Samenvatting voor het vak Celbiologie I uit de 1e bachelor farmaceutische wetenschappen, van de volledige cursus van prof Claessens. Ik was er hiermee in eerste zit door.
Celbiologie cursus Claessens
H1: DNA: deoxynucleic acid
Biochemische definities van het leven
- Afgescheiden - Voortplanting - Communicatie
- Energieopname - Beweging - Moleculaire
en -verbruik - Interpretatie biologie
- Groei van prikkels
Eigenschappen zijn erfelijk: genen
- Mendel:
Overerfbare eenheden
2 gekoppelde genen
Dominant vs. Recessief of Intermediair
- Garrod
Alkaptonurie
= erfelijke stofwisselingsziekte waarbij 1 defect gen 1 defect enzyme oplevert
- Chromosomen: dragers van genen
- Differentiële ultracentrifugatie ultra: hoge g-krachten)
- Densiteitscentrifugatie verschil in dichtheid
- Griffith:
Streptococcus pneumoniae
S-stam en R-stam
Bacteriën kunnen dragers van eigenschappen uit omgeving opnemen
Erfelijke eigenschappen in DNA
- Hershey-Chase:
Bacteriofagen
E.coli
DNA bevat info over bouwstenen van bacteriofagen
Structuur van deoxyribonucleic acid
- DNA = suiker + fosfaat + basen
Deoxyribose of β-D-2-deoxyribose
Fosfaatgroepen: 5’-uiteinde
Purines (adenine, guanine) en pyrimidines (thymine, cytosine)
N-β-glycosidische binding nucleosiden
Adenosine, guanosine, cytidine, thymidine, uridine
+ fosfaatgroep nucleotiden
Fosfo-anhydridebindingen: fosfaat aan 5’C dNTPs of NTPs (ribose nt
gedeoxyleerd)
Fosfaat: α, β, γ
Fosfodiesterbindingen: tussen ribosen
- Andere belangrijke basen en nucleotiden
, Cyclische vormen van mononucleotiden: vb. cAMP = signaalmoleculen
Coenzyme A, NAD en FAD
Gemethyleerde basen en eiwitten
Donor methylgroep: S-adenosyl-methionine
AZT: inhibeert enzyme noodzakelijk voor replicatie HIV virus
Eigenschappen van DNA
- B-helix
Regels van Chargaff: relatieve hoeveelheid v/d 4 basen gelijk in genomisch DNA
van verschillende weefsels
DNA is helicaal, dubbelstrengs
Dubbele helix, anti-parallel
A ent T 2, G en C 3 H-bruggen; complementaire basen
Neg. Geladen fosfaatgroepen aan buitenkant
10,4 basenparen per winding
Grote en kleine groeve
- Stabiliteit van DNA
Groot aantal H-bruggen: hoge stabiliteit
VDW krachten
Bij T↑: A/T-rijke fragmenten smelten eerst, dan G/C-rijke
- Basenvolgorde: 5’ naar 3’
- Palindromische sequentie
- DNA bestuderen:
Absorptie en hybridisatie
Hyperchromiciteit van enkelstrengig DNA
DNA electroforese
H2: DNA replicatie
- Circulair DNA: 4,5 miljoen bp
- Haploid menselijke cel: +/- 3,3 miljard bp
Replicatie is semi-conservatief
- 1 streng v/h DNA v/d moedercel en 1 nieuw aangemaakte streng
- Aangetoond met densiteitscentrifugatie
DNA polymerasen
- DNA synthese
- Kunnen obv dNTPs DNA maken
- Bestaande 3’OH nodig
- Polymerisatie = onomkeerbaar; van 5’ naar 3’
Replicatievork
- Replicatie start thv ORI
- 2 replicatievorken
- Thv replicatievork aantal enzymen:
Helicase: strengen uit elkaar halen
, Topoisomerase I: relaxeert winding door 1 streng open te knippen
Topoisomerase II: verbreekt beide strengen in dubbele helix; superwinding
Verschillen tussen prokaryote en eukaryote topoisomerasen gebruikt voor
ontwikkeling specifieke inhibitoren
Camptothecin: anti-tumor agens dat specifiek topoisomerase I inhibeert
Single stranded binding proteins: beschermen tegen afbraak
Primase: maakt primers, 3’OH uiteinde nodig
DNA polymerase
Sliding clamp: zorgt dat polymerase met DNA geassocieerd blijft
Andere DNA polymerase
Vervanging van RNA-primers aan 5’ uiteinden van Okazaki fragmenten
3 enzymatische activiteiten:
1. 5’-3’ polymerase activiteit
2. 5’-3’ exonuclease activiteit
3. 3’-5’ exonuclease activiteit proofreading
DNA ligase: verbindt uiteinde DNA dat primer vervangt en al aangemaakte DNA
Replicatievork is asymmetrisch
- Leading strand
- Lagging strand Okazaki fragmenten
Replicatiestart
- Prokaryoten ORI’s:
+/- 250 basenparen
Rijk in A/T bp
Herhalingen in sequenties van 3x13 (13mer) en 4x9 (9mer) bp
3 eiwitten betrokken: DnaA, DnaB en DnaC
DnaA bindt 9mer meer DnaA: grote torsie 13mers denatureren
DnaC, dan DnaB zetten hierop af
6 DnaB eiwitten vormen ringstructuur met helicase activiteit
- Eukaryote ORI’s:
Menselijk genoom: +/- 3x10^4 ORIs
DNA replicatie initieert slechts 1 keer per ORI, per celcyclus
Origin Recognition Complex (ORC) = eiwitcomplex op ORI
Vroege G1 fase: cdc6 (cell division cycle) pre-replicatie-complex
S-fase specifieke cycline-dependent kinase (Cdk)
Cdk verhindert replicatiestart: dissociatie van cdc6 van ORC (fosforylering)
Einde mitose: alle Cdk activiteit stopgezet
Terminatie van de replicatie
- Prokaryoten: 2 replicatievorken lopen in elkaar over 2 DNA cirkels
- Eukaryoten: telomerase
Leading strand: op einde chromosoom komt ‘replicatie-machinery’ los
Lagging strand:
DNA keten eindigt met stukje enkelstrengig DNA zal volgende replicatie
verloren gaan
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller student1123456. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.85. You're not tied to anything after your purchase.
