Summary
Samenvatting thema 1 onderzoeksmethoden
- Course
- Institution
Samenvatting van thema 1 van het vak onderzoeksmethoden
[Show more]
Seller
Follow
BMWsamenvattingen
Reviews received
Content preview
Samenvatting onderzoeksmethoden THEMA 1Inhoudsopgave
Chemicaliën tabel.................................................................................................................................................1
Bacteriën...............................................................................................................................................................9
Antibiotica resistentie...........................................................................................................................................9
Enten...................................................................................................................................................................10
Plasmideisolatie..................................................................................................................................................10
MIC-assay...........................................................................................................................................................11
MBC-assay..........................................................................................................................................................11
Bèta-lactamase...................................................................................................................................................11
SDS-PAGE.......................................................................................................................................................12
Kapseldetectie....................................................................................................................................................13
Gramkleuring......................................................................................................................................................13
Protease-activiteit..............................................................................................................................................14
Hemolyse-bepaling.............................................................................................................................................14
Katalase-assay....................................................................................................................................................15
Acid-fast kleuring................................................................................................................................................15
Endospore kleuring.............................................................................................................................................15
Massaspectrometrie...........................................................................................................................................15
MacConkey agar.................................................................................................................................................16
Oxidase test........................................................................................................................................................16
Urease test..........................................................................................................................................................16
Indole test...........................................................................................................................................................16
ELISA...................................................................................................................................................................17
16S rRNA-amplificatie.........................................................................................................................................19
PCR-amplificatie.............................................................................................................................................19
BLAST sequencing..........................................................................................................................................20
Rifampiciline resistentiebepaling........................................................................................................................21
Genoverdracht....................................................................................................................................................21
MEGA-plate experiment................................................................................................................................22
Conjugatie......................................................................................................................................................22
Transformatie................................................................................................................................................23
Transductie....................................................................................................................................................24
Co-culturen.........................................................................................................................................................24
Fluorisentiemicroscopie......................................................................................................................................24
Confocal microscopie.....................................................................................................................................25
Chemicaliën tabel
Experiment Stof Gebruik
KAPSELDETECTIE
, Oost-Indische inkt Kleuren van de omgeving
van een (bacterie)cel
Methanol Wordt gebruikt om
preparaten te fixeren,
doordat het vrije
watermoleculen uit cellen
en weefsel weg vangt en
hierdoor zorgt voor
denaturatie van eiwit.
Fuchsine Kleuren van bacteriecellen
GRAMKLEURING
Kristalviolet Kleurt de
peptioglycaanlaag in de
bacteriële celwand.
Kristalviolet is positief
geladen en zal dus hechten
aan negatief geladen
structuren in de
peptidogycaanlaag zoals de
Teichoic acid en
lipopolysachariden
Ethanol Zorgt voor het wegspoelen
van de lipidenlaag rond
Gram-negatieve bacteriën
waardoor het kristalviolet-
jodiumcomplex wordt
weggewassen.
Fuschine Kleuren van bacteriecellen.
Het is positief geladen en
bindt dus aan negatief
geladen structuren in de
peptidogycaanlaag zoals de
Teichoic acid en
lipopolysachariden
Jodium Vormt een complex met
kristalviolet door middel
van elektrostatische
interactie, hierdoor wordt
het kristalviolet gefixeerd
in de celwand.
KATALASE ASSAY
(3%) Waterstofperoxide Wordt gebruikt om te
(H2O2) kijken of er katalase-
activiteit is. Als hier sprake
van is zal het namelijk
omgezet worden tot water
en zuurstof waarna er
gasbelvorming ontstaat.
16S RNA
PCR
, dNTP’s Bouwstenen om nieuwe
DNA-strengen op te
kunnen bouwen
Forward en reverse primers Binden aan het template-
DNA om vervolgens DNA-
polymerase te kunnen
binden.
MgCl2 Is een Co-factor voor
DNAse, het wordt gebruikt
om DNA-strengen te
kunnen synthetiseren.
Taq-polymerase DNAse die bij hoge
temperaturen kan werken
in een specifieke buffer.
Template-DNA Dit is het DNA dat
gerepliceerd moet worden.
Gelelektroforese
6x Orange G loading dye Is een kleurstof die
gebruikt wordt om te
kijken hoe snel het DNA
door de gel migreert.
Hierdoor kan dus bepaald
worden wanneer de gel
klaar is.
Ethidiumbromide Een molecuul dat bindt aan
nucleïnezuren (DNA,
RNA) en dat fluoresceert
wanneer het beschenen
wordt met UV-licht. Op
deze manier is het mogelijk
om de 16S rRNA-bandjes
in de gel te visualiseren en
dus om te controleren of je
PCR gelukt is.
PLASMIDE-CONJUGATIE
Vloeibaar LB-medium Voedingsrijk medium dat
gebruikt wordt voor
bacteriekweek.
SV-groeimedium Groeimedium dat door het
toevoegen van één
voedingsstof en één
antibioticum als
selectiemedium zal dienen.
Tijdens afgelopen
experiment is er
methionine en tetracycline
gebruikt.
Water-agar
RIFAMPICILINE
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller BMWsamenvattingen. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.28. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67474 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now