craniale neurale vouwen, wat leidt tot
neurale buis defect. 6 NNE-expressed die downreguleerd zijn in Ghrl2 mutanten zijn
geidentificeerd. Deze zijn supressors van EMT. Dus Grhl2 promoot de epitheliale integriteit
van NNE door het activeren van epitheliale genen en het tegengaan (supressen) van EMT
m.b.v. downsteam genen (die 6 NNE-expressed genen die downgereguleerd zijn)
Figuur 1: : Je ziet doorsnedes waarbij je bij NB de neurale buis ziet en bij de pijl het NNE in
wildtype en mutant muis. Bij de mutantmuis zie je heel losmazig NNE epitheel (anders
georganiseerd). Dat is ook aangetoond met markers (ZO-1 en Vimentin). ZO-1 is een
epitheliale marker, in wildtype zie je daar veel van en in mutant zie je daar veel minder van.
Vimentin is een mesenchymale marker, daar hoort niet veel van te zijn bij het wildtype en in
de mutant zie je daar juist meer kleuring van
o Immunocytochemie = waar en wanneer komt eiwit tot expressie?
o Grhl2 gemuteerd NNE laat verlies in epitheliale integriteit (ZO-1) en verhoogde
mesenchymale eigenschappen (Vimentin) zien
, Tabel 1: de expressie van genen in
NNE vergeleken met expressie in
andere delen embryo.
o Gekleurde marker gebruikt
waardoor specifiek het NNE
geïsoleerd kon worden met
fluerescentie dus toen
hebben ze met FACS analyse
het NNE gescheiden van
andere weefsels van embryo
en toen hebben ze die 2 pools
van weefsels vergeleken
m.b.v. RNA sequencing.
Daarbij kwam Tabel 1 eruit
(lijst aan genen), dat die
verhoogd tot expressie
komen in NNE. Toen hebben
ze gekeken in literatuur
studie wat al die genen doen
en toen vonden ze 6 EMT
suppressors. In figuur 4 zie je
dat in de Grhl2 mutant deze
genen verminderd tot
expressie komen. Het idee is
dat Grhl2 deze genen
normaliter moet activeren en
de EMT onderdrukken. In de
mutant gebeurd dat niet, dus
heb je niet die onderdrukking
van EMT dus krijg je meer
mesenchym.
o Figuur 4 hoeft niet
Figuur 6: in Figuur 6 worden EMT
suppressors onderdrukt met short
hairpin RNA en dat leidt tot meer mesenchymaal achtige cellen.
o ZO-1 (epitheliaal) marker is groen, Vimentin (mesenchymaal) is rood
o Als je in de wildtype muis kijkt, zie je veel groen en geen rood.
o Als je Grhl2 onderdruk zie je minder groen en meer rood
o Zelfde geldt voor alle andere 5 EMT suppressors (meer rood en minder groen)
o Ook zie je in H tm N dat er een switch is van E-cadherine (Epitheliaal) naar N -
cadherine.
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller amckomproe. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $6.41. You're not tied to anything after your purchase.
