Summary
Samenvatting Introduction to Genetic Analysis, ISBN: 9781429276344 Genetica En Evolutie (5102GEEV6Y)
- Course
- Institution
- Book
Dit is een samenvatting van H18.1 van Introduction to Genetic Analysis
[Show more]
Connected book
Book Title:
Author(s):
- Edition:
- ISBN:
- Edition:
More summaries for
-
Summary molecular biology Practical Biological Chemistry
Seller
Follow
femkesouren
Content preview
GENETICA EN EVOLUTIEHOOFDSTUK 18
PARAGRAAF 1
Een locus = een locatie in het genoom – één enkele nucleotide of een reeks van meerdere
nucleotides
Single nucleotide polymorphisms (SNPs) = variaties waarbij er een verschil is in één nucleotidebase
Als de minst voorkomende allel met een frequentie van ongeveer 5% of hoger voorkomt, worden
SNPs ook wel common SNPs genoemd
Als de minst voorkomende allel met een frequentie van ongeveer lager dan 5% voorkomt, worden
SNPs ook wel rare SNPs genoemd
SNPs komen voor in genen; in exonen, intronen, regulatie-gebieden
SNPs in eiwitcoderende gebieden worden onderverdeeld in drie groepen:
- Synonymous – de verschillende allelen coderen voor hetzelfde aminozuur
- Nonsynonymous – de verschillende allelen coderen voor verschillende aminozuren
- Nonsense – een allel codeert voor een stopcodon en het ander allel codeert voor een
aminozuur
Noncoding SNPs = SNPs die buiten de coderende-sequentie liggen
Silent SNPs = SNPs die geen effect hebben op genfunctie en fenotype
Het bestuderen van SNP-variatie in populatie
1. Bepaal welke nucleotideplek in het genoom variabel is
2. Bepaal het genotype van verschillende individuen in de
populatie in elk SNP
DNA-microarray kan hiervoor gebruikt worden
Homozygoot rood
Homozygoot groen
Heterozygoot geel
, Microsatelliets (korte stukjes niet coderend DNA, single sequence repeats) zijn belangrijke loci voor
populatie genetica, omdat
- Het aantal allelen op een microsatelliet kan vrij hoog zijn (20 of meer)
- Ze hebben een hoge mutatie-rate – de kans op variatie is daardoor hoger –
- Ze komen vrij veel voor in de meeste genomen
Hoe groter de repeat (dus hoe meer repeats) hoe
hoger het stukje DNA op de gel is
Twee lijntjes per locus heterozygoot
Eén lijntje per locus homozygoot
Locus 1 heeft 3 verschillende allelen
Haplotype – de combinatie van allelen op meerdere loci op dezelfde chromosomale homoloog
- Twee homologe chromosomen die hetzelfde allel delen op elk van de beschouwde loci,
hebben hetzelfde haplotype
- Twee homologe chromosomen die niet hetzelfde allel delen op minimaal één van de
beschouwde loci, hebben verschillende haplotypes
verschillende manier waarop de
verschillende allelen op locus ‘a’
en locus ‘b’ verbonden kunnen
zijn
er zijn 7
chromosoomsegmenten,
maar alleen 6
verschillende haplotypes
5&6 hebben hetzelfde
haplotype
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller femkesouren. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.07. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
62890 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 14 years now