Class notes
Cel tot molecuul Thema 4 Metabolisme en enzymologie
- Course
- Institution
Volledige samenvatting van Cel tot molecuul Thema 4 Metabolisme en enzymologie.
[Show more]
Seller
Follow
sarahvink
Reviews received
Content preview
Thema 4 Metabolisme en enzymologieHC11 Ligand-eiwit binding en enzymologie
Eiwitbindingen in onze cellen
- Eiwitten binden aan andere moleculen
Soms kortdurend en zwak
Soms sterk
Ligand-eiwit binding
- Non-covalente interactie
Waterstofbruggen
Elektrostatische aantrekkingskrachten
VdWaals aantrekkingskrachten
- Soms komen moleculen samen kunnen ze één of twee non-covalente bindingen maken maar
vallen meteen weer uit elkaar door thermal motions
- Sommige perfecte match dus heel veel non-covalente binding
Als eiwit perfect past dan bindt het aan ligand
Leerdoelen
- Receptor ligand interactie
Receptor ligand kinetiek
- Enzym substraat interactie (substraat is andere naam voor een ligand van een enzym)
Michaelis Menten kinetiek
Enzym remmers
Cellulaire communicatie
- Receptoren -> afstand communiceren ->
stofjes uitscheiden
, - Pancreas beta cel -> insuline binden aan receptor spiercel -> glucose transporters naar het
membraan en glucose opnemen
Als concentratie insuline toeneemt
Meer receptoren gebonden met insuline
Alle receptoren gebonden -> maximale hoeveelheid gebonden ligand -> saturatie
bereikt
Verzadigingscurve
Wiskundig gezien -> plaatje
Afhankleijk bindingsterkte (meer rechts),
zwakker makkelijk uiteenvallen dan meer
rechts
Affiniteit -> dissociatie constante
KL-> concentratie ligand waarbij 50%
receptoren bezet -> makkelijk te zien in curve
- Ook wel dissociatie constante genoemd
Enzymen
- Biologische katalysator
Stof die biochemische reactie
kan versnellen (maken of
breken covalente bindingen)
- Ligand enzym -> substraat
- Zetten substraten op im producten
- Naam eindigd meestal op -ase
- Ongeveer 5000 verschillende enzymen
Voorbeeld enzym orotidine 5’-phosfaat decarboxylase
- Katalyseert reactie in pyrimidine biosynthese -> DNA, RNA synthese
- Mét enzym 1 reactie per milliseconde
- Zonder enyzm 1 reactie per miljoen jaar
Enzymen verlagen de activatie energie van een reactie
- Hierdoor kan reactie starten
- Verlagen activatieenergie door substraat in actieve centrum binden
Zo kan bijv twee substraten in juiste positie brengen voor reactie
Optimale omgeving reactie creeren (pH, polariteit)
Substraat ombuigen zodat een binding makkleijk verbreekt
Twee modellen van enzym substraat interactie
- Sleutel-slot model
- Induced-fit model
Als binding begint niet meteen heel sterk
Maar vormverandering plaats en binding steeds beter
, Door vormverandering activeringsenergie al gelijk verlaagd
Michaelis-menten
- Simpel model om enzym
kinetiek te beschrijven
Enzymen ook bindingsreactie
(evenwicht)
- Aan de andere kant katalyse
Reactiesnelheid -> eigenlijk hoeveel product wordt er gevormd per
tijdseenheid door enzym
- Als concentraat toeneemt enzymen binden tot saturatie ->
maximale snelheid
Vmax bepaald door hoeveelheid enzym (meer enzym kan meer
substraat binden)
Kcat -> turnovergetal van enzym -> aantal reacties per seconde
- Eigenlijk eigenschap per enzym (hoeveel reacties kan hij per minuut/seconde/etc uitvoeren)
- Carboxic anhydrase 600.000 bijv, en lysozyme 0.5 (ter illustratie
Km -> Mihaelis constante
- Concentratie substraat waarbij V is ½ max
Maar omdat katalyse reactie erachter bij uiteenvallen Kcat
- Maat affiniteit: lage Km -> hoge affiniteit
Enzym remmers
- Remmers kunnen aan enzymen binden
- Remmers van enzym die schadelijk zijn voor de cel (proteases,
breken eiwitten af, en nuclease)
Bijv. ribonuclease inhibitor -> eiwit dat ribonuclease bindt)
- Downstram producten uit een metabole pathway remmen een
enzym -> feedback inhibitie
Om te voorkomen dat D ophoopt! Remt D ook enzym 1
- Van buiten het lichaam
Gif
Persitciden
Medicijnen
Medicijnen voor jicht -> bij afbraak purines
(DNA, RNA) wordt urinezuur gevormd, slecht oplosbaar, als niet goed afgevoerd
door nieren op plekken slecht doorbloed naalden door kristallen vormen
Allopurinol -> enzymremmer -> remt xantineoxidase zodat minder
urinezuurvorming
Bekende medicijnen die werken als
enzymremmers -> zie plaatje
Soorten enzym remmers
- Irreversibele remmers
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sarahvink. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.33. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
84190 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now