Samenvatting Biochemie, hoofdstuk 1 (J. Van Lint) + oefenvragen BMW en THK
39 views 0 purchase
Course
Biochemie En Moleculaire Biologie
Institution
Katholieke Universiteit Leuven (KU Leuven)
Samenvatting op basis van mijn notities, de slides en het boek. Achteraan zijn er een aantal oefenvragen terug te vinden die al dan niet op Sofia staan. Voor de richtingen Biomedische Wetenschappen en Tandheelkunde, deze behandelen dezelfde leerstof. :))
● Carboxylgroep ( -COOH) op c1, hieruit verder nummeren
● Alpha-koolstof waar -coo en aminogroep op staan
Niet polaire, alifatische R-groepen
= structuren die geen aromatische ring bevatten
- Inert
- Niet polair ⇒ hydrofoob = drijvende kracht waar een eiwit opvouwt
- Geen functionele groepen
● Glycine (Gly), (G)
○ Kleinste aminozuur, heeft geen zijketen, enkel H ⇒ grote conformationele
flexibiliteit in eiwitketen
○ Niet-asymmetrisch (enige az)
● Alanine (Ala), (A)
○ Zijketen: CH3
○ In Vitro Mutagenese ⇒ ‘Waar liggen de plekken in het eiwit de
kenmerken/cruciale dingen bepalen?’ = moeilijk te bepalen
■ Men steekt deze kenmerken + DNA in plasmide ⇒ hiervan kan men
codons van veranderen = bepaalde aminozuren veranderen door een
ander
■ ‘Waarom geen glycine gebruiken?’ Omdat deze structuur van eiwit
kan veranderen door flexibiliteit dus daarom op 1 na kleinste
aminozuur gebruiken
● Valine (Val), (V)
○ Restgroep: C3H7
● Leucine (Leu), (L)
○ Restgroep: C4H9
● Methionine (Met), (M)
○ Restgroep: C3H7S
, ● Isoleucine (Ile), (I)
○ Restgroep: C2H5
Ala, Val, Leu, Met en Ile:
- Dragen geen functionele groepen
- Zijketens hebben neiging te clusteren ⇒ stabilisatie eiwit tegen hydrofobe interacties
- Verschillende vormen dragen bij tot vorm eiwit door ruimte-inname
Polaire, niet-geladen R-groepen
= Polair door toevoeging van halogenen in R-groep
● Serine (Ser) (S)
○ Restgroep: CH2OH
○ Vorming van H-bruggen adhv -OH ⇒ structuur en interacties eiwitten
○ Kan gefosforyleerd worden ⇒ functie eiwit, signaaltransductie
○ Polair door -OH
● Cysteïne (Cys) (C)
○ Restgroep: CH2SH
○ SH-groep (sulfhydryl) zorgt voor polariteit
○ Pka ≈ 8, ionisatie op licht alkalische pH
○ In oxidatie 2 cys wordt door disulfidebrug verbonden tot cystine ⇒ dit kan
ook binnen eiwit wat zorgt voor stabiele 3D-structuur
○ Belangrijk binnen katalytisch centra enzymen: de ionisatie van SH zorgt voor
een sterk nucleofiele zwavelgroep = zeer reactief
● Proline (Pro) (P)
○ Restgroep: vormt ringstructuur, C3H6
○ Door ring geen vrije rotatie mogelijk tussen N en C
○ Vormen van bochten in peptideketens ⇒ meer complexiteit
○ Trans-structuur is stabieler, maar cis-structuur verschilt ook niet heel hard ⇒
bij cis ontstaat knik
○ Gematigd polair
● Asparagine (Asn) (N)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, CH2CONH2
○ Amide van asparaginezuur
○ Via zijketen H doneren/accepteren bij vorming H-bruggen
, ● Glutamine (Gln) (Q)
○ Restgroep: heeft carbonzuuramidegroep, C2H4CONH2
○ Amide van glutaminezuur
○ “
● Histidine (His) (H)
○ Restgroep: vormt ringstructuur =Imidazol ⇒ Pka ≈ 7
○ Bij fysiologische Ph is 50/50 ongeladen/geladen
○ ‘Zwitsers zakmes’ want zowel zeer nucleofiel als elektrofiel
○ Ook populair in katalytische centra door nucleofiele N
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller EmilieBMW. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $4.31. You're not tied to anything after your purchase.
