100% satisfaction guarantee Immediately available after payment Both online and in PDF No strings attached
logo-home
Biochemie 2 course 5 blok 2 volledig tentamenstof $4.36   Add to cart

Class notes

Biochemie 2 course 5 blok 2 volledig tentamenstof

 37 views  3 purchases
  • Course
  • Institution
  • Book

In deze samenvatting zit alle informatie dat vermeld is in de colleges van biochemie 2.

Preview 4 out of 42  pages

  • April 10, 2021
  • 42
  • 2020/2021
  • Class notes
  • Niels smit
  • All classes
avatar-seller
Aminozuren zijn de bouwstenen van eiwitten




Standaard vorm van aminozuren

De roze C wordt de Alpha-carbon genoemd. Het staat centraal in het molecuul, want alles zit vast aan dit
atoom. De NH2 groep heet de amino groep en de COOH groep heet de carboxyl (zuur) groep. Dit samen wordt
een aminozuur.

De restgroep is verantwoordelijk voor de variatie van aminozuren. Hoe groter de restgroep hoe minder flexibel
het aminozuur is.

Aminozuren nummeren van C-atomen

• Organisch: begin te tellen bij het eerste koolstof atoom (1,2,3,4 etc...)
• Biochemisch: begin te tellen bij het alpha carbon atoom en sla de carboxylgroep over, tel gelijk door
naar de rest groep.




Aminozuren als zwakke zuren en zwakke basen




Bij een lage pH zijn alle groepen compleet geprotoneerd. (veel H 3O- in oplossing)

Bij een neutrale pH worden er dipolar zwitterions gevormd
Bij hoge pH doneren alle groepen hun protonen. (veel H+ in de oplossing)

pKa waarde is de pH waarop de helft van de aminozuren hun H + heeft afgegeven.

pKa = -log(Ka)




1

,pKa1 is het omslagpunt waarop de carboxyl groep (COOH) zijn H + afgeeft waarna deze in COO- verandert.
pKa2 is het omslagpunt waarop de amino groep (NH3+) zijn H+ afgeeft waarna deze in NH2 verandert.




Iso-elektrisch punt




*‘’pI’’ is het iso elektrisch punt.

Op het iso-elektrische punt is:
- de netto lading 0.
- het aminozuur het minst oplosbaar in water.
- wil het aminozuur niet migreren in elektrische velden.

Voorbeeld:
Glycine heeft een pKa1 van 2.3 en een pKa2 van 9.6
(2.3 + 9.6) / 2 = 6 (pH)  = iso-elektrisch punt



pKa & lading

pKa1 van aminozuur:
De pH waarop 50% van de protonen (H+) van de COOH- groep zijn afgekapt.
R-COOH → R-COO- + H+
50% 50%

pKa2 van aminozuren:
De pH waarop 50% van de -NH2 groep is geprotoneerd.
R-NH3+ → R-NH2 + H+
50% 50%




2

,Restgroepen kunnen ook een lading hebben




Aminozuren: classificatie
Aminozuren kunnen onderverdeeld worden in vijf groepen door naar de rest groep te kijken.

• Nonpolair, aliphatisch
• Aromatisch
• Polair,ongeladen
• Positief geladen
• Negatief geladen
*Polair betekent of iets goed oplosbaar is (in water).
*Aliphatisch betekent niet-aromatisch.
*Aromatisch betekent dat de C’tjes van de restgroep in een benzeenring (6x C) liggen.




Nonpolaire, aliphatische restgroepen




Gly, Ala, Pro, Val, Leu, Ile, Met
*Glycine is de enige non-chiral amino acids.
*Chiraal betekent dat ze niet overeenkomen met hun spiegelbeeld!
*Methionine is altijd het eerste aminozuur in een eiwit (startcodon)




Aromatische restgroepen




Phe, Tyr, Trp
*Aromatische restgroepen bevatten een benzeenring.
*Tryptophaan is het enige aminozuur met een ‘dubbel ring’.
*Tyrosine is als enige polair, de andere twee zijn nonpolar (a-polair).




3

, Polaire, ongeladen restgroepen




Ser, Thr, Cys, Asn, Gln
*Deze restgroepen kunnen waterstof bruggen vormen.
*Cysteine kan disulfide bindingen vormen.




Positief geladen restgroepen




Lys, Arg, His
*Positief geladen restgroepen zijn positief geladen als de pH onder de pKr waarde is.



Negatief geladen restgroepen




Asp, Glu




4

The benefits of buying summaries with Stuvia:

Guaranteed quality through customer reviews

Guaranteed quality through customer reviews

Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.

Quick and easy check-out

Quick and easy check-out

You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.

Focus on what matters

Focus on what matters

Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!

Frequently asked questions

What do I get when I buy this document?

You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.

Satisfaction guarantee: how does it work?

Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.

Who am I buying these notes from?

Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller sammessing. Stuvia facilitates payment to the seller.

Will I be stuck with a subscription?

No, you only buy these notes for $4.36. You're not tied to anything after your purchase.

Can Stuvia be trusted?

4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)

75323 documents were sold in the last 30 days

Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now

Start selling
$4.36  3x  sold
  • (0)
  Add to cart