Samenvatting van de colleges, gegeven in jaar 2 van medische diagnostiek. In de colleges worden de hoofdstukken: 1 t/m 10 behandeld van het boek Molecular Diagnostics van Buckingham.
Moleculaire diagnostiek 1
H1, 2 en 3
● Mendel: concept van overerving (genen en allelen) met kweekproeven van erwten
● Morgan: Ontdekking dat genen op chromosomen liggen door experiment met
fruitvliegjes
● Watson & Crick: presenteerden dubbele DNA helix (1953)
● DNA: fosfaatgroep, stikstofbase en suiker (deze drie elementen samen vormen een
nucleotide)
○ Nucleïnezuren (A, T, G en C) gebonden aan een deoxyribose
○ Fosfaat aan de 5’ koolstofatoom van het suikermolecuul
○ Stikstof aan de 1’ koolstofatoom van het suikermolecuul
○ Verschil ribose: bevat aan 2’ koolstofatoom een OH groep en deoxyribose
alleen een H
○ Pyrimidines: enkele ring (Cytosine, Uracil en Thymine)
○ Purines: dubbele ring (Guanine en adenine)
○ Backbone: uit hydroxylgroepen gebonden aan fosfaatgroepen
○ Nucleoside: Stikstofbase gebonden aan een niet- gefosforyleerde suiker
■ Adenosine, Guanosine, Cytidine en Thymidine
● Radioactieve nucleotiden
○ Fosfaatgroepen worden aangeduid met alfa, bèta of gamma
● DNA replicatie
○ Fosfodiesterbinding wordt gevormd tussen de 3’- hydroxylgroep van de
groeiende streng en de 5’- fosfaatgroep van een nieuwe nucleotide
○ Altijd een primer nodig voor DNA polymerase
○ Nucleotiden worden gekoppeld aan het 3’ einde van de streng (groeiende
streng)
■ DNA polymerase leest de template van 3’-5’, dus nieuwe streng wordt
5’-3’
■ Lagging strand: d.m.v. okazaki fragmenten
● Nucleïnezuren zijn macromoleculen bestaande uit nucleotiden
○ Twee uiteinden: 5’- fosfaatgroep en 3’- hydroxylgroep
○ Hybridisatie= vorming van waterstofbruggen tussen twee complementaire
strengen van DNA
■ Tussen A-T 2 H-bruggen
■ Tussen C-G 3 H-bruggen
○ ssDNA= single stranded DNA
○ dsDNA= double stranded DNA
● dsDNA windt zich om histonen en vormt een netwerk van nucleosomen
○ Chromatine= complex van DNA en eiwitten in de nucleus
● DNA synthese moleculen
○ Polymerase: katalyseert de vorming van een fosfodiesterbinding
○ Primase: Synthetiseert een kort RNA fragment
○ Methylase: Voegt methylgroepen toe aan stikstofbasen
1
, ○ Deaminiases: neemt aminogroepen uit stikstofbasen
○ Nucleases: knipt in het DNA
○ Ligases: katalyseert de vorming van een enkele fosfodiesterbinding
○ Helicases: verbreekt H- bruggen tussen stikstofbasen
○ Topiomerases: zorgt ervoor dat het DNA gaat uncoilen
● DNA polymerase I
○ 5’-3’ exonuclease activiteit → afbraak oude streng
○ 5’-3’ polymerase activiteit → synthese van nieuwe streng
○ 3’-5’ exonuclease activiteit → proofreading (dmv hydrolyse knipt hij
verkeerde eruit)
● Klenow fragment: bevat de 5’-3’ polymerase activiteit en 3’-5’ exonuclease activiteit
● Nick translation
○ Aantonen van gelabelde nucleotiden in het DNA
○ Er wordt een Nick gemaakt in het DNA (breuk in enkelstrengs stuk
DNA) → polymerase voegt nucleotiden toe aan het 5’ uiteinde van
een nick richting het 3’ uiteinde van een streng → door ligase wordt
Nick afgesloten
● Restrictie- enzymen
○ Exonucleases: verwijderen basen van 3’- hydroxylgroep of 5’- fosfaatgroep
van DNA strengen (knippen aan het einde)
○ Endonucleases: breekt de suiker- fosfaastbinding af, interne snijding van
DNA (knippen middenin DNA)
● Soorten knipjes
○ Sticky end en blunt end
○ Sticky ends kunnen beter worden gerecombineerd
● Het centrale dogma
○ DNA → RNA → eiwitten
● Cap van RNA dient als bescherming en herkenningssignaal voor probes van
translatie
● Intronen = niet coderend, exonen= coderend
● Aan de 3’- CCA uiteinde van het tRNA bindt een aminozuur
● Translatie
○ Cisfactoren: omvatten een bepaald gebied van DNA of RNA die genexpressie
reguleert (Silencers= remmen, enhancers= bevorderen)
○ Transfactoren: binden aan cis sequenties en stellen direct de transcriptie
complexen samen op het juiste gen
● RNAi (RNA interferentie) gen expressie regulatie:
○ MiRNA = microRNA
■ Expressie van genen reguleren, door te koppelen aan stukken
complementaire sequenties in mRNA’s en zo de translatie te remmen
■ Lengte: 20-25 nucleotiden
■ Door RNase vervormd tot hairpin
○ SiRNA = small interfering RNA
■ Functionele tussenproducten van RNA interferentie, verdediging tegen
virale invasie in eukaryoten
3
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller cheyenne_. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $3.92. You're not tied to anything after your purchase.
