100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Celbiologie samenvatting college, ICT module, leerdoelen, probleemtaak en oefentoets - week 4 $3.23   Add to cart

Summary

Celbiologie samenvatting college, ICT module, leerdoelen, probleemtaak en oefentoets - week 4

 80 views  0 purchase
  • Course
  • Institution
  • Book

Celbiologie samenvatting college, ICT module, leerdoelen, probleemtaak en oefentoets - week 4

Preview 2 out of 9  pages

  • Unknown
  • July 29, 2020
  • 9
  • 2019/2020
  • Summary
avatar-seller
Week 4: Differentiatie van cellen
Baseparing bepaalt specificiteit
• Adenine-Thymine
○ 2 waterstofbruggen
• Guanine-Cytosine Binding tussen G-C is sterker dan tussen A-C
○ 3 waterstofbruggen

DNA replicatie
• De keten groeit aan het 3' uiteinde
• De synthese gaat van het 5' uiteinde richting 3' uiteinde
• De template streng wordt afgelezen van het 3' uiteinde naar het 5' uiteinde
• Begint op een vaste plaats: Origin of Replication Initation (ORI)
○ Enzymen kunnen de waterstof bruggen tussen de dubbele helices
verwijderen
○ Een hiervan is niet genoeg, soms zijn er wel een paar 100 tegelijk bezig

Synthese van DNA door DNA polymerase
• DNA polymerase heeft een proofreading activiteit
○ Maar 1 fout per 10^7 nucleotiden
• Continue en discontinue DNA synthese
○ Een helft van het DNA wordt in korte stukjes gerepliceerd, die daarna aan
elkaar worden gezet = Okazaki fragmenten
• 2 DNA polymerase-complexen werken samen

Replicatie aan het einde van een chromosoom: telomerase DNA helicase kan DNA ontbinden
• Na iedere celdeling worden een aantal nucleotide verwijderd, als dit door blijft DNA primase maakt klein stukje
gaan, zijn de DNA strengen zo 'op' RNA zonder primer
• Met telomerase wordt een klein stukje weer toegevoegd
• Na verloop van tijd, zal telomerase slechter werken, hierdoor zal de DNA toch
verslijten

Meiose of reductiedeling: cross-over tussen homologe chomosoomparen:
dubbelstrengs DNA breuken en reparatie

Vergelijking meiose en mitose
Verschil tussen DNA en RNA
• Ribose en deoxiribose
• Uracil en Thymine
○ Uracil en ribose zijn veel reactiever en makkelijker te lezen
○ DNA is dus een betere langere termijn opslag

Slechts een van de twee strengen van DNA wordt afgelezen
• De template streng is de streng die als matrijs dienst doet tijdens de synthese
• De coding streng heeft dezelfde basevolgorde als het mRNA
○ Let op! Thymine (DNA) is vervangen door Uracil (RNA)

Transcriptie start bij promoter sites en stopt bij terminator sites --> een gen is het
gebied hiertussen
• Promoters zijn specifieke DNA sequenties

In eukaryoten wordt RNA verwerkt tot rijp mRNA
• Verwijdering introns
• Toevoegen van een cap aan het 5' uiteinde
• Toevoegen van een poly(A)staart aan het 3' uiteinde TATA box in eukaryoten en
pribnow box in prokaryoten
De eiwitsynthese start bij het start codon (AUG) op het mRNA • Zorgen ervoor dat RNA
synthese altijd de goede
Ieder aminozuur wordt gekoppeld aan juiste tRNA molecuul aminoacyltransferases kant op verloopt
• tRNA aminozuur combinatie 'leest' het juiste codon met een anticodon ○ Dit wordt gedaan
omdat er soms
De beweging van het ribosoom over het mRNA en koppeling van de aminozuren twee delen zijn die
precies hetzelfde
De synthese stopt bij een stop codon op mRNA (UAA, UAG, UGA) zijn

Regulatie van de genexpressie bij bacteriën
• Voorbeeld: E. coli op lactose
○ Om lactose af te breken heeft E. coli het enzym beta-galactosidase nodig
▪ Dit enzym splitst lactose in glucose en galactose
□ Alleen in de afwezigheid van glucose en in de aanwezigheid
van lactose worden drie eiwitten voor de verwerking van
lactose in de maximale hoeveelheid gemaakt
○ Transcriptie stimuleren of: hoe voorkom je dat lactose wordt afgebroken
terwijl er glucose is
▪ Catabolite Activator Protein (CAP) kan de transcriptie van het lac
operon stimulreen alleen als het met cyclisch AMP is gebonden
▪ Als de glucose concentratie hoog is, is de cAMP concentratie laag.
▪ Als de glucose concentratie laag is, is de cAMP concentratie hoog.
□ Kataboliet repressie


CBI-10306 Pagina 1

, □ Kataboliet repressie



Bio informatica
• Gebruik van informatietechnologie om biologische en genetische informatie in
DNA en eiwitsequenties te vinden

DNA sequentiebepaling volgens de dideoxy Sanger methode


Genoom sequentie wordt opgebouwd uit overlappende kleine stukjes: 'shotgun'
sequencing
• DNA wordt in stukken van ongeveer 500 basen verdeeld waarna de sequentie
van beide strengen wordt bepaald
• Een computerprogramma zoekt de overlappende sequenties en 'plakt' ze aan
elkaar

Exonome sequencing: Dus als er een inducer aanwezig is, is er GEEN transcriptie
• Alleen de eiwit coderende gedeeltes: via PCR of direct RNA sequencing
• In ieders genoom is er een mutatie in 1 op de 30 x 10^6 nucleotiden
• We wijken van elkaar af in 1 op de 200 nucleotiden

Hoe vind je het eiwit-coderende gedeelte van een gen?
• Zoek naar de langste Open Reading Frames in je DNA sequentie
○ ORF begint met AUG/ATG en eindigt met TAA/UAA, TAG/UAG, TGA/UGA
○ Daartussen in liggen de tripletcodes van alle aminozuren zodat je (in
prokaryoten) meteen de eiwitsequentie weet
▪ In eukaryoten kan dit niet direct door de intronen

Hoe vind je de bindingsplaats van een polymerase of andere eiwitten?
• Door gezuiverd eiwit te laten binden aan DNA
• Bepalen van consensus (min of meer het dezelfde) sequenties op basis van een
groot aantal genen
• Met een consensus sequentie gaan zoeken in DNA volgordes

Polymerase Chain Reaction (PCR) wordt gebruikt om kleine hoeveelheden DNA te
amplificeren




ICT Module
• DNA
○ Opgebouwd uit vier verschillende nucleotiden: elk nucleotide bestaat uit
▪ Fosfaat
▪ Deoxyribose
▪ Base
□ Adenine
□ Guanine
□ Cytosine
□ Thymine
• RNA
○ Opgebouwd uit vier verschillende nucleotiden: elke nucleotide bestaat uit
▪ Fosfaat
▪ Ribose
▪ Base
□ Adine
□ Guanine
□ Cytosine
□ Uracil
• Peptide of polypeptide
○ Opgebouwd uit aminozuren, waarbij de restgroep verschilt
• Repeterende eenheden in de ruggengraat van het DNA polymeer
○ Fosfaat
○ Deoxyribose
• De nummering van de accenten (3' en 5') is de nummering van de atomen van het (deoxy)ribose molecuul
• Aan het 3' uiteinde van een DNA streng bevindt zich een carboxyl groep
• Bij een DNA dubbele helix loopt de ene keten van het 5'-uiteinde in de richting van het 3'-uiteinde (van links naar
rechts) en de andere keten van 3' naar 5' (van links naar rechts)




CBI-10306 Pagina 2

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller marlyverest. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $3.23. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

67096 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$3.23
  • (0)
  Add to cart