Other
samenvatting Infectie en Afweer
- Course
- Institution
Samenvatting Infectie en Afweer (deel immunologie en microbiologie, gegeven door Bruno Verhasselt en Bart Vandekerckhove)
[Show more]
Seller
Follow
gnkstudent369
Reviews received
Content preview
Infectie en afweerH1: Microbiologie in beweging
Levende wezens: 16S rRNA
3 domeinen vh leven
- Archaea
- Bacteria
- Eukarya (celkern)
Virussen: dood materiaal
- Infectieus + filtreerbaar agens
Opisthokont: dieren + planten + fungi
- Meercellig
LUCA: last universal common ancestor
Kiemtheorie van Koch
Conditionele pathogenen
- Ook bij gezonde indiv
- Ziekte afh van vatbaarheid indiv
Opportunistische infecties (veralg vermindering immuniteit)
Dysbacteriose
Samen met pathogenen in niche
Commensale bacteriën
- Metabole activiteit
- Horizontale gentransfer
Humaan metagenoom = microbioom + viroom
- Verandering evenw => vatbaarheid ziekte (oa tgv AB)
- Germ free animals
- Obesitas: microbioom darm :meer carbohydraat verwerkende enzymen
- Viroom: bacteriofagen, retrovirussen,…
Lichen = cyanobacterie + 2 schimmels (symbionten)
Pathogenen
- Altijd: bv herpes (symbiose)
- 12000j: bv pokken, mazelen, influenza (gedom dieren => mens-specifieke pathogenen)
- 100j (recent): bv legionellosis, AIDS, Lyme, E. Coli 0157:H7, H5N1 influenza, SARS, Ebola…
(tot 100% mortaliteit)
- Terugkerende: bv TBC, bof
- Virulentiefactoren => immuunevasie
1
,H2: bacteriën en virussen
Bacteriën
- Bacteria + Archaea
- Prokaryoten: geen celkern
- 1 circ chromosoom (ds DNA)
o Supercoiling
o Gyrasen + topo-isomerasen chinolonen
o Mycoplasmata: kleinste genoom
Genen voor DNA replicatie, translatie, E prod
o Typische pathogenen: grote genomen
Ook regulatie-mechanismen => transcriptie (sign transd)
- EC groei
- Celmembraan: dubbele fosfolipidenlaag
o Macromoleculen
o (glyco)proteïnen
- Celwand: macromoleculen voor contact + uitw met omg
o Gram +: peptidoglycaan (blauw)
o Gram -: peptidoglycaan + 2e lipidenmembraan: LPS (rood)
LPS = endotoxine
Lipid A + core polysaccharide + O-antigen
o Myobacteriën: mycolzuren
- Kapsel: polysaccharidenlaag ( fagocytose)
- Flagellen: bewegen
- Fimbriae: aanhechting op receptoren
- Pili: overdracht plasmiden
- Bolvormig = kok
o In kettingen: streptokokken
o In trosjes: stafylokokken
- Staafvormig = bacil
- Spore: metabool inactief
- Metabolisme
o Prod E
o Prod metabolieten
Voeding fermentatie, indust prod citroenzuur, compost
Lactobacillen: zure metabolieten (afbraak glycogeen van vag cellen)
H. Pylori: ammoniak in maagmucosa
Enzymen, eiw, toxines
Porines
Adhesiemoleculen
- Celdeling: adaptieve fase – log fase – stationaire fase – afsterven
- Invl O2 en CO2:
o Aeroob
o Anaeroob
o Capnofiel: hoge CO2-spanning
- Invl zuurtegraad
- Invl temp: optimaal 36,5°C
2
, - Operon
- Planktonisch en sessiele bact
- Persisters: minder metabool actief (ongev voor AB)
- Fenotypisch switchen = bet hedging = risicospreiding
- Fenotypische variatie: =e genoom, versch expressie
o Quorum sensing: kritische conc
o Biofilm: neg/pos beïnvloeden
- Genetische variatie: tgv mutatie, selectie, uitw
- Genetische uitwisseling:
o Transformatie: opname DNA uit omg
o Transductie: via bacteriofagen
o Conjugatie: genen op extrachromosomaal DNA (plasmiden)
o Transposons: mobiele genen
- Serotypering
o Bv meningokok: kapsel A,B,C
- Genotypering = moleculaire fingerprinting
o Specifieke DNA seq
Primers/PCR: amplicons
Knippen mbv restrictie-enzymen
Next generation sequencing
Virussen
- Infectieus
- Replicatie afh van gastheercel
o Geen celstructuur, geen organellen
- RNA of DNA, ds of ss
o Retrovirus: ss RNA => ds DNA (mbv reverse transcriptase)
o Hepadnavirus: ds DNA => ss RNA
o RNA virus
Viraal gecod RNA polymerase
Mutaties
Quasispecies
RNA => mRNA (mbv RNA afh RNA polymerase)
- Eiwitmantel: nucleocapside
o Genetisch materiaal + struct eiw + nucl zuur
- Naakt
o Resistenter
o Lyse
o Makkelijk verspreiden
o Humorale immuniteit
- Enveloppe
o Glycoprot: viraal + cellulair
o Moeilijk verspreiden
o Humorale + cellulaire immuniteit
o Detergens methode (bij pathogeeninactivatie van bloedeiw)
o Neuraminidase virussen kleven aan elkaar
- Levenscyclus
3
, o Adsorptie
Receptor – virusligand
Receptor met KH + glycoprot/lip
Bep infecteerbaarheid
Antivirale vaccins: virusligand afdekken = neutraliserende antistoffen
o Penetratie: genoom in cel
Injectie
Endocytose/membraanfusie via nucleocapside
o Uncoating
o Expressie
dsDNA als template
ssRNA (+): direct als mRNA
neg streng/ dsRNA: eerst + maken
retrovirussen als dsDNA in genoom
o replicatie
ISG: interferon stimulated genes
Tetherin neuraminidase, IFITM, PKR, cGAS RNAseL
o Virion productie: nucleoapside auto-assembly (maturatie)
o Release
Lyse: geen enveloppe
Budding: wel enveloppe
Beperken door
Receptor
Tetherin
Cel-cel transmissie
o Influenza:
Adsorptie: virus herkent siaalzuur op cel
neuraminidase
Opgenomen door endocytose
Protonen via M2 kanaal in enveloppe (endolysosoom: zuur)
Maturatie HA => fusie enveloppe en membr endosoom
Capside vrij in cytoplasma
- RNA sensors : PAMP-receptoren
o dsRNA : TLR3
o non-capped RNA : RIG-I
- DNA sensors : PAMP-receptoren
o dsDNA : TLR9
- bacteriofaag
o staart bindt met LPS => injectie genoom door buitenste membraan
o lytische cyclus
replicatie virus mbv gastheercel
lyse: dood gastheercel
o lysogene cyclus
viraal DNA in gastheer DNA: profaag
replicatie door celdeling gastheer
repressor EW faag tot expressie
o burst size: aantal vrijgelaten infectieuze viruspartikels per el
4
The benefits of buying summaries with Stuvia:
Guaranteed quality through customer reviews
Stuvia customers have reviewed more than 700,000 summaries. This how you know that you are buying the best documents.
Quick and easy check-out
You can quickly pay through credit card or Stuvia-credit for the summaries. There is no membership needed.
Focus on what matters
Your fellow students write the study notes themselves, which is why the documents are always reliable and up-to-date. This ensures you quickly get to the core!
Frequently asked questions
What do I get when I buy this document?
You get a PDF, available immediately after your purchase. The purchased document is accessible anytime, anywhere and indefinitely through your profile.
Satisfaction guarantee: how does it work?
Our satisfaction guarantee ensures that you always find a study document that suits you well. You fill out a form, and our customer service team takes care of the rest.
Who am I buying these notes from?
Stuvia is a marketplace, so you are not buying this document from us, but from seller gnkstudent369. Stuvia facilitates payment to the seller.
Will I be stuck with a subscription?
No, you only buy these notes for $7.56. You're not tied to anything after your purchase.
Can Stuvia be trusted?
4.6 stars on Google & Trustpilot (+1000 reviews)
67418 documents were sold in the last 30 days
Founded in 2010, the go-to place to buy study notes for 15 years now