100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Practicumverslag MoBi 2 $5.01
Add to cart

Other

Practicumverslag MoBi 2

 0 purchase
  • Course
  • Institution

Practicumverslag voor het vak MoBi 2

Preview 2 out of 5  pages

  • February 7, 2021
  • 5
  • 2020/2021
  • Other
  • Unknown
avatar-seller
Academiejaar 2020-2021_Online versie BMW Ba3


Instructies & verslag bij PRACTICUM II:
LEPTINE-LEPTINERECEPTOR-INTERACTIE: experimenteel deel
en literatuurstudie
VERSLAG in te dienen met deze wordfile als template na aanvullen, indienen als wordfile via
opdracht in ufora door student met naam 1.
Studenten (alfabetisch aub):

1: Over Leptine
Lees de start van de practicumnota’s: p 1-2 inleiding en doel van het practicum.
2: Dubbel DOEL en experimentele strategie
Materiaal: Practicumnota’s p 3-5 en VIDEO PII-A (over doel en strategie)
Je kiest zelf in welke richting je dit doet.
● Ofwel lees je eerst p 3-5 in de nota’s door en gebruikt de video (20 min in speed 1x) ter
vervollediging van je inzicht in de experimentele strategie.
● Ofwel bekijk je de video met de nota’s erbij en evalueer je daarna voor jezelf door nalezen
nota’s of je doel en strategie volledig doorhebt.
3: Experimentele uitvoering
Materiaal: practicumnota’s p6-7; PII-Video B
Bekijk PII-Video B samen met de nota’s (15 min in speed 1x). De video toont aan de hand van foto’s
met commentaar de stappen zoals je ze zou gezien hebben tijdens het eigenlijke experiment. Vanuit
jullie practicumervaring uit vorige jaren (e.g. Algemene Biochemie en MOBI II, sem 1 Ba 2) laat dit
hopelijk toe het practicum toch in enige mate te ‘ervaren’
Van Video A en B is ook de pdf van de ppt op ufora aanwezig


IN VERSLAG:
A. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 3.
Tijdens de incubatie in stap 3 worden bindingen (of een complex) gevormd tussen het fusie-EW
(leptine-SEAP) met de leptine-bindende domein(en) van de leptine-receptor.
B. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 6.
Tijdens het incuberen in stap 6 zullen de Co 2+-ionen, die gedragen worden door de sepharose-
parels, kunnen binden aan de poly-His-tags van de leptine-bindende receptoren.
C. Beschrijf in verslag in max. twee zinnen wat gebeurt tijdens de incubatie in stap 17.
Tijdens de incubatie in stap 17 zal het alkalisch-fosfatase enzym (aanwezig als fusie-eiwit leptine-
SEAP) het substraat para-nitrofenylfosfaat (PNF) omzetten in het gele para-nitrofenol. Dit gebeurt
enkel als leptine-SEAP gebonden is op het receptor fragment.




1

, Academiejaar 2020-2021_Online versie BMW Ba3


4: Beschrijving van resultaat
A. Beschrijf het resultaat (de waarneming) (zie Video B of pdf_videoA/B)
We detecteren een gele kleur in volgende epjes: A, D en E.
Epje A kunnen we verklaren doordat dit epje het volledig extracellulair domein van de
leptine-receptor bevat. Epje D bevat het cytokine receptor homologie domein 2 (CRH2) +
Ig. Epje E bevat het cytokine receptor homologie domein 2 (CRH2).
B. Beantwoord op basis van dit experiment: Welk(e) domein(en) van de leptine-receptor is
van belang in de interactie met leptine
Het CRH2-domein van de leptine-receptor is van belang in de interactie met het leptine-
ligand. Het Ig-domein niet, omdat deze ook aanwezig is in epje C en in dat epje geen gele
kleur gedetecteerd werd.

5. Wetenschappelijke publicatie: informatie extraheren
omtrent de kennis en modellen van de leptine-
leptinereceptorinteractie
Publicatie (zie pdf op ufora); Video PII_C (6 minuten, speed 1x)

20 years of leptin: insights into signaling assemblies of the leptin receptor.
Peelman F, Zabeau L, Moharana K, Savvides SN, Tavernier J.
J Endocrinol. 2014 Oct;223(1):T9-23. doi: 10.1530/JOE-14-0264. Epub 2014 Jul 25.

Lees de review op een gerichte wijze in functie van het oplossen van onderstaande vragen; gebruik de
verwijzingen hieronder om gericht te lezen.
Laat je vooral leiden door de aanwezige figuren (overloop deze bij start behalve Figuur 3).

Afkortingen: L: leptine; LR: leptinereceptor, ecto_LR: extracellulair deel van de leptinereceptor.

A. Bespreek de tertiaire structuur van het ligand Leptine (L).
Focus hierbij op de aanwezige secundaire structuurelementen en hun topologie en op
mogelijk extra stabilisatie van de opvouwing (geen details).
Gebruik Figuur 1 en bijhorende tekst op pagina T11.
Leptine bestaat uit vier anti-parallelle α-helices (A, B, C en D) in een up-up-down-down
schikking. Zowel tussen parallelle helices A en B als tussen de parallelle helices C en D is
er een lange lus aanwezig. De anti-parallelle helices C en D zijn verbonden met een korte
lus. De lange CD lus bevat een extra helix E. De opvouwing wordt extra gestabiliseerd
door een disulfidebrug tussen de C-terminus van helix D en de CD lus.


B. Bespreek de gekende of gemodelleerde tertiaire structuur van de domeinen van het
extracellulair deel van de Leptine receptor ecto_LR.
Beschrijf hier enkel de belangrijke secundaire structuurelementen en de topologie (geen
details). Vermeld ook algemeen het voorkomen van mogelijk extra stabilisatie van de
opvouwing en covalente modificaties (geen details!).


2

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller marievancaenegem. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $5.01. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

65040 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now

Start selling

Recently viewed by you


$5.01
  • (0)
Add to cart
Added